DNA BINDING PROTEIN (DNA結合タンパク質) / RecA / PriA (プエルトリコ) / winged-helix / helicase (ヘリカーゼ)
機能・相同性
機能・相同性情報
primosome complex / DNA replication, synthesis of primer / DNA unwinding involved in DNA replication / DNA helicase activity / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; 酸無水物に作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / hydrolase activity / DNA binding / zinc ion binding / ATP binding 類似検索 - 分子機能
PriA, 3(prime) DNA-binding domain / : / Primosomal protein N'-like, winged helix / Primosomal protein N' / PriA DNA helicase, Cys-rich region (CRR) domain / Primosomal protein N', 3' DNA-binding domain / Primosomal protein N, C-terminal domain / Primosomal protein N', 3' DNA-binding domain superfamily / 3'DNA-binding domain (3'BD) / Primosomal protein N C-terminal domain ...PriA, 3(prime) DNA-binding domain / : / Primosomal protein N'-like, winged helix / Primosomal protein N' / PriA DNA helicase, Cys-rich region (CRR) domain / Primosomal protein N', 3' DNA-binding domain / Primosomal protein N, C-terminal domain / Primosomal protein N', 3' DNA-binding domain superfamily / 3'DNA-binding domain (3'BD) / Primosomal protein N C-terminal domain / PriA DNA helicase Cys-rich region (CRR) domain / GIY-YIG endonuclease / DEAD/DEAH box helicase / DEAD/DEAH box helicase domain / Helicase conserved C-terminal domain / helicase superfamily c-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / ロスマンフォールド / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / Primosomal protein N' 類似検索 - 構成要素
解像度: 2.65→2.7 Å / 冗長度: 7.1 % / Mean I/σ(I) obs: 2.34 / Rsym value: 0.838 / % possible all: 100
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
ADSC
Quantum
データ収集
SHARP
位相決定
REFMAC
5.7.0032
精密化
HKL-2000
データ削減
HKL-2000
データスケーリング
精密化
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 2.65→35.14 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.946 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.919 / SU B: 24.056 / SU ML: 0.27 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.789 / ESU R Free: 0.321 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.25401
1342
5 %
RANDOM
Rwork
0.21763
-
-
-
obs
0.21957
25249
99.95 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK