1RRV

X-ray crystal structure of TDP-vancosaminyltransferase GtfD as a complex with TDP and the natural substrate, desvancosaminyl vancomycin.

1RRV の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb1rrv/pdb
• 関連するPDBエントリー: 1AA5 1C0Q 1C0R 1FVM 1GAC 1GHG 1PN3 1PNV 1QD8 1SHO
• 関連するBIRD辞書のPRD_ID: PRD_000205
• 分子名称: GLYCOSYLTRANSFERASE GTFD, DESVANCOSAMINYL VANCOMYCIN, POTASSIUM ION, ... (7 entities in total)
• 機能のキーワード: gt-b, glycosyltransferase, rossmann fold, glycopeptide, vacosamycin, antibiotic, transferase-antibiotic complex, transferase/antibiotic
• 由来する生物種: AMYCOLATOPSIS ORIENTALIS; 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 4
• 化学式量合計: 91630.88

構造登録者

Mulichak, A.M.,Lu, W.,Losey, H.C.,Walsh, C.T.,Garavito, R.M. (登録日: 2003-12-09, 公開日: 2004-05-18, 最終更新日: 2023-11-15)

• 主引用文献: Mulichak, A.M.,Lu, W.,Losey, H.C.,Walsh, C.T.,Garavito, R.M.; Crystal Structure of Vancosaminyltransferase Gtfd from the Vancomycin Biosynthetic Pathway: Interactions with Acceptor and Nucleotide Ligands; Biochemistry, 43:5170-, 2004; PubMed: 15122882; DOI: 10.1021/BI036130C

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2 Å)