2IBK

Bypass of Major Benzopyrene-dG Adduct by Y-Family DNA Polymerase with Unique Structural Gap

2IBK の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2ibk/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2IA6
• 分子名称: 5'-D(*GP*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*GP*AP*TP*TP*AP*T)-3', 5'-D(*TP*CP*AP*TP*GP*AP*AP*TP*CP*CP*TP*TP*CP*CP*CP*CP*C)-3', DNA polymerase IV, ... (9 entities in total)
• 機能のキーワード: benzo pyrene, carcinogen, lesion bypass, polymerase, translesion synthesis, dpo4, transferase-dna complex, transferase/dna
• 由来する生物種: Sulfolobus solfataricus
• 細胞内の位置: Cytoplasm (Probable): Q97W02
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 50579.81

構造登録者

Bauer, J.,Ling, H.,Sayer, J.M.,Xing, G.,Yagi, H.,Jerina, D.M. (登録日: 2006-09-11, 公開日: 2007-09-11, 最終更新日: 2023-08-30)

• 主引用文献: Bauer, J.,Xing, G.,Yagi, H.,Sayer, J.M.,Jerina, D.M.,Ling, H.; A structural gap in Dpo4 supports mutagenic bypass of a major benzo[a]pyrene dG adduct in DNA through template misalignment.; Proc.Natl.Acad.Sci.Usa, 104:14905-14910, 2007; PubMed: 17848527; DOI: 10.1073/pnas.0700717104

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å)