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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2onk | ||||||
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タイトル | ABC transporter ModBC in complex with its binding protein ModA | ||||||
要素 |
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キーワード | MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 ABC-type tungstate transporter / ABC-type tungstate transporter activity / tungstate binding / transmembrane transport / membrane => GO:0016020 / ATP hydrolysis activity / ATP binding / metal ion binding / 細胞膜 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Archaeoglobus fulgidus (アルカエオグロブス属) | ||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 3.1 Å | ||||||
データ登録者 | Hollenstein, K. / Frei, D.C. / Locher, K.P. | ||||||
引用 | ジャーナル: Nature / 年: 2007 タイトル: Structure of an ABC transporter in complex with its binding protein. 著者: Hollenstein, K. / Frei, D.C. / Locher, K.P. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2onk.cif.gz | 457.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2onk.ent.gz | 379.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2onk.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/on/2onk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/on/2onk | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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単位格子 |
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-要素
-Molybdate/tungstate ABC transporter, ... , 2種, 8分子 ABFGCDHI
#1: タンパク質 | 分子量: 27069.809 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Archaeoglobus fulgidus (アルカエオグロブス属) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O30144 #2: タンパク質 | 分子量: 30643.141 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Archaeoglobus fulgidus (アルカエオグロブス属) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O30143 |
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-タンパク質 , 1種, 2分子 EJ
#3: タンパク質 | 分子量: 35717.785 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) Archaeoglobus fulgidus (アルカエオグロブス属) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O30142 |
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-非ポリマー , 3種, 12分子
#4: 化合物 | ChemComp-PO4 / #5: 化合物 | ChemComp-MG / #6: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 4.12 Å3/Da / 溶媒含有率: 70.17 % |
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-データ収集
放射光源 | 由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06SA |
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放射 | プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.1→30 Å / Num. obs: 88979 |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: 多波長異常分散 / 解像度: 3.1→30 Å / σ(F): 0
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溶媒の処理 | Bsol: 48.43 Å2 | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 99.93 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.1→30 Å
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Xplor file |
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