5EJM
ThDP-Mn2+ complex of R413A variant of EcMenD soaked with 2-ketoglutarate for 35 min
5EJM の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb5ejm/pdb |
関連するPDBエントリー | 5EJ4 5EJ5 5EJ6 5EJ7 5EJ8 5EJ9 5EJA |
分子名称 | 2-succinyl-5-enolpyruvyl-6-hydroxy-3-cyclohexene-1-carboxylate synthase, (4~{R})-4-[3-[(4-azanyl-2-methyl-pyrimidin-5-yl)methyl]-4-methyl-5-[2-[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxyethyl]-1,3-thiazol-3-ium-2-yl]-4-oxidanyl-butanoic acid, MANGANESE (II) ION, ... (6 entities in total) |
機能のキーワード | post-decarboxylation intermediate of r413a variant of ecmend, transferase |
由来する生物種 | Escherichia coli K12 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 8 |
化学式量合計 | 496673.34 |
構造登録者 | Song, H.G.,Dong, C.,Chen, Y.Z.,Sun, Y.R.,Guo, Z.H. (登録日: 2015-11-02, 公開日: 2016-11-02, 最終更新日: 2024-03-20) |
主引用文献 | Qin, M.M.,Song, H.G.,Dai, X.,Chen, Y.Z.,Guo, Z.H. Two active site arginines are critical determinants of substrate binding and catalysis in MenD, a thiamine-dependent enzyme in menaquinone biosynthesis. Biochem. J., 2018 Cited by PubMed: 30341164DOI: 10.1042/BCJ20180548 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.72 Å) |
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