Summary Structural details Experimental details Functional details Sequence Neighbor History Downloads

6GX2

Blood group synthase AAGlyB in complex with UDP-GalNAc and cryoprotected with glycerol

Functional Information from GO Data

Chain	GOid	namespace	contents
A	0005975	biological_process	carbohydrate metabolic process
A	0016020	cellular_component	membrane
A	0016758	molecular_function	hexosyltransferase activity

Functional Information from PDB Data

site_id	AC1
Number of Residues	4
Details	binding site for residue MN A 401

Chain	Residue
A	ASP211
A	ASP213
A	UDP402
A	HOH719

site_id	AC2
Number of Residues	20
Details	binding site for residue UDP A 402

Chain	Residue
A	ASP211
A	VAL212
A	ASP213
A	LYS346
A	HIS348
A	ARG352
A	MN401
A	GOL404
A	HOH503
A	HOH522
A	HOH533
A	HOH572
A	HOH578
A	HOH614
A	HOH719
A	PHE121
A	ILE123
A	TYR126
A	VAL184
A	ARG188

site_id	AC3
Number of Residues	9
Details	binding site for residue GOL A 403

Chain	Residue
A	HIS233
A	PHE236
A	THR245
A	TRP300
A	GLU303
A	HOH565
A	HOH568
A	HOH577
A	HOH578

site_id	AC4
Number of Residues	13
Details	binding site for residue GOL A 404

Chain	Residue
A	ARG188
A	ASP211
A	GLY267
A	ALA268
A	TRP300
A	HIS301
A	ASP302
A	GLU303
A	UDP402
A	HOH503
A	HOH676
A	HOH680
A	HOH762

site_id	AC5
Number of Residues	11
Details	binding site for residue EDO A 405

Chain	Residue
A	MET69
A	TYR71
A	ARG241
A	GLU260
A	GLY261
A	ASP262
A	LEU311
A	HOH624
A	HOH678
A	HOH740
A	HOH751

site_id	AC6
Number of Residues	8
Details	binding site for residue EDO A 406

Chain	Residue
A	TYR71
A	PRO72
A	PRO89
A	ASN101
A	HOH511
A	HOH741
A	HOH796
A	HOH827

site_id	AC7
Number of Residues	4
Details	binding site for residue EDO A 407

Chain	Residue
A	VAL70
A	TYR71
A	PRO72
A	ARG241

site_id	AC8
Number of Residues	7
Details	binding site for residue SO4 A 408

Chain	Residue
A	ARG110
A	ASN113
A	ARG146
A	THR166
A	GLY167
A	HOH517
A	HOH714

site_id	AC9
Number of Residues	4
Details	binding site for residue SO4 A 409

Chain	Residue
A	ARG176
A	TYR178
A	LYS179
A	HOH505

Functional Information from SwissProt/UniProt

site_id	SWS_FT_FI1
Number of Residues	1
Details	ACT_SITE: Nucleophile => ECO:0000250\|UniProtKB:P14769

Chain	Residue	Details
A	GLU303

site_id	SWS_FT_FI2
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZI, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R7Y, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1R81, ECO:0007744\|PDB:1R82, ECO:0007744\|PDB:1WT3, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJO, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2A8W, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:2Y7A, ECO:0007744\|PDB:3I0D, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0I, ECO:0007744\|PDB:3I0K, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	PHE121

site_id	SWS_FT_FI3
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZI, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R7Y, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1R81, ECO:0007744\|PDB:1R82, ECO:0007744\|PDB:1WT1, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1WT3, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJO, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2A8W, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:2Y7A, ECO:0007744\|PDB:3I0D, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0I, ECO:0007744\|PDB:3I0K, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	TYR126

site_id	SWS_FT_FI4
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP

Chain	Residue	Details
A	ASP211
A	ASP213

site_id	SWS_FT_FI5
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	HIS233

site_id	SWS_FT_FI6
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1R7U, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZIZ, ECO:0007744\|PDB:1ZJ0, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	THR245

site_id	SWS_FT_FI7
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1R7U, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZIZ, ECO:0007744\|PDB:1ZJ0, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	GLU303

site_id	SWS_FT_FI8
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	ASP326

site_id	SWS_FT_FI9
Number of Residues	1
Details	CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000255

Chain	Residue	Details
A	ASN113

		Sequence (fasta)
		PDBx/mmCIF
		PDBML format (no-atom)
		PDB format (full)
		Validation report (PDF)
		EDMap 2fo-fc (MTZ)