PDB-6u6c: Crystal structure of tryptophan synthase from M. tuberculosis - a...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6u6c

タイトル

Crystal structure of tryptophan synthase from M. tuberculosis - aminoacrylate- and GSK2-bound form

要素

(Tryptophan synthase ...) x 2

キーワード

Lyase/Lyase Inhibitor / PLP / HETEROTETRAMER / AMINO ACID BIOSYNTHESIS / SUBSTRATE CHANNELING / LYASE-LYASE INHIBITOR COMPLEX / Structural Genomics / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID

機能・相同性

機能・相同性情報

tryptophan synthase / tryptophan synthase activity / L-tryptophan biosynthetic process / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Mycobacterium tuberculosis (結核菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.402 Å

データ登録者

Chang, C. / Michalska, K. / Maltseva, N.I. / Jedrzejczak, R. / McCarren, P. / Nag, P.P. / Joachimiak, A. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Protein Sci. / 年: 2020
タイトル: Allosteric inhibitors of Mycobacterium tuberculosis tryptophan synthase.
著者: Michalska, K. / Chang, C. / Maltseva, N.I. / Jedrzejczak, R. / Robertson, G.T. / Gusovsky, F. / McCarren, P. / Schreiber, S.L. / Nag, P.P. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2019年8月29日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2020年9月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2020年9月30日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_ASTM / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year
改定 1.2	2023年10月11日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6u6c.cif.gz	998.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6u6c.ent.gz	822.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6u6c.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u6/6u6c ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u6/6u6c	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6usaC 6dweS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6e9p-2 5tcg-2 5tcf-2 6uap-1 6xrh-1 5tcj-2 5tch-2 5ocw-1 5tci-1 6o1h-1 1wdw-3 1wdw-2 5tcg-1 2j9x-1 6uap-2 1wbj-1 6vnt-1 3cep-1 5tcj-1 1tjp-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: CPX_06552_06553

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#228 - 2018年12月酵素の指向性進化 (Directed Evolution of Enzymes) 類似性 (13)

登録構造単位

A: Tryptophan synthase alpha chain

B: Tryptophan synthase beta chain

C: Tryptophan synthase alpha chain

D: Tryptophan synthase beta chain

E: Tryptophan synthase alpha chain

F: Tryptophan synthase beta chain

G: Tryptophan synthase alpha chain

H: Tryptophan synthase beta chain

ヘテロ分子

299 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Tryptophan synthase alpha chain

B: Tryptophan synthase beta chain

C: Tryptophan synthase alpha chain

D: Tryptophan synthase beta chain

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
149 kDa, 4 ポリマー
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2

E: Tryptophan synthase alpha chain

F: Tryptophan synthase beta chain

G: Tryptophan synthase alpha chain

H: Tryptophan synthase beta chain

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
150 kDa, 4 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	135.106, 159.226, 164.973
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
Tryptophan synthase ... , 2種, 8分子 ACEGBDFH

#1: タンパク質	Tryptophan synthase alpha chain 分子量: 28579.449 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (結核菌) 株: ATCC 25618 / H37Rv / 遺伝子: trpA, Rv1613, MTCY01B2.05 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P9WFY1, tryptophan synthase
#2: タンパク質	Tryptophan synthase beta chain 分子量: 43334.598 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) (結核菌) 株: ATCC 25618 / H37Rv / 遺伝子: trpB, Rv1612, MTCY01B2.04 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P9WFX9, tryptophan synthase

-
非ポリマー , 13種, 1350分子

#3: 化合物	... ChemComp-FMT / FORMIC ACID / ギ酸分子量: 46.025 Da / 分子数: 92 / 由来タイプ: 合成 / 式: CH₂O₂
#4: 化合物	... ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 24 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#5: 化合物	ChemComp-ACT / ACETATE ION / 酢酸イオン分子量: 59.044 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₃O₂
#6: 化合物	ChemComp-MLI / MALONATE ION / マロナ-ト分子量: 102.046 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₂O₄
#7: 化合物	ChemComp-PZV / 1-(2-fluorobenzene-1-carbonyl)-N-methyl-2,3-dihydro-1H-indole-5-sulfonamide 分子量: 334.365 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₆H₁₅FN₂O₃S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#8: 化合物	ChemComp-P1T / 2-[({3-HYDROXY-2-METHYL-5-[(PHOSPHONOOXY)METHYL]PYRIDIN-4-YL}METHYL)AMINO]ACRYLIC ACID 分子量: 318.220 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₅N₂O₇P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#9: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#10: 化合物	ChemComp-K / POTASSIUM ION / カリウムカチオン分子量: 39.098 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: K
#11: 化合物	ChemComp-EPE / 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID / HEPES / HEPES 分子量: 238.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₈H₁₈N₂O₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#12: 化合物	ChemComp-ALA / ALANINE / アラニンタイプ: L-peptide linking / 分子量: 89.093 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₇NO₂
#13: 化合物	ChemComp-PGE / TRIETHYLENE GLYCOL / トリエチレングリコ-ル分子量: 150.173 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₄
#14: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#15: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1195 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.08 Å³/Da / 溶媒含有率: 60.12 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7 / 詳細: 0.2M sodium malonate, 20% PEG3350

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 19-ID / 波長: 0.97918 Å

検出器

タイプ: DECTRIS PILATUS3 X 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年4月24日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.97918 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.4→30 Å / Num. obs: 138216 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 12.7 % / R_merge(I) obs: 0.308 / R_pim(I) all: 0.089 / R_rim(I) all: 0.321 / Χ²: 0.891 / Net I/σ(I): 3 / Num. measured all: 1758336

反射シェル

Diffraction-ID: 1

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique obs	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
2.4-2.44	10.7	1.649	6845	0.661	0.527	1.733	0.754	99.7
2.44-2.49	11.4	1.507	6876	0.709	0.464	1.578	0.77	99.9
2.49-2.53	11.9	1.414	6829	0.751	0.425	1.478	0.74	99.9
2.53-2.59	12.3	1.281	6824	0.772	0.376	1.336	0.812	99.8
2.59-2.64	12.6	1.238	6874	0.802	0.36	1.29	0.749	99.9
2.64-2.7	12.6	1.143	6880	0.831	0.331	1.191	0.749	99.9
2.7-2.77	12.3	0.956	6836	0.859	0.28	0.997	0.755	99.8
2.77-2.85	11.8	0.824	6825	0.857	0.248	0.862	0.868	99.2
2.85-2.93	13.7	0.782	6871	0.933	0.217	0.812	0.777	99.8
2.93-3.02	13.6	0.65	6888	0.95	0.18	0.675	0.772	99.8
3.02-3.13	13.6	0.517	6895	0.962	0.144	0.537	0.782	99.8
3.13-3.26	13.5	0.404	6874	0.975	0.113	0.42	0.793	100
3.26-3.4	13.3	0.308	6896	0.983	0.087	0.32	0.823	99.8
3.4-3.58	12.8	0.235	6928	0.988	0.068	0.245	0.851	99.9
3.58-3.81	12.4	0.176	6871	0.992	0.051	0.184	0.898	98.9
3.81-4.1	13.9	0.147	6959	0.994	0.041	0.152	0.984	99.8
4.1-4.51	13.6	0.114	6942	0.996	0.032	0.118	1.041	99.7
4.51-5.16	13	0.102	6994	0.996	0.029	0.106	1.042	99.7
5.16-6.49	12.7	0.117	7015	0.994	0.034	0.122	1.137	99.1
6.49-30	12.6	0.067	7294	0.995	0.02	0.07	1.615	99.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.15.2_3472	精密化
SCALEPACK		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.25	データ抽出
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 6DWE

6dwe

解像度: 2.402→29.876 Å / SU ML: 0.25 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 19.65

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1951	2691	1.95 %
R_work	0.1529	-	-
obs	0.1537	138098	99.52 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 140.74 Å² / B_iso mean: 31.1161 Å² / B_iso min: 4.77 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.402→29.876 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	19188	0	732	1195	21115
B_iso mean	-	-	50.21	36.5	-
残基数	-	-	-	-	2609

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	% reflection obs (%)
2.402-2.4454	0.2497	145	0.222	6833	97
2.4454-2.4924	0.2728	122	0.2095	7143	100
2.4924-2.5433	0.2717	121	0.2038	7068	100
2.5433-2.5985	0.272	142	0.1979	7061	100
2.5985-2.659	0.2394	136	0.1965	7128	100
2.659-2.7254	0.261	127	0.1919	7085	100
2.7254-2.799	0.2641	133	0.1911	7068	100
2.799-2.8813	0.2241	158	0.182	7070	100
2.8813-2.9743	0.2288	135	0.1797	7089	100
2.9743-3.0805	0.2315	145	0.1747	7110	100
3.0805-3.2037	0.2493	158	0.174	7122	100
3.2037-3.3493	0.2091	164	0.1598	7089	100
3.3493-3.5256	0.1942	148	0.1459	7142	100
3.5256-3.7461	0.1633	150	0.135	7097	99
3.7461-4.0347	0.1661	154	0.1228	7150	100
4.0347-4.4396	0.155	148	0.112	7198	100
4.4396-5.0793	0.1312	124	0.108	7213	100
5.0793-6.389	0.1615	154	0.1381	7236	99
6.389-29.876	0.1407	127	0.1364	7505	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.0013	-0.0006	-0.0003	0.0016	-0.0011	0.001	-0.009	0.0091	0.0022	-0.0231	-0.0084	-0.0231	-0.0004	0.0029	-0	0.2172	0.0799	0.0595	0.3777	0.0295	0.3215	94.9542	-12.2464	4.6167
2	0.0195	-0.0135	0.0201	0.0172	-0.0143	0.0179	0.0584	0.0197	-0.0177	0.0394	-0.0057	-0.0764	0.0099	0.0053	0	0.0961	-0.0073	-0.0034	0.1586	0.0235	0.237	87.7558	-13.7901	25.66
3	0.0086	0.008	0.002	0.0063	0.0002	0.0039	-0.0227	0.0495	0.038	0.0203	0.0154	-0.0374	-0.0386	0.055	0	0.0902	-0.0268	0.0145	0.1665	0.029	0.2502	87.3285	-1.67	21.1298
4	0.0134	-0.0066	0.0071	0.0077	0.0013	0.0098	0.0684	0.1306	0.0024	0.0062	-0.0217	-0.0969	0.0275	-0.0196	-0	0.1464	0.0178	0.0336	0.2701	0.0418	0.2246	79.2346	-8.264	8.9292
5	0.0008	0.0019	0.0019	0.0042	0.0043	0.0038	0.0074	0.132	-0.1024	0.0104	-0.0366	-0.0137	0.0364	-0.0037	0	0.1857	0.039	0.0014	0.2663	-0.0958	0.2976	84.1824	-24.4193	8.158
6	0.004	-0.0063	0.001	0.0068	-0.0012	0.0003	-0.0164	0.0516	-0.071	0.0305	-0.0636	-0.0314	0.0461	0.0321	0	0.1653	0.0473	0.0017	0.1967	0.0038	0.3636	93.2899	-23.9544	21.0107
7	0.001	0.0013	-0.0023	0.0003	-0.0023	0.0099	0.0439	0.0349	0.0026	-0.0287	0.0278	-0.0157	-0.0193	-0.0034	-0	0.1898	0.0193	0.035	0.2213	0.0579	0.1945	58.619	0.4299	12.485
8	0.0038	0.0037	0.0073	0.0062	0.0091	0.0142	0.0453	0.0266	0.0063	-0.0376	0.0335	0.0391	-0.0346	0.0142	-0	0.1072	0.0027	0.0056	0.137	0.0088	0.1056	47.5629	-12.888	11.6568
9	0.0324	0.0371	-0.0449	0.0833	-0.0388	0.065	0.049	0.0032	-0.0007	-0.0248	-0.0487	-0.0116	-0.0227	-0.0002	0.0008	0.0811	0.0068	0.0085	0.0866	0.0048	0.0854	49.1053	-9.5789	27.8302
10	0.0546	0.011	-0.0228	0.0412	0.0429	0.0468	0.0356	-0.0322	0.0102	0.0236	-0.0047	-0.0412	-0.0869	0.0048	0	0.0869	-0.0087	0.0073	0.0855	0.0053	0.0746	53.8994	2.4441	36.3558
11	0.0256	0.0084	0.0131	0.0394	-0.036	0.0508	0.0116	-0.0756	0.0166	0.0862	-0.043	0.0565	-0.0477	-0.0414	-0.0552	0.3937	-0.0035	0.1986	0.2645	-0.0413	0.2124	5.3439	-27.4661	85.1029
12	0.0184	-0.0115	-0.0054	0.1134	0.0083	0.0032	0.0201	-0.0383	-0.0355	0.2332	-0.0395	0.1254	-0.0527	-0.0018	-0.0143	0.2105	-0.1241	0.1325	0.1163	0.0322	0.1447	12.3114	-33.869	74.2994
13	0.0704	-0.0174	0.0324	0.0479	0.0024	0.0178	0.0199	-0.0388	-0.0416	0.0278	0.007	0.0776	-0.0896	-0.0334	0.0508	0.2192	-0.0164	0.1491	0.1959	-0.024	0.2489	1.5514	-21.517	70.5498
14	0.0518	-0.0192	0.0079	0.0369	0.0047	0.0033	0.0975	-0.1082	0.0615	0.2126	-0.0247	0.0206	-0.0341	-0.0212	0.0686	0.5448	-0.0729	0.1338	0.2004	-0.0907	0.1569	12.363	-19.2433	86.4745
15	0.0053	0.0052	0.007	0.0938	-0.0303	0.032	0.0512	0.0541	-0.0156	0.0449	-0.0345	0.0678	-0.0255	-0.0906	0.0018	0.0516	-0.0102	0.0333	0.1829	-0.0185	0.1507	8.2986	-15.7716	49.9165
16	0.0949	0.0649	-0.0519	0.1252	-0.0357	0.1602	0.011	0.0075	-0.0076	0.0287	-0.0293	-0.0118	0.0334	-0.04	0	0.0695	-0.0141	0.007	0.0865	0.0049	0.0909	26.2639	-22.5668	42.8421
17	0.088	0.0791	0.0524	0.1717	0.052	0.1118	-0.2154	0.1515	-0.1119	-0.2888	0.0718	-0.0754	0.1835	-0.026	-0.2648	0.4959	-0.0858	0.203	0.1789	-0.1101	0.0821	37.3395	-40.0792	-45.9691
18	0.0099	0.0038	0.0035	0.004	0.0023	0.009	-0.0851	0.0088	-0.0219	-0.0359	-0.0435	-0.0315	0.0354	0.0416	-0.0001	0.3846	0.0027	0.176	0.2814	0.0045	0.3343	51.0867	-35.3921	-39.8443
19	0.0536	-0.0056	0.0002	0.0042	-0.0026	0.002	-0.0075	0.0966	0.0127	-0.1898	0.0205	-0.0419	0.04	0.0459	0.0242	0.5474	-0.1693	0.1055	0.3453	0.0294	0.1278	42.2525	-27.8653	-55.5499
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21	0.0109	0.0036	0.0064	0.007	0.0039	0.0028	-0.0421	-0.0038	-0.0033	-0.0606	0.0528	-0.0559	0.0803	0.099	-0	0.1483	0.0347	0.0505	0.182	0.0125	0.1802	48.4784	-26.6005	-19.4006
22	0.0857	-0.096	-0.0641	0.1275	0.0611	0.1599	-0.0425	-0.0062	-0.0109	-0.0513	-0	-0.0053	0.0782	-0.0387	-0.0006	0.0801	-0.0164	0.015	0.053	-0.012	0.0647	29.5668	-23.7787	-11.9911
23	0.0207	-0.0059	0.0233	0.0793	-0.0319	0.0358	0.097	0.0012	-0.0226	-0.0348	-0.0126	0.1875	0.0412	-0.0455	0.0073	0.0964	0.0223	-0.0047	0.1669	-0.0223	0.2254	-20.8435	14.2634	9.6404
24	0.0026	0.0001	0.0002	0.0058	0.0029	0.0044	0.0394	0.0305	0.0091	-0.0019	-0.017	0.0277	-0.0214	0.0267	-0	0.1358	0.0324	0.0258	0.1533	-0.0058	0.1842	-14.1132	23.7596	10.4572
25	0.0102	-0.0012	-0.0107	0.0053	-0.0032	0.0132	-0.0044	-0.082	-0.0548	0.0225	0.0292	0.0554	-0.0216	0.0509	-0	0.1559	-0.0006	0.034	0.168	-0.0043	0.1752	-9.4995	14.402	22.3958
26	0.0251	0.0009	-0.0124	0.0094	-0.0076	0.0085	-0.0342	-0.0894	-0.1286	-0.0126	-0.0254	0.2195	0.0397	-0.0191	-0.0005	0.141	-0.0223	-0.0084	0.176	0.0443	0.3277	-25.5757	4.8175	16.9922
27	0.0011	-0.0022	0.001	0.0065	-0.0012	0.0035	0.0373	-0.0289	-0.0206	-0.0057	0.049	0.0196	-0.015	0.0368	0	0.1782	-0.013	0.0124	0.2359	-0.0304	0.1743	12.8179	13.3073	17.9604
28	0.098	-0.0329	-0.0763	0.1763	0.0341	0.1352	0.0322	-0.012	-0.0151	-0.0323	-0.0327	0.005	-0.0489	-0.0161	-0	0.0605	-0.0027	0.0019	0.0742	-0.0126	0.0588	16.5658	3.3161	1.55

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 8 through 21 )	A	8 - 21
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 22 through 85 )	A	22 - 85
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 86 through 126 )	A	86 - 126
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 127 through 197 )	A	127 - 197
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 198 through 231 )	A	198 - 231
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 232 through 267 )	A	232 - 267
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 4 through 31 )	B	4 - 31
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 32 through 64 )	B	32 - 64
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 65 through 258 )	B	65 - 258
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 259 through 408 )	B	259 - 408
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 8 through 37 )	C	8 - 37
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 38 through 142 )	C	38 - 142
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 143 through 197 )	C	143 - 197
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 198 through 267 )	C	198 - 267
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 4 through 50 )	D	4 - 50
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 51 through 407 )	D	51 - 407
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'E' and (resid 9 through 142 )	E	9 - 142
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'E' and (resid 143 through 197 )	E	143 - 197
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 198 through 265 )	E	198 - 265
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 266 through 266 )	E	301
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'F' and (resid 4 through 50 )	F	4 - 50
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'F' and (resid 51 through 407 )	F	51 - 407
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'G' and (resid 8 through 85 )	G	8 - 85
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'G' and (resid 86 through 126 )	G	86 - 126
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'G' and (resid 127 through 197 )	G	127 - 197
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'G' and (resid 198 through 267 )	G	198 - 267
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'H' and (resid 4 through 31 )	H	4 - 31
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'H' and (resid 32 through 407 )	H	32 - 407

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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