4KC1

Structure of the blood group glycosyltransferase AAglyB in complex with a pyridine inhibitor as a neutral pyrophosphate surrogate

Functional Information from GO Data

Chain	GOid	namespace	contents
A	0005975	biological_process	carbohydrate metabolic process
A	0016020	cellular_component	membrane
A	0016758	molecular_function	hexosyltransferase activity

Functional Information from PDB Data

site_id	AC1
Number of Residues	5
Details	BINDING SITE FOR RESIDUE MN A 401

Chain	Residue
A	ASP213
A	WS1403
A	HOH501
A	HOH619
A	HOH735

---

site_id	AC2
Number of Residues	18
Details	BINDING SITE FOR RESIDUE BHE A 402

Chain	Residue
A	TRP300
A	GLU303
A	ASP326
A	WS1403
A	HOH583
A	HOH619
A	HOH665
A	HOH673
A	HOH719
A	HOH721
A	HOH758
A	HOH772
A	HOH786
A	HOH831
A	HIS233
A	GLY235
A	PHE236
A	THR245

---

site_id	AC3
Number of Residues	20
Details	BINDING SITE FOR RESIDUE WS1 A 403

Chain	Residue
A	PHE121
A	ALA122
A	ILE123
A	TYR126
A	VAL184
A	ARG188
A	ASP211
A	VAL212
A	ASP213
A	MN401
A	BHE402
A	HOH501
A	HOH525
A	HOH613
A	HOH619
A	HOH620
A	HOH638
A	HOH735
A	HOH831
A	HOH898

---

Functional Information from SwissProt/UniProt

site_id	SWS_FT_FI1
Number of Residues	1
Details	ACT_SITE: Nucleophile => ECO:0000250|UniProtKB:P14769

Chain	Residue	Details
A	GLU303

---

site_id	SWS_FT_FI2
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZI, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R7Y, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1R81, ECO:0007744|PDB:1R82, ECO:0007744|PDB:1WT3, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJO, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2A8W, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:2Y7A, ECO:0007744|PDB:3I0D, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0I, ECO:0007744|PDB:3I0K, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	PHE121

---

site_id	SWS_FT_FI3
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZI, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R7Y, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1R81, ECO:0007744|PDB:1R82, ECO:0007744|PDB:1WT1, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1WT3, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJO, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2A8W, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:2Y7A, ECO:0007744|PDB:3I0D, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0I, ECO:0007744|PDB:3I0K, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	TYR126

---

site_id	SWS_FT_FI4
Number of Residues	2
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12198488, ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0000269|PubMed:17259183, ECO:0007744|PDB:1LZJ, ECO:0007744|PDB:1R80, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJP, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2O1H, ECO:0007744|PDB:2RIX, ECO:0007744|PDB:2RJ0, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ5, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0F, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3IOJ, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3U0Y, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP

Chain	Residue	Details
A	ASP211
A	ASP213

---

site_id	SWS_FT_FI5
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0N, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGF, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	HIS233

---

site_id	SWS_FT_FI6
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1R7U, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZIZ, ECO:0007744|PDB:1ZJ0, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	THR245

---

site_id	SWS_FT_FI7
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:15475562, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1R7U, ECO:0007744|PDB:1WT2, ECO:0007744|PDB:1ZHJ, ECO:0007744|PDB:1ZI3, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZIZ, ECO:0007744|PDB:1ZJ0, ECO:0007744|PDB:1ZJ1, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2A8U, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3I0G, ECO:0007744|PDB:3I0L, ECO:0007744|PDB:3IOI, ECO:0007744|PDB:3SX3, ECO:0007744|PDB:3SX5, ECO:0007744|PDB:3SX7, ECO:0007744|PDB:3SX8, ECO:0007744|PDB:3SXA, ECO:0007744|PDB:3SXB, ECO:0007744|PDB:3SXC, ECO:0007744|PDB:3SXD, ECO:0007744|PDB:3SXE, ECO:0007744|PDB:3SXG, ECO:0007744|PDB:3V0L, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:3ZGG, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4FQW, ECO:0007744|PDB:4FRA, ECO:0007744|PDB:4FRB, ECO:0007744|PDB:4FRD, ECO:0007744|PDB:4FRE, ECO:0007744|PDB:4FRH, ECO:0007744|PDB:4FRL, ECO:0007744|PDB:4FRM, ECO:0007744|PDB:4FRO, ECO:0007744|PDB:4FRP, ECO:0007744|PDB:4FRQ, ECO:0007744|PDB:4GBP, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	GLU303

---

site_id	SWS_FT_FI8
Number of Residues	1
Details	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:12972418, ECO:0000269|PubMed:16326711, ECO:0007744|PDB:1R7T, ECO:0007744|PDB:1ZI4, ECO:0007744|PDB:1ZI5, ECO:0007744|PDB:1ZJ2, ECO:0007744|PDB:1ZJ3, ECO:0007744|PDB:2RIY, ECO:0007744|PDB:2RJ1, ECO:0007744|PDB:2RJ4, ECO:0007744|PDB:2RJ6, ECO:0007744|PDB:2RJ7, ECO:0007744|PDB:2RJ8, ECO:0007744|PDB:2RJ9, ECO:0007744|PDB:3V0M, ECO:0007744|PDB:3V0O, ECO:0007744|PDB:3V0P, ECO:0007744|PDB:3V0Q, ECO:0007744|PDB:4C2S, ECO:0007744|PDB:4KC1, ECO:0007744|PDB:4KC2, ECO:0007744|PDB:4KC4

Chain	Residue	Details
A	ASP326

---

site_id	SWS_FT_FI9
Number of Residues	1
Details	CARBOHYD: N-linked (GlcNAc...) asparagine => ECO:0000255

Chain	Residue	Details
A	ASN113

---