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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6q5m | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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タイトル | Crystal structure of a CC-Hex mutant that forms an antiparallel four-helix coiled coil CC-Hex*-L24Dab | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | CC-Hex*![]() DE NOVO PROTEIN / coiled coil / tetramer / synthetic / antiparallel / CC-Hex | 生物種 | synthetic construct (人工物) | 手法 | ![]() ![]() ![]() ![]() Wood, C.W. / Beesley, J.L. / Rhys, G.G. / Brady, R.L. / Woolfson, D.N. | 資金援助 | | ![]() ![]()
![]() ![]() タイトル: Navigating the Structural Landscape of De Novo alpha-Helical Bundles. 著者: Rhys, G.G. / Wood, C.W. / Beesley, J.L. / Zaccai, N.R. / Burton, A.J. / Brady, R.L. / Thomson, A.R. / Woolfson, D.N. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 21.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 15.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 3221.832 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物) #2: 化合物 | ChemComp-NA / | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.02 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.11 % |
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結晶化 | 温度: 297 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 / 詳細: 0.8 M Na/K hydrogen phosphate |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N | |||||||||||||||||||||||||||
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2013年7月9日 | |||||||||||||||||||||||||||
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray | |||||||||||||||||||||||||||
放射波長 | 波長: 0.9783 Å / 相対比: 1 | |||||||||||||||||||||||||||
反射 | 解像度: 1.5→35.72 Å / Num. obs: 8775 / % possible obs: 98.9 % / 冗長度: 4.4 % / Biso Wilson estimate: 16.469 Å2 / CC1/2: 1 / Rmerge(I) obs: 0.048 / Rpim(I) all: 0.036 / Rrim(I) all: 0.061 / Net I/σ(I): 12 | |||||||||||||||||||||||||||
反射 シェル | Diffraction-ID: 1
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 29.245 Å2
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精密化ステップ | サイクル: 1 / 解像度: 1.5→35.72 Å
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拘束条件 |
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