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Yorodumi- PDB-6tnp: Crystal structure of the ScFv-5E5 in complex with a Tn glycopeptide -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6tnp | ||||||
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Title | Crystal structure of the ScFv-5E5 in complex with a Tn glycopeptide | ||||||
Components |
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Keywords | IMMUNE SYSTEM / Antibody / ScFv / 5E5 / anti-Tn antibody / MUC1 / cancer | ||||||
Function / homology | Chem-NO8 Function and homology information | ||||||
Biological species | Mus musculus (house mouse) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 3 Å | ||||||
Authors | Macias-Leon, J. / Corzana, F. / Hurtado-Guerrero, R. | ||||||
Citation | Journal: Chem.Commun.(Camb.) / Year: 2020 Title: Structural characterization of an unprecedented lectin-like antitumoral anti-MUC1 antibody. Authors: Macias-Leon, J. / Bermejo, I.A. / Asin, A. / Garcia-Garcia, A. / Companon, I. / Jimenez-Moreno, E. / Coelho, H. / Mangini, V. / Albuquerque, I.S. / Marcelo, F. / Asensio, J.L. / Bernardes, G. ...Authors: Macias-Leon, J. / Bermejo, I.A. / Asin, A. / Garcia-Garcia, A. / Companon, I. / Jimenez-Moreno, E. / Coelho, H. / Mangini, V. / Albuquerque, I.S. / Marcelo, F. / Asensio, J.L. / Bernardes, G.J.L. / Joshi, H.J. / Fiammengo, R. / Blixt, O. / Hurtado-Guerrero, R. / Corzana, F. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 6tnp.cif.gz | 542.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb6tnp.ent.gz | 453.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 6tnp.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 6tnp_validation.pdf.gz | 2 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 6tnp_full_validation.pdf.gz | 2.1 MB | Display | |
Data in XML | 6tnp_validation.xml.gz | 52.8 KB | Display | |
Data in CIF | 6tnp_validation.cif.gz | 68.9 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tn/6tnp ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tn/6tnp | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 5yd5S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Refine code: _
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