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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5g6v | ||||||
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タイトル | Crystal structure of the PCTAIRE1 kinase in complex with inhibitor | ||||||
![]() | CYCLIN-DEPENDENT KINASE 16![]() | ||||||
![]() | ![]() | ||||||
機能・相同性 | ![]() growth hormone secretion / regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus / ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Dixon-Clarke, S.E. / Galan Bartual, S. / Elkins, J. / Savitsky, P. / Kopec, J. / Mackenzie, A. / Tallant, C. / Heroven, C. / Burgess-Brown, N. / von Delft, F. ...Dixon-Clarke, S.E. / Galan Bartual, S. / Elkins, J. / Savitsky, P. / Kopec, J. / Mackenzie, A. / Tallant, C. / Heroven, C. / Burgess-Brown, N. / von Delft, F. / Arrowsmith, C.H. / Edwards, A.M. / Bountra, C. / Bullock, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of the Pctaire1 Kinase in Complex with Inhibitor 著者: Dixon-Clarke, S.E. / Shehata, S. / Sakamoto, K. / Bullock, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 134.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 111.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 507.8 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 510.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 26.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域:
NCS oper:
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要素
#1: タンパク質 | ![]() 分子量: 37308.789 Da / 分子数: 2 / 断片: KINASE DOMAIN, RESIDUES 163-478 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 参照: UniProt: Q00536, ![]() #2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-EDO / ![]() #4: 水 | ChemComp-HOH / | ![]() 配列の詳細 | ENGINEERED | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.44 Å3/Da / 溶媒含有率: 49.51 % / 解説: NONE |
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結晶化![]() | pH: 5.5 詳細: 25% PEG MEDIUM SMEAR (PEG 2000, PEG 3350, PEG 4000, PEG 5000MME) AND 0.1 M CITRATE PH 5.5 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS / 検出器: PIXEL / 日付: 2015年3月6日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長![]() |
反射 | 解像度: 2.2→28.98 Å / Num. obs: 37175 / % possible obs: 98.3 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 5.2 % / Rmerge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 9.4 |
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解析
ソフトウェア | 名称: REFMAC / バージョン: 5.8.0155 / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 構造決定の手法![]() ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 40.421 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.2→86.94 Å
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拘束条件 |
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