PDB-6phb: Pfs25 in complex with the human transmission blocking antibody 2530

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6phb

タイトル

Pfs25 in complex with the human transmission blocking antibody 2530

要素

25 kDa ookinete surface antigen
2530 Antibody Fab, Heavy Chain
2530 Antibody Fab, Light Chain

キーワード

IMMUNE SYSTEM / Fab / Complex / Antigen / Immunoglobulin

機能・相同性

機能・相同性情報

side of membrane / cell surface / plasma membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Plasmodium falciparum (マラリア病原虫)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2 Å

データ登録者

McLeod, B.R. / Julien, J.P.

資金援助

カナダ, 1件

引用

ジャーナル: Nat Commun / 年: 2019
タイトル: Potent antibody lineage against malaria transmission elicited by human vaccination with Pfs25.
著者: McLeod, B. / Miura, K. / Scally, S.W. / Bosch, A. / Nguyen, N. / Shin, H. / Kim, D. / Volkmuth, W. / Ramisch, S. / Chichester, J.A. / Streatfield, S. / Woods, C. / Schief, W.R. / Emerling, D. ...

履歴

登録	2019年6月25日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2019年10月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年10月9日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.identifier_ORCID / _citation_author.name
改定 1.2	2023年10月11日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6phb.cif.gz	491.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6phb.ent.gz	402 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6phb.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ph/6phb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ph/6phb	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	6phcC 6phdC 6phfC 6phgC 6phhC 5uqyS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6xc4-2 3c09-1 7bwj-d 7c01-2 2zuq-1 6b0a-d 6hhc-d 6wo4-d 7aud-5 7kmi-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #126 - 2010年6月上皮成長因子 (Epidermal Growth Factor) 類似性 (1) #75 - 2006年3月組織因子 (Tissue Factor) 類似性 (1)

登録構造単位

I: 25 kDa ookinete surface antigen

C: 2530 Antibody Fab, Light Chain

D: 2530 Antibody Fab, Heavy Chain

E: 25 kDa ookinete surface antigen

A: 2530 Antibody Fab, Light Chain

B: 2530 Antibody Fab, Heavy Chain

ヘテロ分子

135 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

I: 25 kDa ookinete surface antigen

C: 2530 Antibody Fab, Light Chain

D: 2530 Antibody Fab, Heavy Chain

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
根拠: gel filtration
67.7 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

E: 25 kDa ookinete surface antigen

A: 2530 Antibody Fab, Light Chain

B: 2530 Antibody Fab, Heavy Chain

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
67.7 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	114.599, 114.599, 98.181
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	144
Space group name H-M	P3₁

#1: タンパク質	25 kDa ookinete surface antigen / Pfs25 分子量: 20233.270 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Plasmodium falciparum (マラリア病原虫) 発現宿主: Homo sapiens (ヒト) / 参照: UniProt: P13829
#2: 抗体	2530 Antibody Fab, Light Chain 分子量: 23625.131 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#3: 抗体	2530 Antibody Fab, Heavy Chain 分子量: 23309.992 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Homo sapiens (ヒト)
#4: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 16 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1057 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
研究の焦点であるリガンドがあるか	N

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.77 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.61 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法詳細: 0.2 M lithium sulfate, 0.1 M Tris, pH 7.0, and 2.0 M ammonium sulfate

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: CLSI / ビームライン: 08ID-1 / 波長: 0.97949 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 S 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年6月3日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97949 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2→40 Å / Num. obs: 96360 / % possible obs: 98.8 % / 冗長度: 4.1 % / CC_1/2: 0.997 / R_merge(I) obs: 0.106 / R_pim(I) all: 0.059 / Net I/σ(I): 9.5
反射シェル	解像度: 2→2.1 Å / 冗長度: 4 % / R_merge(I) obs: 0.512 / Mean I/σ(I) obs: 2.2 / Num. unique obs: 13044 / CC_1/2: 0.759 / R_pim(I) all: 0.288 / % possible all: 98.2

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.14_3260	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX		精密化

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 5UQY

5uqy

解像度: 2→37.511 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.97 / 位相誤差: 22.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2091	1867	1.94 %
R_work	0.1772	-	-
obs	0.1778	96331	98.83 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2→37.511 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9071	0	64	1057	10192

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.002	9322
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.147	12645
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.637	5696
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.044	1448
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1616

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2-2.0541	0.3117	146	0.2536	7258	X-RAY DIFFRACTION	98
2.0541-2.1145	0.2538	144	0.2412	7173	X-RAY DIFFRACTION	98
2.1145-2.1828	0.2984	142	0.2273	7249	X-RAY DIFFRACTION	98
2.1828-2.2608	0.2494	136	0.2161	7267	X-RAY DIFFRACTION	98
2.2608-2.3513	0.2402	148	0.2075	7197	X-RAY DIFFRACTION	99
2.3513-2.4583	0.2273	133	0.2061	7234	X-RAY DIFFRACTION	99
2.4583-2.5879	0.3031	140	0.2084	7295	X-RAY DIFFRACTION	99
2.5879-2.75	0.2459	144	0.1984	7269	X-RAY DIFFRACTION	99
2.75-2.9622	0.2211	150	0.1932	7293	X-RAY DIFFRACTION	99
2.9622-3.2602	0.2199	144	0.1772	7315	X-RAY DIFFRACTION	99
3.2602-3.7315	0.1992	148	0.1564	7274	X-RAY DIFFRACTION	99
3.7315-4.6999	0.1565	150	0.1295	7333	X-RAY DIFFRACTION	100
4.6999-37.5179	0.1463	142	0.1524	7307	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.0076	1.2203	-1.4934	5.259	-1.7832	6.2106	0.0805	0.6647	-0.0777	-0.6857	-0.0603	0.2136	-0.0777	0.018	-0.0557	0.4122	0.0246	0.0634	0.4538	0.0531	0.4631	33.8128	150.3768	-16.5343
2	2.7248	-1.5956	-0.2202	4.6061	0.4048	0.7972	-0.2567	-0.3208	0.0856	0.3922	0.2168	0.1627	-0.1192	0.0102	0.0547	0.3709	0.0715	0.0495	0.3146	0.0675	0.367	39.0885	150.7029	-10.7658
3	5.3127	1.6828	-0.3632	2.3442	-0.5693	5.1594	-0.216	-0.1731	-0.4622	0.0001	0.1712	0.064	0.2563	0.3982	0.0834	0.3599	0.0275	0.0384	0.2394	0.0916	0.3708	56.1543	137.296	-10.8321
4	5.8496	-2.2587	-1.5049	4.7498	1.4512	3.4831	-0.1358	0.0066	-0.0351	-0.1057	0.224	0.0306	-0.0795	0.1714	-0.0806	0.2809	-0.0004	-0.0072	0.2806	0.0617	0.2623	57.3518	142.1327	-18.1869
5	3.9298	-0.7929	-0.6093	6.9543	-0.6655	2.3214	-0.0921	-0.4078	0.143	0.2406	-0.0795	-0.4772	-0.2401	0.3582	0.1218	0.3273	-0.0064	-0.0397	0.3476	0.0445	0.3029	51.9537	155.1382	-18.5965
6	2.9205	0.4622	-0.6852	2.8764	1.1418	5.3715	0.1538	-0.234	0.5275	0.2328	0.0454	0.0942	-0.6737	0.1982	-0.1827	0.453	0.012	0.0002	0.261	-0.0307	0.4583	43.2028	165.0182	-18.2527
7	2.4353	2.1025	0.767	5.2715	-0.7263	1.2284	0.1569	-0.2985	1.5885	0.1853	0.0497	0.3224	-1.1395	0.0151	-0.2679	0.9102	-0.0761	0.0002	0.3506	-0.1046	0.9439	42.6835	175.5975	-14.2004
8	6.8297	5.1459	-0.432	6.8483	0.1769	1.9469	0.8858	-0.8002	0.9344	1.1067	-0.4779	0.8484	0.0275	-0.0277	-0.3985	0.6838	0.0215	0.1582	0.6018	-0.0878	0.6376	28.9605	157.6888	-3.269
9	1.0247	0.409	1.0171	0.1713	0.496	2.0284	0.2201	-1.0389	0.3078	0.709	0.2916	-0.2607	-0.789	-0.0932	-0.4323	1.2369	-0.081	0.087	0.9492	-0.1696	0.6728	27.092	152.5605	7.5987
10	1.9384	-0.8896	-0.515	4.2621	0.5519	1.7144	0.0658	0.1359	0.0027	-0.1189	-0.0534	0.4121	0.0258	-0.2423	0.0006	0.1986	-0.0102	-0.0321	0.221	0.0276	0.2157	51.2275	115.5147	-7.3553
11	1.0186	-0.4413	0.2761	1.3785	-0.4103	0.8616	0.069	-0.0354	-0.0326	-0.0005	-0.0411	-0.0351	0.1126	0.0621	-0.0272	0.1801	-0.0221	0.0019	0.2197	-0.0041	0.1718	65.9583	102.4936	5.9487
12	1.4442	-0.2946	0.215	1.6929	-0.5823	3.5186	-0.0144	-0.0693	0.1488	0.1962	-0.0275	0.0533	-0.2586	0.0837	0.0244	0.2243	-0.0047	0.0103	0.172	0.0152	0.2211	55.855	130.9642	7.6715
13	2.9011	-1.1863	-0.7059	2.3661	-0.2835	1.6123	0.1453	0.0486	0.1645	-0.1057	-0.1461	-0.4714	-0.0698	0.2388	-0.0203	0.1868	-0.0281	0.0059	0.2211	0.0215	0.2493	76.0776	109.5303	15.3467
14	5.7786	0.0384	-2.1738	3.1303	0.5196	6.4053	-0.0353	-0.3836	0.1	0.7746	0.0702	0.0269	-0.1269	-0.0979	0.0109	0.4841	0.0084	0.0998	0.3791	0.0358	0.4983	82.0849	178.2245	-3.4583
15	4.5495	-1.7887	-1.1526	1.5795	-0.4312	1.185	0.2293	0.0783	0.3928	-0.5217	-0.0849	0.1051	-0.0908	-0.2517	-0.1383	0.4345	0.0749	0.0391	0.3474	0.0143	0.4307	75.9086	178.7951	-9.4107
16	6.1604	0.0031	0.669	5.6847	0.4948	7.3736	0.3196	0.2873	0.1807	-0.765	-0.1197	-0.3106	-0.519	0.1189	-0.2495	0.4047	0.0716	0.1151	0.2628	-0.005	0.3742	82.4859	168.679	-9.0378
17	4.0936	2.1848	-0.6909	4.4931	-1.5499	6.4439	-0.0074	-0.0657	-0.2996	-0.4123	-0.1154	-0.4221	0.5714	-0.0248	0.0746	0.3018	0.0616	0.103	0.3007	-0.0417	0.3503	82.2269	152.3262	-9.1671
18	2.8942	-0.5704	0.6005	7.8784	-1.5281	2.9017	0.1359	-0.242	0.0969	-0.0564	-0.0737	0.0974	0.0968	-0.2068	-0.055	0.2726	-0.0053	0.0615	0.2819	-0.0361	0.252	77.4433	153.7201	-1.8079
19	6.9211	-1.4507	-0.2728	6.7065	0.6655	4.1905	-0.081	0.297	-0.2407	-0.2594	0.0442	0.4859	0.2478	-0.4495	0.0607	0.3096	-0.0114	0.0143	0.3602	-0.0546	0.2885	68.7716	164.9205	-1.3645
20	3.497	-0.087	0.943	3.101	-1.2444	6.2179	0.0251	0.2353	0.3699	-0.2661	0.0663	0.388	-0.2509	-0.8213	-0.1171	0.2848	0.0899	-0.0107	0.3897	-0.0159	0.4271	64.6778	177.4287	-1.7574
21	1.5482	0.6431	-1.2586	1.3192	0.1353	2.59	0.314	1.3031	1.1968	-0.4393	0.0706	0.5477	-0.5434	-0.6838	-0.2856	0.5431	0.1381	-0.0074	0.6813	0.1684	0.7486	70.5434	185.1769	-13.0388
22	0.1417	0.3612	0.4296	1.0979	0.5292	3.1099	-0.1264	1.3596	0.2299	-0.5626	0.3965	0.4651	-0.7983	-0.6268	-0.121	1.0885	-0.0315	-0.1509	1.3242	0.155	0.4754	83.1227	186.9109	-27.8737
23	3.147	-1.6505	0.1884	3.2765	-0.4457	1.6627	-0.0205	-0.0714	0.3382	0.2106	0.0362	-0.1551	-0.1207	0.1069	-0.0261	0.1934	-0.007	0.0148	0.1974	-0.0428	0.2017	103.5414	145.7133	-12.6323
24	0.7986	-0.5621	-0.3618	1.7981	0.4196	0.7643	-0.0578	-0.0595	0.0693	0.1929	0.0475	0.1098	0.0132	0.0244	0.0226	0.1701	-0.0225	0.0106	0.1988	0.0003	0.1816	101.87	137.0918	-16.6904
25	1.2201	0.1296	0.5297	1.3679	1.0113	4.6475	-0.0132	0.1143	-0.0794	-0.0669	0.0668	-0.1354	-0.0144	0.1138	-0.047	0.2219	-0.0149	0.0044	0.1795	-0.0055	0.2	112.0383	120.6669	-30.8842
26	1.4968	0.0354	0.6208	1.9453	2.354	3.89	0.0733	0.3472	-0.4028	-0.0723	0.0862	-0.0701	0.279	0.4026	-0.1845	0.3032	0.0116	0.0199	0.3044	-0.062	0.272	113.3324	111.8276	-38.7609
27	1.3612	-0.3113	-0.4397	1.791	0.5564	3.3244	0.0136	0.1427	0.0889	-0.0952	-0.0435	0.106	-0.0358	-0.2818	0.0048	0.1713	0.0155	0.0175	0.2021	0.0025	0.206	87.8498	149.3781	-27.6546
28	1.6004	-0.5281	-0.2435	3.4932	-0.3505	1.4589	-0.0699	0.0472	-0.3393	0.1577	0.0868	0.3848	0.1845	-0.1731	-0.017	0.182	-0.0323	0.0183	0.2115	-0.0056	0.2418	96.2956	121.202	-35.3489

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'I' and (resid -2 through 11 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'I' and (resid 12 through 38 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'I' and (resid 39 through 48 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'I' and (resid 49 through 73 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'I' and (resid 74 through 89 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'I' and (resid 90 through 119 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'I' and (resid 120 through 132 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'I' and (resid 133 through 158 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'I' and (resid 159 through 172 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 1 through 48 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 49 through 215 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'D' and (resid 1 through 110 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'D' and (resid 111 through 220 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'E' and (resid -2 through 11 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'E' and (resid 12 through 25 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'E' and (resid 26 through 38 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'E' and (resid 39 through 48 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'E' and (resid 49 through 73 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'E' and (resid 74 through 89 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'E' and (resid 90 through 119 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 120 through 158 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resid 159 through 173 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'A' and (resid 1 through 48 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'A' and (resid 49 through 129 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'A' and (resid 130 through 175 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'A' and (resid 176 through 215 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'B' and (resid 1 through 110 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'B' and (resid 111 through 220 )

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)