PDB-7nou: Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis ArgF in complex w...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7nou

タイトル

Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis ArgF in complex with (3,5-dichlorophenyl)boronic acid.

要素

Ornithine carbamoyltransferase

キーワード

TRANSFERASE / ArgF / Ornithine Carbamoyltransferase

機能・相同性

機能・相同性情報

ornithine carbamoyltransferase / ornithine carbamoyltransferase activity / arginine biosynthetic process via ornithine / citrulline biosynthetic process / arginine biosynthetic process / amino acid binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Mycobacterium tuberculosis H37Rv (結核菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.98 Å

データ登録者

Mendes, V. / Gupta, P. / Burgess, A. / Sebastian-Perez, V. / Cattermole, E. / Meghir, C. / Blundell, T.L.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Comput Struct Biotechnol J / 年: 2021
タイトル: A fragment-based approach to assess the ligandability of ArgB, ArgC, ArgD and ArgF in the L-arginine biosynthetic pathway of Mycobacterium tuberculosis
著者: Gupta, P. / Thomas, S.E. / Zaidan, S.A. / Pasillas, M.A. / Cory-Wright, J. / Sebastian-Perez, V. / Burgess, A. / Cattermole, E. / Meghir, C. / Abell, C. / Coyne, A.G. / Jacobs, W.R. / ...

履歴

登録	2021年2月25日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2021年6月30日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月31日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7nou.cif.gz	696.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7nou.ent.gz	577.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7nou.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	7nou_validation.pdf.gz	3.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	7nou_full_validation.pdf.gz	3.3 MB	表示
XML形式データ	7nou_validation.xml.gz	70.2 KB	表示
CIF形式データ	7nou_validation.cif.gz	102.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/no/7nou ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/no/7nou	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7nlfC 7nlnC 7nloC 7nlpC 7nlqC 7nlrC 7nlsC 7nltC 7nluC 7nlwC 7nlxC 7nlyC 7nlzC 7nm0C 7nn1C 7nn4C 7nn7C 7nn8C 7nnbC 7nncC 7nnfC 7nniC 7nnqC 7nnrC 7nnvC 7nnwC 7nnyC 7nnzC 7norC 7nosC 7notC 7novC 7np0C 7nphC 7npjC 2p2gS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	7nny-2 7nos-1 7nor-2 7nov-1 7nnw-2 7nnw-1 7nov-2 6jl6-2 7nou-2 2i6u-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#215 - 2017年11月アスパラギン酸カルバモイル転移酵素 (Aspartate Transcarbamoylase) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Ornithine carbamoyltransferase

B: Ornithine carbamoyltransferase

C: Ornithine carbamoyltransferase

D: Ornithine carbamoyltransferase

E: Ornithine carbamoyltransferase

F: Ornithine carbamoyltransferase

ヘテロ分子

202 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Ornithine carbamoyltransferase

B: Ornithine carbamoyltransferase

C: Ornithine carbamoyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
101 kDa, 3 ポリマー
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2

D: Ornithine carbamoyltransferase

E: Ornithine carbamoyltransferase

F: Ornithine carbamoyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
101 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	92.299, 144.662, 97.756
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 117.800, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Ornithine carbamoyltransferase / OTCase 分子量: 33208.324 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis H37Rv (結核菌) 遺伝子: argF, Rv1656, MTCY06H11.21 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P9WIT9, ornithine carbamoyltransferase
#2: 化合物	ChemComp-NMR / [3,5-bis(chloranyl)phenyl]-oxidanyl-oxidanylidene-boron 分子量: 189.812 Da / 分子数: 11 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₄BCl₂O₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1001 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.9 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.55 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法詳細: 150 mM ammonium dihydrogen phosphate 10 mM praseodymium acetate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ESRF

/ ビームライン: ID30B / 波長: 0.97625 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年8月29日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97625 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.98→86.47 Å / Num. obs: 157930 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 10.2 % / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.087 / R_pim(I) all: 0.028 / R_rim(I) all: 0.091 / Net I/σ(I): 16.1 / Num. measured all: 1604954 / Scaling rejects: 531

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. measured all	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Net I/σ(I) obs	% possible all
1.98-2.08	10	0.937	230134	23055	0.801	0.309	0.988	2.7	100
6.25-86.47	9.5	0.048	48422	5089	0.998	0.016	0.05	41.5	99.7

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	8.03 Å	86.47 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.18.2	精密化
Aimless	0.7.1	データスケーリング
PHASER	2.8.3	位相決定
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
XDS		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 2P2G

2p2g

解像度: 1.98→86.47 Å / SU ML: 0.2 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 20.21 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2009	8007	5.07 %
R_work	0.1745	149849	-
obs	0.1759	157856	99.9 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 119.9 Å² / B_iso mean: 43.3589 Å² / B_iso min: 20.82 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.98→86.47 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13480	0	141	1001	14622
B_iso mean	-	-	54.75	48.33	-
残基数	-	-	-	-	1801

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.98-2	0.2997	280	0.2646	4992	5272	100
2-2.02	0.2705	260	0.248	4951	5211	100
2.02-2.05	0.2614	261	0.2376	5036	5297	100
2.05-2.07	0.2593	296	0.2307	4910	5206	100
2.07-2.1	0.2818	283	0.2244	4976	5259	100
2.1-2.13	0.2437	216	0.2117	5047	5263	100
2.13-2.16	0.2606	270	0.2091	4971	5241	100
2.16-2.19	0.2251	291	0.2005	4983	5274	100
2.19-2.23	0.2504	286	0.1979	4929	5215	100
2.23-2.26	0.2817	261	0.2433	4943	5204	99
2.26-2.3	0.2242	273	0.2009	4994	5267	100
2.3-2.34	0.2424	282	0.195	4963	5245	100
2.34-2.39	0.2203	262	0.1878	4995	5257	100
2.39-2.44	0.1982	274	0.1755	4982	5256	100
2.44-2.49	0.2141	290	0.1809	4955	5245	100
2.49-2.55	0.2179	254	0.1807	5011	5265	100
2.55-2.61	0.2084	216	0.1759	5022	5238	100
2.61-2.68	0.201	286	0.1736	4994	5280	100
2.68-2.76	0.2168	228	0.1845	5022	5250	100
2.76-2.85	0.2053	291	0.1892	4967	5258	100
2.85-2.95	0.2098	257	0.1839	5020	5277	100
2.95-3.07	0.2249	233	0.1861	5070	5303	100
3.07-3.21	0.2272	236	0.1797	4990	5226	100
3.21-3.38	0.1948	299	0.1798	4969	5268	100
3.38-3.59	0.1962	268	0.1716	5001	5269	100
3.59-3.87	0.1958	242	0.1593	5046	5288	100
3.87-4.26	0.1672	259	0.1423	5038	5297	100
4.26-4.88	0.1612	298	0.1395	4990	5288	100
4.88-6.14	0.1817	280	0.1658	5012	5292	100
6.14-86.47	0.1722	275	0.1608	5070	5345	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.8884	-0.6886	0.0043	1.9224	0.1268	1.3245	-0.0476	-0.0912	0.1147	0.0999	0.0443	-0.0425	-0.0605	0.0945	-0.0183	0.2369	-0.008	-0.015	0.2325	-0.0266	0.2539	0.3118	-4.909	-41.3284
2	1.6253	0.717	-0.1419	2.426	-0.9124	0.5555	-0.1822	0.6048	-0.3313	-0.741	0.2671	-0.1655	0.0243	-0.1022	-0.0858	0.4646	-0.0427	-0.003	0.4453	-0.0817	0.3195	-5.5096	5.2125	-55.6854
3	1.5891	-0.5348	-0.3492	1.4544	0.4241	0.7658	-0.0228	0.0896	-0.0085	-0.0944	-0.0234	-0.168	0.011	0.0911	0.0166	0.2244	-0.0133	-0.0002	0.2771	-0.0239	0.2609	6.9954	-10.2505	-48.471
4	1.5301	0.3874	-0.3716	1.8718	0.5754	2.2307	-0.1368	0.0517	-0.1164	-0.0726	0.1122	-0.2247	0.1083	0.2015	0.0157	0.2221	0.0178	0.0379	0.2842	-0.017	0.3378	14.2309	-22.8729	-53.2229
5	1.0933	-1.1277	-0.9697	2.3098	0.6182	1.3266	-0.1368	-0.0857	-0.1987	0.2095	-0.0018	-0.0112	0.2171	-0.0907	0.0763	0.2355	-0.0084	0.0056	0.2832	-0.0167	0.3001	2.1356	-20.0281	-43.1421
6	3.1916	-0.1599	0.5341	1.8008	0.2602	1.3786	0.024	-0.3551	-0.9373	0.1753	-0.0241	0.097	0.1306	-0.1545	-0.012	0.2033	-0.0458	0.0209	0.3299	0.0971	0.5669	-27.9224	-13.9587	-38.3639
7	1.3378	-1.1322	-0.1752	1.5983	-0.3057	0.5893	0.2256	0.4708	-0.5486	-0.5713	0.0139	0.2964	0.4497	-0.128	-0.1657	0.4332	-0.0259	-0.065	0.4977	-0.0498	0.6004	-12.9067	-19.2346	-48.198
8	4.3927	1.0227	0.8579	1.4984	0.8734	1.6096	-0.0572	0.5706	-1.3514	-0.1655	-0.106	0.2684	-0.0982	-0.1663	0.1236	0.1202	-0.0575	-0.0134	0.3806	-0.1306	1.0065	-42.8598	-20.3607	-48.5339
9	2.4759	-0.1083	0.2693	2.1517	0.2494	2.0796	0.2052	-0.6223	-0.8087	0.0036	0.0805	0.3736	0.0217	-0.1774	0.0705	0.2561	-0.053	0.0094	0.3914	0.1072	0.5502	-32.2384	-12.4126	-38.0744
10	2.057	-0.0935	-0.2489	2.1983	-0.2965	1.4578	0.0172	-0.0852	-0.0293	-0.0372	-0.0373	0.2933	-0.1898	-0.129	0.0395	0.2604	0.0107	-0.0212	0.2653	-0.0209	0.2432	-21.9454	13.6214	-47.3451
11	2.7985	0.3322	-0.0622	1.2793	-0.66	0.5198	-0.0476	0.5818	-0.0324	-0.6815	0.012	0.2153	0.0854	-0.3216	0.0444	0.4447	-0.0049	-0.0736	0.3904	-0.008	0.4121	-31.7042	-1.0025	-53.5849
12	1.3276	0.4635	-0.1393	1.6497	-0.8262	1.0911	-0.059	0.1698	0.0631	-0.3019	0.0298	0.2652	-0.0213	-0.1119	0.0323	0.3491	0.0115	-0.0526	0.2772	-0.0255	0.2997	-23.2196	17.9468	-57.5499
13	1.4501	0.5064	0.0241	1.0135	-0.3335	2.6402	-0.0776	0.2707	0.2138	-0.2748	0.1108	0.1972	-0.2785	-0.1549	-0.0086	0.4378	-0.0117	-0.0702	0.2971	0.0608	0.2995	-18.0162	26.3548	-68.9129
14	1.1484	0.6664	-0.4795	1.3527	-1.1232	2.2692	0.0304	0.0197	0.0369	-0.003	-0.071	-0.1103	-0.1893	0.2342	0.0439	0.3472	-0.0167	-0.0404	0.2738	-0.0159	0.2705	-11.1374	19.7847	-56.1528
15	1.8317	-0.7307	-0.4619	1.4319	0.1641	1.2655	-0.1127	0.1226	-0.0086	0.1335	0.0772	-0.0083	-0.244	-0.1945	0.0291	0.3791	0.1096	0.0178	0.3881	0.0591	0.2481	-22.1118	21.7248	-21.413
16	1.8881	-0.9898	-0.1236	1.1675	0.3695	0.8437	-0.1978	-0.2792	0.318	0.363	0.2227	-0.1252	-0.2515	-0.1352	-0.028	0.5121	0.1366	-0.0315	0.3937	0.0517	0.2853	-16.9432	25.9778	-14.0026
17	2.5008	-0.5604	-0.4602	1.6121	0.6554	1.5713	-0.0294	-0.1674	0.1049	0.2394	0.0524	0.2399	-0.1969	-0.1706	0.0029	0.5135	0.2296	0.0854	0.4499	0.1149	0.3354	-39.526	35.3854	-11.415
18	2.9239	-0.261	-0.6233	1.7629	0.2026	1.8428	0.2682	0.1819	0.1657	0.2088	0.049	0.1358	-0.3623	-0.3071	-0.1152	0.4013	0.1383	0.0437	0.4404	0.0741	0.2688	-26.624	21.9049	-22.1382
19	1.365	-0.14	-0.2381	2.7014	-1.1059	1.7557	0.0327	0.0442	0.1163	0.2198	0.1029	0.247	-0.1398	-0.5316	-0.1253	0.3258	0.0078	0.0107	0.4315	0.0667	0.3133	-29.6173	-0.842	-9.483
20	1.1368	0.2798	-0.4002	1.2755	-1.1515	3.0429	-0.0936	0.0789	-0.0465	-0.1457	0.0493	0.0867	0.4651	-0.1864	0.0668	0.3636	-0.0679	0.0324	0.2883	-0.0002	0.3243	-26.3764	-18.3633	2.1577
21	1.8109	-0.7264	0.2613	1.3583	0.1127	1.7255	-0.132	0.0956	-0.3428	-0.0285	0.1469	-0.1825	0.1312	0.2532	-0.0574	0.3372	-0.0133	0.0206	0.309	-0.0342	0.3564	9.4405	0.9509	-16.9307
22	1.7202	-0.3037	-0.089	1.4305	-0.2875	2.8123	-0.0446	-0.0357	-0.0311	-0.1447	0.1423	0.1662	0.0613	0.1958	-0.1023	0.2858	0.014	0.0233	0.2949	0.0285	0.2402	-6.2037	2.9512	-15.3334
23	0.6826	0.519	0.2967	1.9519	-0.0931	0.0633	0.0262	-0.4382	-0.0711	0.589	0.0196	0.1031	-0.2994	-0.2346	-0.0128	0.4313	0.045	0.0508	0.4477	0.0347	0.2884	-8.1504	4.8689	-6.7579
24	1.4676	0.5998	-0.7574	0.7257	-0.4718	0.3638	0.083	-0.5626	-0.4525	0.1707	-0.2215	-0.2805	0.1486	0.2581	0.1033	0.4476	0.0422	0.0362	0.4152	0.0886	0.3329	-2.4432	-4.9311	-2.4384
25	1.4739	0.518	0.4471	1.2974	0.4392	1.2624	-0.1315	0.0418	-0.0644	0.0858	0.1036	-0.1004	-0.4096	0.1893	0.0517	0.3545	-0.022	-0.0085	0.2908	0.0201	0.2331	11.7248	10.5892	-10.7531
26	1.2606	0.1274	0.2738	1.1114	0.4539	1.6874	-0.0498	0.1396	-0.1404	0.0998	-0.0145	-0.3594	-0.3839	0.4128	0.058	0.4216	-0.0762	-0.0465	0.3674	0.0162	0.3089	21.6163	12.2217	-5.4756
27	1.285	-0.1091	0.92	1.4253	1.0491	3.3362	-0.4634	-0.443	0.4798	0.476	-0.1311	0.8701	-0.387	-0.9865	0.1003	0.7302	0.0094	-0.0913	0.5152	-0.0311	0.4606	13.0366	24.2116	3.9448
28	1.211	0.2885	0.8738	2.153	0.0639	1.299	-0.2497	0.054	0.1042	0.0044	0.0821	-0.022	-0.5027	-0.006	0.1323	0.6233	-0.0493	-0.0885	0.3131	0.0009	0.3268	13.045	27.5737	-9.6605
29	2.1411	0.3046	-0.0049	2.9265	-0.1371	1.8966	-0.1966	0.1388	-0.0777	0.2398	0.207	-0.2184	-0.115	-0.0115	0.0816	0.3173	-0.0005	0.0014	0.2619	-0.0165	0.2497	3.2621	7.231	-17.4534

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 0 through 64 )	A	0 - 64
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 65 through 94 )	A	65 - 94
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 95 through 159 )	A	95 - 159
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 160 through 254 )	A	160 - 254
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 255 through 307 )	A	255 - 307
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resid 1 through 64 )	B	1 - 64
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 65 through 94 )	B	65 - 94
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 95 through 284 )	B	95 - 284
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 285 through 307 )	B	285 - 307
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 1 through 64 )	C	1 - 64
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 65 through 94 )	C	65 - 94
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 95 through 159 )	C	95 - 159
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 160 through 254 )	C	160 - 254
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 255 through 307 )	C	255 - 307
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 1 through 63 )	D	1 - 63
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 64 through 143 )	D	64 - 143
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 144 through 284 )	D	144 - 284
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 285 through 307 )	D	285 - 307
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 1 through 114 )	E	1 - 114
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 115 through 307 )	E	115 - 307
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 0 through 28 )	F	0 - 28
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 29 through 50 )	F	29 - 50
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'F' and (resid 51 through 83 )	F	51 - 83
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'F' and (resid 84 through 114 )	F	84 - 114
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'F' and (resid 115 through 159 )	F	115 - 159
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'F' and (resid 160 through 223 )	F	160 - 223
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'F' and (resid 224 through 245 )	F	224 - 245
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 246 through 284 )	F	246 - 284
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 285 through 307 )	F	285 - 307

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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