English 日本語简体中文繁體中文 한국어

✖

Menu

RCSB PDB PDBe BMRB Adv. Search Search help

Summary Structural details Experimental details Functional details Sequence Neighbor History Downloads

5M7C

Blood group synthase AAGlyB in complex with UDP and cryoprotected with PEG 3350

Functional Information from GO Data

Chain	GOid	namespace	contents
A	0005975	biological_process	carbohydrate metabolic process
A	0016020	cellular_component	membrane
A	0016758	molecular_function	hexosyltransferase activity
B	0005975	biological_process	carbohydrate metabolic process
B	0016020	cellular_component	membrane
B	0016758	molecular_function	hexosyltransferase activity

Functional Information from PDB Data

site_id	AC1
Number of Residues	4
Details	binding site for residue MN A 601

Chain	Residue
A	ASP211
A	ASP213
A	UDP602
A	HOH827

site_id	AC2
Number of Residues	16
Details	binding site for residue UDP A 602

Chain	Residue
A	ARG188
A	ASP211
A	VAL212
A	ASP213
A	LYS346
A	HIS348
A	MN601
A	HOH745
A	HOH750
A	HOH755
A	HOH827
A	PHE121
A	ALA122
A	ILE123
A	TYR126
A	VAL184

site_id	AC3
Number of Residues	4
Details	binding site for residue PEG A 603

Chain	Residue
A	ILE102
A	HIS219
A	HOH724
A	HOH787

site_id	AC4
Number of Residues	4
Details	binding site for residue PEG A 604

Chain	Residue
A	VAL70
A	TYR71
A	PRO72
B	ARG241

site_id	AC5
Number of Residues	4
Details	binding site for residue SO4 A 605

Chain	Residue
A	SER171
A	VAL172
A	HOH772
A	HOH784

site_id	AC6
Number of Residues	4
Details	binding site for residue MN B 601

Chain	Residue
B	ASP211
B	ASP213
B	UDP602
B	HOH799

site_id	AC7
Number of Residues	17
Details	binding site for residue UDP B 602

Chain	Residue
B	PHE121
B	ALA122
B	ILE123
B	TYR126
B	VAL184
B	ARG188
B	ASP211
B	VAL212
B	ASP213
B	LYS346
B	HIS348
B	ARG352
B	MN601
B	HOH712
B	HOH718
B	HOH799
B	HOH806

site_id	AC8
Number of Residues	4
Details	binding site for residue SO4 B 603

Chain	Residue
A	ARG146
B	THR166
B	GLY167
B	HOH747

Functional Information from SwissProt/UniProt

site_id	SWS_FT_FI1
Number of Residues	2
Details	ACT_SITE: Nucleophile => ECO:0000250\|UniProtKB:P14769

Chain	Residue	Details
A	GLU303
B	GLU303

site_id	SWS_FT_FI2
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZI, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R7Y, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1R81, ECO:0007744\|PDB:1R82, ECO:0007744\|PDB:1WT3, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJO, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2A8W, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:2Y7A, ECO:0007744\|PDB:3I0D, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0I, ECO:0007744\|PDB:3I0K, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	PHE121
B	PHE121

site_id	SWS_FT_FI3
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZI, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R7Y, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1R81, ECO:0007744\|PDB:1R82, ECO:0007744\|PDB:1WT1, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1WT3, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJO, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2A8W, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:2Y7A, ECO:0007744\|PDB:3I0D, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0I, ECO:0007744\|PDB:3I0K, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	TYR126
B	TYR126

site_id	SWS_FT_FI4
Number of Residues	4
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12198488, ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0000269\|PubMed:17259183, ECO:0007744\|PDB:1LZJ, ECO:0007744\|PDB:1R80, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJP, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2O1H, ECO:0007744\|PDB:2RIX, ECO:0007744\|PDB:2RJ0, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ5, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3I0F, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3IOJ, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3U0Y, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP

Chain	Residue	Details
A	ASP211
A	ASP213
B	ASP211
B	ASP213

site_id	SWS_FT_FI5
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0N, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGF, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	HIS233
B	HIS233

site_id	SWS_FT_FI6
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1R7U, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZIZ, ECO:0007744\|PDB:1ZJ0, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	THR245
B	THR245

site_id	SWS_FT_FI7
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:15475562, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1R7U, ECO:0007744\|PDB:1WT2, ECO:0007744\|PDB:1ZHJ, ECO:0007744\|PDB:1ZI3, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZIZ, ECO:0007744\|PDB:1ZJ0, ECO:0007744\|PDB:1ZJ1, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2A8U, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3I0G, ECO:0007744\|PDB:3I0L, ECO:0007744\|PDB:3IOI, ECO:0007744\|PDB:3SX3, ECO:0007744\|PDB:3SX5, ECO:0007744\|PDB:3SX7, ECO:0007744\|PDB:3SX8, ECO:0007744\|PDB:3SXA, ECO:0007744\|PDB:3SXB, ECO:0007744\|PDB:3SXC, ECO:0007744\|PDB:3SXD, ECO:0007744\|PDB:3SXE, ECO:0007744\|PDB:3SXG, ECO:0007744\|PDB:3V0L, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:3ZGG, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4FQW, ECO:0007744\|PDB:4FRA, ECO:0007744\|PDB:4FRB, ECO:0007744\|PDB:4FRD, ECO:0007744\|PDB:4FRE, ECO:0007744\|PDB:4FRH, ECO:0007744\|PDB:4FRL, ECO:0007744\|PDB:4FRM, ECO:0007744\|PDB:4FRO, ECO:0007744\|PDB:4FRP, ECO:0007744\|PDB:4FRQ, ECO:0007744\|PDB:4GBP, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	GLU303
B	GLU303

site_id	SWS_FT_FI8
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269\|PubMed:12972418, ECO:0000269\|PubMed:16326711, ECO:0007744\|PDB:1R7T, ECO:0007744\|PDB:1ZI4, ECO:0007744\|PDB:1ZI5, ECO:0007744\|PDB:1ZJ2, ECO:0007744\|PDB:1ZJ3, ECO:0007744\|PDB:2RIY, ECO:0007744\|PDB:2RJ1, ECO:0007744\|PDB:2RJ4, ECO:0007744\|PDB:2RJ6, ECO:0007744\|PDB:2RJ7, ECO:0007744\|PDB:2RJ8, ECO:0007744\|PDB:2RJ9, ECO:0007744\|PDB:3V0M, ECO:0007744\|PDB:3V0O, ECO:0007744\|PDB:3V0P, ECO:0007744\|PDB:3V0Q, ECO:0007744\|PDB:4C2S, ECO:0007744\|PDB:4KC1, ECO:0007744\|PDB:4KC2, ECO:0007744\|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	ASP326
B	ASP326

site_id	SWS_FT_FI9
Number of Residues	2
Details	CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000255

Chain	Residue	Details
A	ASN113
B	ASN113

224572

PDB entries from 2024-09-04

PDB statistics

PDBj update info

Contact PDBj

numon