2HVR

Structure of T4 RNA Ligase 2 with Nicked 5'-Adenylated nucleic acid duplex containing a 3'-deoxyribonucleotide at the nick

2HVR の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2hvr/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2HVQ 2HVS
• 分子名称: 5'-D(*AP*TP*TP*CP*CP*GP*AP*TP*AP*GP*TP*GP*GP*GP*GP*TP*CP*GP*CP*AP*AP*TP*TP*G)-3', 5'-D(*CP*AP*AP*TP*TP*GP*CP*GP*AP*C)-R(P*(OMC)P*C)-3', 5'-R(P*A)-D(P*CP*AP*CP*TP*AP*TP*CP*GP*GP*AP*AP*T)-3', ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: rna, ligase, lysine adenylate, t4, protein dna-rna complex, ligase-rna-dna complex, ligase/rna/dna
• 由来する生物種: Enterobacteria phage T4
• タンパク質・核酸の鎖数: 8
• 化学式量合計: 106163.67

構造登録者

Nandakumar, J.,Lima, C.D. (登録日: 2006-07-30, 公開日: 2006-10-17, 最終更新日: 2023-08-30)

• 主引用文献: Nandakumar, J.,Shuman, S.,Lima, C.D.; RNA Ligase Structures Reveal the Basis for RNA Specificity and Conformational Changes that Drive Ligation Forward.; Cell(Cambridge,Mass.), 127:71-84, 2006; PubMed: 17018278; DOI: 10.1016/j.cell.2006.08.038

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.45 Å)