+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 7d5r | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Structure of the Ca2+-bound C646A mutant of peptidylarginine deiminase type III (PAD3) | ||||||||||||
要素 | Protein-arginine deiminase type-3 | ||||||||||||
キーワード | HYDROLASE / deimination / citrullination / peptidylarginine deiminase / post-translational modification / enzyme / isozyme / mutant / CYTOSOLIC PROTEIN | ||||||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 protein-arginine deiminase / protein-arginine deiminase activity / Chromatin modifying enzymes / intracellular membrane-bounded organelle / calcium ion binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 | ||||||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | ||||||||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.148 Å | ||||||||||||
データ登録者 | Mashimo, R. / Akimoto, M. / Unno, M. | ||||||||||||
資金援助 | 日本, 3件
| ||||||||||||
引用 | ジャーナル: Arch.Biochem.Biophys. / 年: 2021 タイトル: Structures of human peptidylarginine deiminase type III provide insights into substrate recognition and inhibitor design. 著者: Funabashi, K. / Sawata, M. / Nagai, A. / Akimoto, M. / Mashimo, R. / Takahara, H. / Kizawa, K. / Thompson, P.R. / Ite, K. / Kitanishi, K. / Unno, M. | ||||||||||||
履歴 |
|
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 7d5r.cif.gz | 505.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb7d5r.ent.gz | 417 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 7d5r.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 7d5r_validation.pdf.gz | 2.9 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | 7d5r_full_validation.pdf.gz | 2.9 MB | 表示 | |
XML形式データ | 7d5r_validation.xml.gz | 43.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 7d5r_validation.cif.gz | 58.5 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d5/7d5r ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d5/7d5r | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
単位格子 |
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Ens-ID: 1
|