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- PDB-6w8d: Structure of DNMT3A (R882H) in complex with CGT DNA -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 6w8d
タイトルStructure of DNMT3A (R882H) in complex with CGT DNA
要素
  • CGT DNA (25-MER)
  • DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like
  • DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A
キーワードTRANSFERASE/DNA / DNA methylation / DNMT3A(R882H) / AML / epigenetics / TRANSFERASE / TRANSFERASE-DNA complex
機能・相同性
機能・相同性情報


epigenetic programing of female pronucleus / chorionic trophoblast cell differentiation / positive regulation of cellular response to hypoxia / transposable element silencing by piRNA-mediated DNA methylation / negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin formation / protein-cysteine methyltransferase activity / transposable element silencing by heterochromatin formation / regulatory ncRNA-mediated heterochromatin formation / unmethylated CpG binding / cellular response to bisphenol A ...epigenetic programing of female pronucleus / chorionic trophoblast cell differentiation / positive regulation of cellular response to hypoxia / transposable element silencing by piRNA-mediated DNA methylation / negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin formation / protein-cysteine methyltransferase activity / transposable element silencing by heterochromatin formation / regulatory ncRNA-mediated heterochromatin formation / unmethylated CpG binding / cellular response to bisphenol A / DNA (cytosine-5-)-methyltransferase / DNA (cytosine-5-)-methyltransferase activity / autosome genomic imprinting / genomic imprinting / SUMOylation of DNA methylation proteins / ESC/E(Z) complex / XY body / male meiosis I / response to vitamin A / response to ionizing radiation / DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation / negative regulation of gene expression via chromosomal CpG island methylation / hepatocyte apoptotic process / lncRNA binding / negative regulation of gene expression, epigenetic / cellular response to ethanol / chromosome, centromeric region / catalytic complex / heterochromatin / 転移酵素; 一炭素原子の基を移すもの; メチル基を移すもの / DNA methylation / placenta development / condensed nuclear chromosome / PRC2 methylates histones and DNA / post-embryonic development / Defective pyroptosis / response to cocaine / Regulation of endogenous retroelements by Piwi-interacting RNAs (piRNAs) / stem cell differentiation / cellular response to amino acid stimulus / enzyme activator activity / euchromatin / response to toxic substance / response to lead ion / RMTs methylate histone arginines / nuclear matrix / neuron differentiation / transcription corepressor activity / response to estradiol / spermatogenesis / cellular response to hypoxia / methylation / RNA polymerase II-specific DNA-binding transcription factor binding / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding / response to xenobiotic stimulus / negative regulation of DNA-templated transcription / chromatin binding / enzyme binding / negative regulation of transcription by RNA polymerase II / DNA binding / zinc ion binding / nucleoplasm / identical protein binding / nucleus / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, ADD domain / : / DNA (cytosine-5-)-methyltransferase, N-terminal / DNMT3, cysteine rich ADD domain / : / DNMT3, cysteine rich ADD domain, GATA1-like zinc finger / DNMT3, ADD PHD zinc finger / ADD domain / ADD domain profile. / DNA methylase, C-5 cytosine-specific, active site ...DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, ADD domain / : / DNA (cytosine-5-)-methyltransferase, N-terminal / DNMT3, cysteine rich ADD domain / : / DNMT3, cysteine rich ADD domain, GATA1-like zinc finger / DNMT3, ADD PHD zinc finger / ADD domain / ADD domain profile. / DNA methylase, C-5 cytosine-specific, active site / C-5 cytosine-specific DNA methylases active site. / C-5 cytosine-specific DNA methylase (Dnmt) domain profile. / C-5 cytosine methyltransferase / C-5 cytosine-specific DNA methylase / domain with conserved PWWP motif / PWWP domain / PWWP domain profile. / PWWP domain / Vaccinia Virus protein VP39 / Zinc finger, FYVE/PHD-type / Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type / S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase superfamily / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / DNA / DNA (> 10) / DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like / DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A
類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
synthetic construct (人工物)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.598 Å
データ登録者Anteneh, H. / Song, J.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)1R35GM119721 米国
引用ジャーナル: Nat Commun / 年: 2020
タイトル: Structural basis for impairment of DNA methylation by the DNMT3A R882H mutation.
著者: Anteneh, H. / Fang, J. / Song, J.
履歴
登録2020年3月20日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02020年4月15日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12020年5月20日Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author
Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.22023年10月18日Group: Data collection / Database references / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.32024年12月25日Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Derived calculations / Structure summary
カテゴリ: chem_comp / pdbx_entry_details ...chem_comp / pdbx_entry_details / pdbx_validate_close_contact / struct_conn
Item: _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.type / _pdbx_entry_details.has_protein_modification

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A
B: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like
D: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A
C: DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like
E: CGT DNA (25-MER)
F: CGT DNA (25-MER)
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)129,8888
ポリマ－129,1196
非ポリマー7692
水1,72996
1


  • 登録構造と同一
  • 登録者が定義した集合体
  • 根拠: gel filtration
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
単位格子
Length a, b, c (Å)205.560, 205.560, 89.505
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number146
Space group name H-MH3

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要素

#1: タンパク質 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A / Dnmt3a / DNA methyltransferase HsaIIIA / M.HsaIIIA


分子量: 32696.668 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DNMT3A / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
参照: UniProt: Q9Y6K1, DNA (cytosine-5-)-methyltransferase
#2: タンパク質 DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like


分子量: 24163.705 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DNMT3L / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q9UJW3
#3: DNA鎖 CGT DNA (25-MER)


分子量: 7698.969 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#4: 化合物 ChemComp-SAH / S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE / S-アデノシルホモシステイン


分子量: 384.411 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C14H20N6O5S
#5: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 96 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O
研究の焦点であるリガンドがあるかN
Has protein modificationN

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.82 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.36 %
結晶化温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 0.1 M Sodium Citrate pH 4.2, 1% PEG8000

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 5.0.2 / 波長: 0.5 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS3 S 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2019年5月17日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.5 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.598→33.16 Å / Num. obs: 43419 / % possible obs: 98.9 % / 冗長度: 5.1 % / CC1/2: 0.998 / Net I/σ(I): 13.7
反射 シェル解像度: 2.6→2.69 Å / Num. unique obs: 43403 / CC1/2: 0.636

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解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.15.2_3472精密化
PDB_EXTRACT3.25データ抽出
HKL-3000データ削減
HKL-3000データスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 5YX2

5yx2


解像度: 2.598→33.159 Å / SU ML: 0.39 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.96 / 位相誤差: 31.21
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2526 1989 4.58 %
Rwork0.199 --
obs0.2015 43419 99.88 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å
原子変位パラメータBiso max: 259.79 Å2 / Biso mean: 114.3489 Å2 / Biso min: 43.16 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 2.598→33.159 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数7200 1020 52 96 8368
Biso mean--89.09 88.51 -
残基数----983
LS精密化 シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Rfactor Rfree error: 0

解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection Rwork% reflection obs (%)
2.598-2.66250.39531390.3317293999
2.6625-2.73440.3331430.29382948100
2.7344-2.81480.32291420.28382959100
2.8148-2.90560.32771460.27132961100
2.9056-3.00940.34891400.26672956100
3.0094-3.12980.29611410.25722970100
3.1298-3.27220.2991440.2512930100
3.2722-3.44450.29421380.22332987100
3.4445-3.66010.26661420.21752965100
3.6601-3.94220.26561430.1992979100
3.9422-4.33820.26551430.17952953100
4.3382-4.96410.20251470.16142963100
4.9641-6.24740.20171400.19022962100
6.2474-33.1590.2381410.17252958100
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
12.87970.3714-1.64274.3602-0.40924.67470.0395-0.7340.36280.4707-0.0496-0.4761-0.44120.5366-0.00730.6245-0.093-0.09130.6344-0.03850.562670.301830.8178-12.4262
22.86830.0699-1.1124.38611.10273.50620.15690.33380.3817-0.9279-0.2919-0.5488-0.74090.14560.20480.9431-0.01970.07270.56340.07870.647368.082839.0183-27.973
31.68740.3305-1.08724.4389-0.37513.9184-0.2250.5449-0.2621-1.4146-0.0448-0.81030.37380.03750.2121.05490.06720.24450.69890.01630.694167.933617.9679-32.9658
43.5056-0.4651.37170.0777-0.05043.92970.0130.1935-0.0222-2.0627-0.39250.1831.4789-1.1180.46581.917-0.1444-0.00051.2169-0.05480.777452.75868.9767-37.6411
52.12340.494-0.60284.571-0.75393.99830.044-0.0272-0.0222-0.3814-0.0723-0.37290.09270.2427-0.01990.65560.08360.10650.61410.00210.498866.291919.2664-22.4015
64.3520.1491-0.42811.25481.75172.5469-0.0146-1.48930.0237-2.32510.80910.7055-1.17810.226-1.34041.718-0.45520.19511.05570.01822.229580.740276.2746-19.4321
72.5894-0.3811.04192.4785-1.04091.18111.4541-0.23430.9762-0.88350.09850.3812-1.7351-0.3931-1.11212.2314-0.05030.2520.66980.11591.459167.901971.2176-32.6743
81.3517-1.4590.46274.6321-0.13784.7779-0.6234-0.278-0.2101-2.25940.0468-1.3435-0.550.18020.42671.91560.05450.38420.96180.0621.230274.873955.8995-35.747
91.0273-1.1566-1.41892.73990.63852.76820.49960.93721.4582-1.9929-0.53721.0787-0.8565-0.2849-0.04921.71770.2669-0.1560.75970.05621.462662.067161.8966-30.9368
102.15330.0563-0.62062.2395-1.29251.7754-0.112-0.38310.9862-0.384-0.1036-0.0766-0.51420.03120.21651.17970.0328-0.00910.6633-0.07471.161263.057359.7357-20.9123
113.62061.0440.17634.02630.2544.65790.57790.8599-0.89530.334-0.28531.62640.5910.5475-0.46821.1780.0112-0.05341.2879-0.25451.832946.77865.691-17.9775
122.34610.34540.97660.884-0.04121.52330.07020.04520.6734-0.4946-0.62120.1271-0.85140.13170.32932.0272-0.32510.10050.9144-0.292.019466.397876.9652-22.0767
132.7278-0.0145-0.03945.1003-0.4872.91850.0196-0.3254-0.30810.2054-0.02180.81220.4359-0.32630.0170.5739-0.1235-0.00890.58640.08480.532148.4677-15.1033-10.6117
141.71981.68730.17134.83921.98361.79770.105-0.195-0.10580.5226-0.21110.08070.4043-0.40720.08490.7037-0.04440.05990.74530.07730.450253.88671.33182.0681
151.91240.52360.27864.96010.91783.1208-0.0451-0.37440.19350.04680.07540.4956-0.0327-0.6390.0160.5108-0.00870.06450.74630.02250.418454.03154.3014-5.9563
160.79780.4525-0.40550.202-0.26341.2408-0.0577-0.3301-0.2819-0.77760.72650.44980.4277-0.8965-0.76420.9113-0.2553-0.10781.16830.17762.179426.7579-41.2867-6.2074
172.77771.04631.90680.46170.63112.1454-0.73780.6577-1.0880.42641.07690.067-0.30650.2455-0.72061.4053-0.49270.12671.49580.0761.79620.3657-42.6923-5.3146
181.3901-1.43530.22662.5611-0.44582.14430.0053-0.4983-1.24120.32210.23681.9790.3804-0.189-0.04810.8573-0.39410.01781.00910.21311.728931.2091-31.1885-5.8931
190.06050.0746-0.220.90830.51021.67610.35270.6503-2.4678-0.60590.41782.08910.4896-0.9239-0.59490.9224-0.4055-0.331.01280.26151.935127.7563-24.8159-17.7132
200.1602-0.01060.57970.46240.42991.7925-0.02050.137-0.48880.32560.1741.6338-0.2876-0.42670.10440.9648-0.2941-0.20291.06540.221.721121.5454-30.0156-23.9196
212.846-3.14582.30963.6683-2.44161.95581.39690.5475-0.7585-2.343-1.2403-1.04971.3999-0.3194-0.19021.5436-0.135-0.31261.0199-0.01192.168223.994-34.1718-25.0101
223.9389-0.9095-2.32841.30622.38924.7356-0.37690.58960.4793-0.4255-1.78110.6854-1.0212-1.32941.71091.4468-0.3441-0.47591.7125-0.08862.572411.1485-21.3891-20.2892
231.8528-0.0935-1.38821.06730.49731.2173-1.17661.0247-0.26550.40580.68450.45590.3777-0.48390.41591.703-0.6371-0.34361.3731-0.04971.76121.2654-44.6747-16.3695
243.29861.00560.65794.4616-0.06624.32980.7827-1.45271.19630.2901-0.70042.0804-1.9587-0.9466-0.27391.1360.01520.30031.6244-0.30951.756634.41345.3346-0.4371
251.9401-1.01190.44523.0717-0.86991.4696-0.38450.1506-0.7374-0.30210.39090.2195-0.5509-0.60150.05371.23510.1381-0.1511.6966-0.2081.71145.237626.1263-32.9372
262.5743-1.10212.08493.171-1.9699.73120.06331.5676-0.8429-1.19970.51630.21880.57080.4759-0.25231.8727-0.03880.05941.1861-0.0030.885156.922625.813-47.5947
278.12381.48340.18226.33960.70596.03951.063-1.5279-0.7418-1.6236-1.3323.44061.1675-3.51110.08091.1348-0.0293-0.29811.7781-0.24861.802443.171728.4292-30.9427
288.077-1.34193.90125.8932-1.5176.5789-1.71672.60190.0125-0.11870.53761.09380.5473-1.89921.26791.1731-0.31710.11542.0456-0.26851.931737.345715.5543-20.7494
291.0822-0.28041.60454.6666-1.3612.6272-0.6019-0.2179-0.65310.47830.26960.1135-0.81660.09970.19671.3802-0.13750.68951.6862-0.05942.191131.52885.55671.5698
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDSelection detailsAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1chain 'A' and (resid 629 through 698 )A629 - 698
2X-RAY DIFFRACTION2chain 'A' and (resid 699 through 784 )A699 - 784
3X-RAY DIFFRACTION3chain 'A' and (resid 785 through 839 )A785 - 839
4X-RAY DIFFRACTION4chain 'A' and (resid 840 through 857 )A840 - 857
5X-RAY DIFFRACTION5chain 'A' and (resid 858 through 912 )A858 - 912
6X-RAY DIFFRACTION6chain 'B' and (resid 179 through 191 )B179 - 191
7X-RAY DIFFRACTION7chain 'B' and (resid 192 through 222 )B192 - 222
8X-RAY DIFFRACTION8chain 'B' and (resid 223 through 235 )B223 - 235
9X-RAY DIFFRACTION9chain 'B' and (resid 236 through 255 )B236 - 255
10X-RAY DIFFRACTION10chain 'B' and (resid 256 through 332 )B256 - 332
11X-RAY DIFFRACTION11chain 'B' and (resid 333 through 352 )B333 - 352
12X-RAY DIFFRACTION12chain 'B' and (resid 353 through 379 )B353 - 379
13X-RAY DIFFRACTION13chain 'D' and (resid 628 through 784 )D628 - 784
14X-RAY DIFFRACTION14chain 'D' and (resid 785 through 839 )D785 - 839
15X-RAY DIFFRACTION15chain 'D' and (resid 840 through 912 )D840 - 912
16X-RAY DIFFRACTION16chain 'C' and (resid 187 through 198 )C187 - 198
17X-RAY DIFFRACTION17chain 'C' and (resid 199 through 221 )C199 - 221
18X-RAY DIFFRACTION18chain 'C' and (resid 222 through 280 )C222 - 280
19X-RAY DIFFRACTION19chain 'C' and (resid 281 through 301 )C281 - 301
20X-RAY DIFFRACTION20chain 'C' and (resid 302 through 320 )C302 - 320
21X-RAY DIFFRACTION21chain 'C' and (resid 321 through 339 )C321 - 339
22X-RAY DIFFRACTION22chain 'C' and (resid 340 through 360 )C340 - 360
23X-RAY DIFFRACTION23chain 'C' and (resid 361 through 378 )C361 - 378
24X-RAY DIFFRACTION24chain 'E' and (resid 422 through 432 )E422 - 432
25X-RAY DIFFRACTION25chain 'E' and (resid 433 through 446 )E433 - 446
26X-RAY DIFFRACTION26chain 'F' and (resid 422 through 426 )F422 - 426
27X-RAY DIFFRACTION27chain 'F' and (resid 428 through 432 )F428 - 432
28X-RAY DIFFRACTION28chain 'F' and (resid 433 through 437 )F433 - 437
29X-RAY DIFFRACTION29chain 'F' and (resid 438 through 446 )F438 - 446

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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