PDB-7nor: Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis ArgF in complex w...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 7nor

タイトル

Crystal structure of Mycobacterium tuberculosis ArgF in complex with 2-fluoro-4-hydroxybenzonitrile.

要素

Ornithine carbamoyltransferase

キーワード

TRANSFERASE / ArgF / Ornithine Carbamoyltransferase

機能・相同性

機能・相同性情報

ornithine carbamoyltransferase / ornithine carbamoyltransferase activity / citrulline biosynthetic process / L-arginine biosynthetic process via ornithine / L-arginine biosynthetic process / amino acid binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Mycobacterium tuberculosis H37Rv (結核菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.59 Å

データ登録者

Mendes, V. / Gupta, P. / Burgess, A. / Sebastian-Perez, V. / Cattermole, E. / Meghir, C. / Blundell, T.L.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Comput Struct Biotechnol J / 年: 2021
タイトル: A fragment-based approach to assess the ligandability of ArgB, ArgC, ArgD and ArgF in the L-arginine biosynthetic pathway of Mycobacterium tuberculosis
著者: Gupta, P. / Thomas, S.E. / Zaidan, S.A. / Pasillas, M.A. / Cory-Wright, J. / Sebastian-Perez, V. / Burgess, A. / Cattermole, E. / Meghir, C. / Abell, C. / Coyne, A.G. / Jacobs, W.R. / ...

履歴

登録	2021年2月25日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2021年6月30日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月31日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	7nor.cif.gz	710.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb7nor.ent.gz	588 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	7nor.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/no/7nor ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/no/7nor	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	7nlfC 7nlnC 7nloC 7nlpC 7nlqC 7nlrC 7nlsC 7nltC 7nluC 7nlwC 7nlxC 7nlyC 7nlzC 7nm0C 7nn1C 7nn4C 7nn7C 7nn8C 7nnbC 7nncC 7nnfC 7nniC 7nnqC 7nnrC 7nnvC 7nnwC 7nnyC 7nnzC 7nosC 7notC 7nouC 7novC 7np0C 7nphC 7npjC 2p2gS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	7nnf-2 7nnv-1 7nov-1 7nos-1 2p2g-1 7nnz-1 2p2g-2 7nnf-1 7nnz-2 7nos-2 7nny-1 7nnw-1 7nnv-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#215 - 2017年11月アスパラギン酸カルバモイル転移酵素 (Aspartate Transcarbamoylase) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Ornithine carbamoyltransferase

B: Ornithine carbamoyltransferase

C: Ornithine carbamoyltransferase

D: Ornithine carbamoyltransferase

E: Ornithine carbamoyltransferase

F: Ornithine carbamoyltransferase

ヘテロ分子

201 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Ornithine carbamoyltransferase

B: Ornithine carbamoyltransferase

C: Ornithine carbamoyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
100 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

D: Ornithine carbamoyltransferase

E: Ornithine carbamoyltransferase

F: Ornithine carbamoyltransferase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
100 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	91.453, 142.734, 97.697
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 117.500, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Ornithine carbamoyltransferase / OTCase 分子量: 33208.324 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis H37Rv (結核菌) 遺伝子: argF, Rv1656, MTCY06H11.21 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P9WIT9, ornithine carbamoyltransferase
#2: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト分子量: 94.971 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#3: 化合物	ChemComp-8H8 / 2-fluoro-4-hydroxybenzonitrile / 3-フルオロ-4-シアノフェノ-ル分子量: 137.111 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₇H₄FNO / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1606 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.84 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.67 %
結晶化	温度: 291 K / 手法: 蒸気拡散法詳細: 150 mM ammonium dihydrogen phosphate 10 mM praseodymium acetate

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

Diamond

/ ビームライン: I04 / 波長: 0.9795 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS 6M-F / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年8月6日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9795 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 1.59→81.12 Å / Num. obs: 271697 / % possible obs: 92.2 % / 冗長度: 5.2 % / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.058 / R_pim(I) all: 0.027 / R_rim(I) all: 0.064 / Net I/σ(I): 13 / Num. measured all: 1416962

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. measured all	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Net I/σ(I) obs	% possible all
1.59-1.68	4.3	1.241	114917	26818	0.427	0.638	1.402	0.9	62.3
5.04-81.12	5.2	0.034	49105	9392	0.998	0.016	0.037	40.6	99

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	7.98 Å	81.12 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.18.2	精密化
Aimless	0.7.1	データスケーリング
PHASER	2.8.3	位相決定
PDB_EXTRACT	3.27	データ抽出
XDS		データ削減

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 2P2G

2p2g

解像度: 1.59→46.08 Å / SU ML: 0.17 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 19.39 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1861	13195	4.86 %
R_work	0.1668	258413	-
obs	0.1677	271608	92.08 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso max: 102.2 Å² / B_iso mean: 34.3295 Å² / B_iso min: 17.19 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.59→46.08 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13545	0	90	1607	15242
B_iso mean	-	-	50.9	43.22	-
残基数	-	-	-	-	1810

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.59-1.61	0.3522	250	0.3166	5020	5270	53
1.61-1.63	0.3421	288	0.307	5437	5725	58
1.63-1.65	0.2994	309	0.2845	5892	6201	64
1.65-1.67	0.288	339	0.2752	6423	6762	69
1.67-1.69	0.3008	352	0.2584	7211	7563	77
1.69-1.72	0.2644	451	0.2498	8270	8721	89
1.72-1.74	0.2406	489	0.2312	8926	9415	96
1.74-1.77	0.2258	403	0.2241	9068	9471	97
1.77-1.8	0.2276	463	0.2147	8987	9450	97
1.8-1.82	0.228	504	0.2061	9020	9524	97
1.82-1.86	0.2388	536	0.1932	8965	9501	97
1.86-1.89	0.2268	453	0.1984	9078	9531	97
1.89-1.93	0.2285	497	0.2025	9135	9632	98
1.93-1.97	0.2035	535	0.1824	9031	9566	98
1.97-2.01	0.2016	465	0.1743	9105	9570	98
2.01-2.06	0.204	490	0.1671	9113	9603	98
2.06-2.11	0.1862	447	0.1634	9134	9581	98
2.11-2.16	0.1809	469	0.1581	9206	9675	98
2.16-2.23	0.1782	431	0.1611	9220	9651	98
2.23-2.3	0.1942	439	0.1698	9200	9639	98
2.3-2.38	0.1919	478	0.1609	9190	9668	98
2.38-2.48	0.1925	500	0.1632	9202	9702	99
2.48-2.59	0.1811	442	0.1595	9262	9704	99
2.59-2.73	0.1801	491	0.1622	9205	9696	99
2.73-2.9	0.1946	483	0.1683	9245	9728	99
2.9-3.12	0.1796	421	0.1633	9331	9752	99
3.12-3.43	0.1689	464	0.1601	9307	9771	99
3.43-3.93	0.1705	417	0.1489	9438	9855	99
3.93-4.95	0.156	465	0.1388	9357	9822	99
4.95-46.08	0.1705	424	0.1705	9435	9859	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.9377	-0.8808	-0.6599	1.5797	0.2914	1.1494	0.0273	-0.004	0.1156	-0.0055	0.0227	-0.0702	-0.1356	0.0807	-0.0514	0.2036	-0.0191	-0.0155	0.234	-0.0274	0.2171	2.7271	-3.575	-41.2422
2	1.8177	-0.4217	-0.2322	2.4982	0.2944	0.2243	0.0336	0.2351	-0.1208	-0.3598	-0.1793	0.3132	-0.0971	-0.2708	0.1097	0.2207	0.0178	-0.0318	0.2615	-0.0222	0.2516	-8.888	-5.7483	-47.6585
3	2.3929	-0.5843	-1.1211	1.1819	-1.2077	2.7704	-0.0301	0.871	-0.3139	-0.5661	-0.2571	-0.1085	0.7098	-0.2332	0.1225	0.5312	0.052	0.0174	0.536	0.0021	0.3892	-4.2348	8.2047	-59.3068
4	2.0235	-0.4264	-0.7365	1.6808	0.4121	1.6865	0.1683	0.4024	0.2293	-0.7231	-0.1379	-0.2618	-0.4863	0.0431	-0.0121	0.3778	0.0137	0.0358	0.3051	0.0403	0.2853	2.7195	0.1014	-55.9594
5	1.1211	-0.6444	-0.4329	1.5455	0.4116	0.7904	-0.0212	-0.011	-0.0706	-0.0727	0.0604	0.0176	0.0176	0.1391	-0.0208	0.1679	-0.012	-0.0132	0.2555	-0.0128	0.2067	8.5966	-14.4671	-46.4089
6	1.3155	0.2312	0.0096	1.5003	0.5661	1.3756	-0.1018	-0.0241	-0.0643	-0.0914	0.168	-0.2886	0.0342	0.3033	-0.0464	0.187	-0.0029	0.0197	0.3169	-0.0388	0.2634	18.7536	-18.2091	-51.5918
7	1.4575	0.3713	-0.3131	0.9719	-0.0883	3.2682	-0.1405	0.1403	-0.0158	-0.1229	0.2048	-0.0927	-0.0048	-0.2332	-0.0593	0.2581	-0.0266	0.0258	0.2607	-0.0093	0.2436	7.9648	-25.9507	-59.9262
8	1.5033	0.2537	-0.7083	2.3548	0.2685	1.8699	-0.2656	-0.053	-0.1994	0.0585	0.0481	0.0917	0.3324	-0.0066	0.1667	0.2842	-0.0064	0.0411	0.246	-0.0037	0.2822	4.7762	-31.0478	-47.9193
9	1.431	-0.0695	-0.5522	2.9273	0.2149	1.3286	-0.007	-0.0876	0.0646	0.1366	0.1015	-0.1093	-0.0678	0.0393	-0.0827	0.1688	0.0078	-0.0067	0.2653	-0.0095	0.1976	1.3797	-8.6095	-40.2614
10	1.2992	0.3112	-0.0709	1.7037	0.295	1.2233	-0.0975	-0.162	-0.3859	0.2877	-0.0847	0.2924	0.2835	-0.0501	0.1842	0.2348	-0.0224	0.06	0.2577	-0.0306	0.383	-32.8407	-19.7823	-35.5721
11	0.8622	0.0732	-0.2762	1.9531	0.8767	1.5846	-0.0468	0.1	-0.0083	-0.1014	-0.0549	0.2021	-0.0961	-0.069	0.0933	0.199	-0.0014	-0.0078	0.2436	-0.0238	0.2725	-23.5056	-8.1654	-42.1507
12	1.4665	-1.0634	-0.5958	1.8766	0.2468	0.5655	0.0702	0.5466	-0.4451	-0.4156	-0.2376	0.3126	0.0838	-0.0906	0.1192	0.2596	-0.0034	-0.0093	0.3654	-0.0928	0.3462	-12.1358	-17.5992	-49.8559
13	1.1789	0.701	0.0276	0.7421	0.3477	1.5658	-0.0074	0.3279	-0.2953	-0.0076	-0.0594	0.1843	0.1473	-0.0113	0.0925	0.2018	-0.0107	0.0101	0.2692	-0.0758	0.3559	-28.9724	-19.6078	-45.9605
14	1.3285	0.1752	0.8763	1.4716	-0.4063	0.9984	-0.0042	0.2246	-0.4562	0.0251	-0.1779	0.4739	0.2716	-0.3101	0.0853	0.2033	-0.0612	0.0162	0.3917	-0.2025	0.5962	-45.2759	-23.5478	-49.0149
15	2.5582	-0.0969	-0.3229	1.7298	0.3456	3.2688	0.192	-0.3295	-0.829	0.1813	-0.145	0.327	1.1301	-0.0979	-0.0691	0.4457	-0.1158	0.0597	0.364	-0.1051	0.8392	-42.3753	-33.1489	-43.3357
16	1.8785	0.0437	0.1559	4.186	-1.1017	0.6547	0.0724	0.6376	-0.1034	-1.0475	-0.4833	0.7154	0.0589	-0.5706	-0.2432	0.0223	-0.0969	-0.1434	0.563	-0.3286	0.7362	-50.105	-20.3505	-56.0129
17	1.3633	0.3177	0.6582	0.779	0.2511	0.7274	-0.2075	0.0317	0.23	-0.3851	-0.1512	0.6218	-0.2676	-0.1852	0.111	0.2885	0.0635	-0.1722	0.5155	-0.2052	0.7041	-50.2285	-9.1532	-53.6202
18	2.4024	-0.4807	0.8577	2.3645	-0.2158	1.7415	-0.0894	-0.0442	-0.0944	0.1988	0.016	0.3492	-0.1095	-0.1214	0.0737	0.1933	-0.0168	0.0448	0.2338	-0.0624	0.3346	-31.8936	-11.9363	-38.9681
19	1.516	-0.3598	-0.0729	1.7796	-0.223	1.6286	0.0626	-0.1194	0.0254	0.0335	-0.0546	0.2551	-0.297	-0.2954	-0.0176	0.2867	0.0264	-0.009	0.2512	-0.0237	0.26	-25.2753	22.3122	-48.4198
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50	1.7948	0.3517	0.6931	3.1558	-0.1995	1.4321	-0.1192	0.021	-0.0617	-0.0645	0.188	-0.1058	-0.005	0.0002	-0.0605	0.227	0.0045	0.0019	0.2296	-0.0177	0.2156	3.2634	7.2529	-18.2167

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 0 through 50 )	A	0 - 50
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 51 through 75 )	A	51 - 75
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 76 through 94 )	A	76 - 94
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 95 through 114 )	A	95 - 114
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 115 through 159 )	A	115 - 159
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 160 through 215 )	A	160 - 215
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 216 through 245 )	A	216 - 245
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 246 through 284 )	A	246 - 284
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 285 through 307 )	A	285 - 307
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 1 through 28 )	B	1 - 28
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 29 through 64 )	B	29 - 64
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 65 through 94 )	B	65 - 94
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 95 through 143 )	B	95 - 143
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 144 through 187 )	B	144 - 187
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 188 through 201 )	B	188 - 201
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 202 through 245 )	B	202 - 245
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 246 through 284 )	B	246 - 284
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 285 through 307 )	B	285 - 307
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 1 through 28 )	C	1 - 28
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 29 through 50 )	C	29 - 50
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 51 through 83 )	C	51 - 83
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 84 through 143 )	C	84 - 143
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 144 through 159 )	C	144 - 159
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 160 through 187 )	C	160 - 187
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 188 through 201 )	C	188 - 201
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 202 through 231 )	C	202 - 231
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 232 through 254 )	C	232 - 254
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'C' and (resid 255 through 284 )	C	255 - 284
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'C' and (resid 285 through 307 )	C	285 - 307
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 1 through 64 )	D	1 - 64
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 65 through 143 )	D	65 - 143
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 144 through 223 )	D	144 - 223
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 224 through 284 )	D	224 - 284
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 285 through 307 )	D	285 - 307
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'E' and (resid 1 through 28 )	E	1 - 28
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'E' and (resid 29 through 50 )	E	29 - 50
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'E' and (resid 51 through 83 )	E	51 - 83
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'E' and (resid 84 through 114 )	E	84 - 114
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'E' and (resid 115 through 143 )	E	115 - 143
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'E' and (resid 144 through 159 )	E	144 - 159
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'E' and (resid 160 through 215 )	E	160 - 215
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'E' and (resid 216 through 245 )	E	216 - 245
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'E' and (resid 246 through 284 )	E	246 - 284
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'E' and (resid 285 through 307 )	E	285 - 307
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'F' and (resid 0 through 64 )	F	0 - 64
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'F' and (resid 65 through 94 )	F	65 - 94
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'F' and (resid 95 through 143 )	F	95 - 143
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'F' and (resid 144 through 245 )	F	144 - 245
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'F' and (resid 246 through 284 )	F	246 - 284
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'F' and (resid 285 through 307 )	F	285 - 307

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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