2O8M
Crystal structure of the S139A mutant of Hepatitis C Virus NS3/4A protease
GO(遺伝子オントロジー)由来の情報
鎖名 | GO(遺伝子オントロジー)id | 名前空間 | 内容 |
A | 0006508 | biological_process | proteolysis |
A | 0008236 | molecular_function | serine-type peptidase activity |
A | 0019087 | biological_process | transformation of host cell by virus |
B | 0006508 | biological_process | proteolysis |
B | 0008236 | molecular_function | serine-type peptidase activity |
B | 0019087 | biological_process | transformation of host cell by virus |
PDBデータベースに由来する情報
site_id | AC1 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 201 |
鎖名 | 残基 |
A | CYS97 |
A | CYS99 |
A | CYS145 |
A | HOH1116 |
site_id | AC2 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE ZN B 201 |
鎖名 | 残基 |
B | CYS97 |
B | CYS99 |
B | CYS145 |
B | HOH292 |
site_id | AC3 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE NA C 1001 |
鎖名 | 残基 |
A | HOH1022 |
C | LEU231 |
C | GLY233 |
C | HOH1002 |
A | THR4 |
site_id | AC4 |
残基数 | 5 |
詳細 | BINDING SITE FOR RESIDUE NA A 1002 |
鎖名 | 残基 |
A | ALA5 |
A | ALA111 |
A | HOH1008 |
A | HOH1024 |
B | HOH246 |
SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報
site_id | SWS_FT_FI1 |
残基数 | 2 |
詳細 | ACT_SITE: Charge relay system; for serine protease NS3 activity => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01166, ECO:0000269|PubMed:8386278, ECO:0000305|PubMed:8861917 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | HIS57 | |
B | HIS57 |
site_id | SWS_FT_FI2 |
残基数 | 2 |
詳細 | ACT_SITE: Charge relay system; for serine protease NS3 activity => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01166, ECO:0000305|PubMed:8861917 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASP81 | |
B | ASP81 |
site_id | SWS_FT_FI3 |
残基数 | 2 |
詳細 | ACT_SITE: Charge relay system; for serine protease NS3 activity => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01166, ECO:0000269|PubMed:8248148, ECO:0000269|PubMed:8386278, ECO:0000305|PubMed:8861917 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ALA139 | |
B | ALA139 |
site_id | SWS_FT_FI4 |
残基数 | 4 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01166, ECO:0000269|PubMed:21507982, ECO:0007744|PDB:1A1R, ECO:0007744|PDB:1N1L, ECO:0007744|PDB:1RGQ, ECO:0007744|PDB:2A4R, ECO:0007744|PDB:2F9V, ECO:0007744|PDB:2O8M, ECO:0007744|PDB:2OBQ, ECO:0007744|PDB:2OC0, ECO:0007744|PDB:2OC1, ECO:0007744|PDB:2OC7, ECO:0007744|PDB:2OC8, ECO:0007744|PDB:2OIN, ECO:0007744|PDB:2XNI |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | CYS97 | |
A | CYS99 | |
B | CYS97 | |
B | CYS99 |
site_id | SWS_FT_FI5 |
残基数 | 2 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01166, ECO:0000269|PubMed:21507982, ECO:0007744|PDB:1N1L, ECO:0007744|PDB:1RGQ, ECO:0007744|PDB:2A4R, ECO:0007744|PDB:2F9V, ECO:0007744|PDB:2O8M, ECO:0007744|PDB:2OBQ, ECO:0007744|PDB:2OC0, ECO:0007744|PDB:2OC1, ECO:0007744|PDB:2OC7, ECO:0007744|PDB:2OC8, ECO:0007744|PDB:2OIN, ECO:0007744|PDB:2XNI |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | CYS145 | |
B | CYS145 |
site_id | SWS_FT_FI6 |
残基数 | 2 |
詳細 | BINDING: BINDING => ECO:0000255|PROSITE-ProRule:PRU01166, ECO:0000269|PubMed:21507982 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | HIS149 | |
B | HIS149 |
CSAにおける酵素触媒機能の情報
site_id | CSA1 |
残基数 | 4 |
詳細 | Annotated By Reference To The Literature 1rgq |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | ASP81 | |
A | ALA139 | |
A | GLY137 | |
A | HIS57 |
site_id | CSA2 |
残基数 | 4 |
詳細 | Annotated By Reference To The Literature 1rgq |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | ASP81 | |
B | ALA139 | |
B | GLY137 | |
B | HIS57 |
site_id | MCSA1 |
残基数 | 4 |
詳細 | M-CSA 776 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
A | HIS57 | proton shuttle (general acid/base) |
A | ASP81 | electrostatic stabiliser |
A | GLY137 | electrostatic stabiliser |
A | ALA139 | covalently attached, electrostatic stabiliser |
site_id | MCSA2 |
残基数 | 4 |
詳細 | M-CSA 776 |
鎖名 | 残基 | 詳細 |
B | HIS57 | proton shuttle (general acid/base) |
B | ASP81 | electrostatic stabiliser |
B | GLY137 | electrostatic stabiliser |
B | ALA139 | covalently attached, electrostatic stabiliser |