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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1est | ||||||
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タイトル | THE ATOMIC STRUCTURE OF CRYSTALLINE PORCINE PANCREATIC ELASTASE AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION. COMPARISONS WITH THE STRUCTURE OF ALPHA-CHYMOTRYPSIN | ||||||
要素 | PORCINE PANCREATIC ELASTASE | ||||||
キーワード | HYDROLASE / HYDROLASE (SERINE PROTEINASE) | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 pancreatic elastase / serine-type endopeptidase activity / proteolysis / extracellular space / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Sus scrofa (ブタ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.5 Å | ||||||
データ登録者 | Sawyer, L. / Shotton, D.M. / Watson, H.C. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1978 タイトル: The atomic structure of crystalline porcine pancreatic elastase at 2.5 A resolution: comparisons with the structure of alpha-chymotrypsin. 著者: Sawyer, L. / Shotton, D.M. / Campbell, J.W. / Wendell, P.L. / Muirhead, H. / Watson, H.C. / Diamond, R. / Ladner, R.C. #1: ジャーナル: Biochem.Biophys.Res.Commun. / 年: 1973 タイトル: Atomic Coordinates for Tosyl-Elastase 著者: Sawyer, L. / Shotton, D.M. / Watson, H.C. #2: ジャーナル: Nature / 年: 1970 タイトル: Amino-Acid Sequence of Porcine Pancreatic Elastase and its Homologies with Other Serine Proteinases 著者: Shotton, D.M. / Hartley, B.S. #3: ジャーナル: Nature / 年: 1970 タイトル: Three-Dimensional Fourier Synthesis of Tosyl-Elastase at 3.5 Angstroms Resolution 著者: Watson, H.C. / Shotton, D.M. / Cox, J.M. / Muirhead, H. #4: ジャーナル: Nature / 年: 1970 タイトル: Three Dimensional Structure of Tosyl-Elastase 著者: Shotton, D.M. / Watson, H.C. | ||||||
履歴 |
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Remark 700 | SHEET THE TWO SEVEN STRANDED SHEETS IN THIS STRUCTURE ARE REALLY SIX STRANDED BETA BARRELS - THIS ...SHEET THE TWO SEVEN STRANDED SHEETS IN THIS STRUCTURE ARE REALLY SIX STRANDED BETA BARRELS - THIS IS DENOTED BY THE FIRST STRAND RECURRING AS THE LAST STRAND. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1est.cif.gz | 53.8 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1est.ent.gz | 37.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1est.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1est_validation.pdf.gz | 393.9 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1est_full_validation.pdf.gz | 402.2 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1est_validation.xml.gz | 7 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1est_validation.cif.gz | 10 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/es/1est ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/es/1est | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUE SER 195 (THE CATALYTICALLY ACTIVE SERINE ) HAS BEEN TOSYLATED IN THIS STRUCTURE. COORDINATES FOR THE TOSYL GROUP ARE GIVEN IN THE HETATM RECORDS BELOW. |
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25928.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: P00772, pancreatic elastase |
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#2: 化合物 | ChemComp-SO4 / |
#3: 化合物 | ChemComp-TSU / |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.17 Å3/Da / 溶媒含有率: 43.42 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 2 ℃ / pH: 5 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
-解析
精密化 | 最高解像度: 2.5 Å 詳細: COORDINATES FOR THE 27 WATER MOLECULES AND 1 SULPHATE ION WERE TAKEN FROM THE ARTICLE CITED AS REFERENCE 1. | ||||||||||||
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 2.5 Å
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