PDB-6oao: Structure of DBP in complex with human neutralizing antibody 092096

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6oao

タイトル

Structure of DBP in complex with human neutralizing antibody 092096

要素

Antibody 092096 single chain variable fragment
Duffy binding surface protein region II

キーワード

CELL INVASION / Plasmodium / vivax / Duffy Binding Protein / DBP / PvDBP / antibody / neutralizing / inhibition / malaria / invasion / blocking / vaccine / structural vaccinology

機能・相同性

機能・相同性情報

host cell surface receptor binding / identical protein binding / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Plasmodium vivax (マラリア病原虫)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 3.497 Å

データ登録者

Urusova, D. / Tolia, N.H.

資金援助

米国, 4件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	Intramural Research Program	米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	R56 AI080792	米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	HHSN272201400018C	米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	R01 AI064478	米国

引用

ジャーナル: Nat Microbiol / 年: 2019
タイトル: Structural basis for neutralization of Plasmodium vivax by naturally acquired human antibodies that target DBP.
著者: Urusova, D. / Carias, L. / Huang, Y. / Nicolete, V.C. / Popovici, J. / Roesch, C. / Salinas, N.D. / Witkowski, B. / Ferreira, M.U. / Adams, J.H. / Gross, M.L. / King, C.L. / Tolia, N.H.

履歴

登録	2019年3月18日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2019年6月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2019年9月4日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID
改定 1.2	2019年12月18日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2023年10月11日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.4	2024年11月6日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oa/6oao ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/oa/6oao	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6oanC 4nuvS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	1t5o-2 4h1l-1 1t5o-1 6p8s-d 6iid-2 3wdi-d 5sy5-3 6m4w-1 5lkb-d 5sy5-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1) #221 - 2018年5月ヒトパピローマウイルスとワクチン (Human Papillomavirus and Vaccines) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Duffy binding surface protein region II

B: Antibody 092096 single chain variable fragment

C: Duffy binding surface protein region II

D: Antibody 092096 single chain variable fragment

E: Duffy binding surface protein region II

F: Antibody 092096 single chain variable fragment

G: Duffy binding surface protein region II

H: Antibody 092096 single chain variable fragment

I: Duffy binding surface protein region II

J: Antibody 092096 single chain variable fragment

K: Duffy binding surface protein region II

L: Antibody 092096 single chain variable fragment

ヘテロ分子

382 kDa, 12 ポリマー
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1

A: Duffy binding surface protein region II

B: Antibody 092096 single chain variable fragment

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2

C: Duffy binding surface protein region II

D: Antibody 092096 single chain variable fragment

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3

E: Duffy binding surface protein region II

F: Antibody 092096 single chain variable fragment

ヘテロ分子

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4

G: Duffy binding surface protein region II

H: Antibody 092096 single chain variable fragment

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5

I: Duffy binding surface protein region II

J: Antibody 092096 single chain variable fragment

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6

K: Duffy binding surface protein region II

L: Antibody 092096 single chain variable fragment

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単位格子

Length a, b, c (Å)	130.658, 89.563, 193.705
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 108.05, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	Duffy binding surface protein region II 分子量: 37451.898 Da / 分子数: 6 / Mutation: 0 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Plasmodium vivax (マラリア病原虫) 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: B7T089, UniProt: P22290*PLUS
#2: 抗体	Antibody 092096 single chain variable fragment 分子量: 26245.713 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌)
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.07 Å³/Da / 溶媒含有率: 59.92 %
結晶化	温度: 290 K / 手法: 蒸発脱水法 / pH: 6 / 詳細: 12% w/v PEG 6,000, 0.1 M MES, pH 6.0

-
データ収集

回折	平均測定温度: 93 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-D / 波長: 1.0332 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年6月21日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.0332 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.497→19.971 Å / Num. obs: 53871 / % possible obs: 92.6 % / 冗長度: 1.66 % / R_merge(I) obs: 0.132 / Net I/σ(I): 4.91
反射シェル	解像度: 3.497→3.7 Å / R_merge(I) obs: 0.63 / Num. unique obs: 11515

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.13_2998: ???)	精密化
XDS		データ削減
XDS		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4NUV

4nuv

解像度: 3.497→19.971 Å / SU ML: 0.46 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 28.32

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2789	2787	5.18 %
R_work	0.2375	-	-
obs	0.2396	53786	99.64 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.497→19.971 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	24623	0	5	20	24648

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	25173
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.777	33995
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.232	15177
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.045	3599
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	4357

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.4975-3.5575	0.3636	123	0.3134	2454	X-RAY DIFFRACTION	96
3.5575-3.6218	0.3412	156	0.2981	2519	X-RAY DIFFRACTION	100
3.6218-3.691	0.3102	141	0.299	2534	X-RAY DIFFRACTION	100
3.691-3.7659	0.2963	131	0.2788	2529	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7659-3.8472	0.3124	139	0.2719	2544	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8472-3.936	0.2912	136	0.2827	2552	X-RAY DIFFRACTION	100
3.936-4.0337	0.3287	137	0.2639	2532	X-RAY DIFFRACTION	100
4.0337-4.1418	0.3123	125	0.2597	2535	X-RAY DIFFRACTION	100
4.1418-4.2625	0.2358	148	0.2385	2578	X-RAY DIFFRACTION	100
4.2625-4.3987	0.2806	163	0.2415	2500	X-RAY DIFFRACTION	100
4.3987-4.5541	0.2779	165	0.2218	2510	X-RAY DIFFRACTION	100
4.5541-4.7341	0.2949	127	0.2155	2585	X-RAY DIFFRACTION	100
4.7341-4.9465	0.2541	139	0.2053	2559	X-RAY DIFFRACTION	100
4.9465-5.2029	0.2616	142	0.213	2537	X-RAY DIFFRACTION	100
5.2029-5.5224	0.2433	136	0.2238	2566	X-RAY DIFFRACTION	100
5.5224-5.9384	0.2923	128	0.2253	2577	X-RAY DIFFRACTION	100
5.9384-6.5171	0.2916	150	0.2449	2559	X-RAY DIFFRACTION	100
6.5171-7.4175	0.2518	122	0.2373	2597	X-RAY DIFFRACTION	100
7.4175-9.1911	0.2375	132	0.2039	2588	X-RAY DIFFRACTION	99
9.1911-19.9712	0.2623	147	0.2071	2644	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.3766	-0.8491	-0.1963	2.6868	-0.5549	2.631	-0.5318	0.8532	0.0711	-0.9849	0.0012	-0.558	0.8978	-0.979	0.2521	1.3539	-0.2248	0.1855	1.204	-0.1384	0.5844	-6.3329	-15.9484	17.0348
2	1.9477	-1.498	-1.0924	3.1032	-1.0257	1.4604	0.02	0.7377	0.4099	-0.5113	-0.2034	-0.3495	0.2252	0.0169	0.2339	0.9643	-0.0582	0.14	0.8082	0.0551	0.5392	6.0945	-4.5868	20.5876
3	3.4641	-1.154	-0.5269	3.0064	-0.1004	1.5131	0.3656	-0.1523	-0.0739	-1.1017	0.1961	0.2915	0.5578	-0.6468	0.0716	1.0103	-0.0165	0.1409	0.8188	0.0452	0.3891	-7.1853	-3.24	24.2541
4	2.6772	-0.9169	0.5004	4.113	-1.1547	1.4491	0.0782	0.5086	-0.289	-0.371	-0.1617	0.0673	0.112	0.0493	0.1995	0.9082	-0.0833	0.1505	0.782	0.0223	0.5191	4.4545	-3.4577	28.705
5	4.8237	0.0229	0.72	2.2062	0.389	0.2692	-0.4515	1.3275	1.018	-0.5065	-0.0148	0.3532	0.0448	0.2287	0.1645	0.9837	-0.1436	-0.0425	0.8165	0.1245	0.6509	-19.2538	-15.5363	24.2452
6	5.2544	-0.2523	0.4656	1.1422	0.2116	0.5566	0.4696	1.0465	-1.1935	-1.1152	0.3657	1.7159	0.8414	0.0466	0.0662	1.1057	0.0507	-0.0747	1.4283	-0.0411	1.2789	-43.1729	-28.6125	16.2523
7	4.6207	0.672	0.4258	1.4248	0.0116	0.0369	-0.2548	0.3857	-0.1531	0.0153	0.0841	0.1416	-0.0676	-0.1049	0.0549	0.9924	-0.0993	0.0377	0.6494	0.1061	0.52	-15.4834	-20.5867	31.3392
8	5.4145	-1.186	-0.1241	2.8159	-0.0478	2.4923	0.0188	-0.2912	-0.4913	-0.6693	0.0461	-0.261	0.1481	-0.9931	0.0242	1.0147	-0.172	0.1484	0.7573	0.1432	0.6439	-29.1697	-25.6122	28.5264
9	7.4397	4.4735	-3.183	4.6313	-1.3598	2.6143	-0.8529	0.4883	2.2466	-1.8058	0.5671	0.5751	-0.7212	0.2974	0.2569	1.5378	-0.0095	0.1597	0.8493	0.3873	1.1408	7.9796	35.3135	19.6153
10	2.845	-0.0767	-0.6211	2.7604	0.5219	4.842	0.1414	0.1705	-0.153	0.547	-0.4859	-0.4776	-1.2872	0.8329	0.0568	1.1078	-0.5111	0.0021	1.1283	0.2866	0.6634	4.3897	25.0927	22.851
11	2.8424	0.3034	0.791	1.9618	1.2691	0.8122	0.3272	0.3861	0.9989	0.1545	0.6126	0.075	0.4133	1.0615	-0.4177	1.1502	-0.3543	0.1831	1.2069	0.1627	0.8884	16.0873	21.2499	20.6852
12	1.4923	0.4827	0.3358	1.8831	0.1607	3.474	0.2314	0.5439	0.3272	0.2229	0.0149	-0.3348	-1.0478	0.7169	-0.0993	1.2728	-0.1733	0.0533	0.9884	0.1454	0.6966	9.2787	26.2434	20.5564
13	0.5887	1.6004	0.9323	4.1823	-1.3748	3.3426	0.1396	0.9181	0.3308	-1.3637	-0.1766	-0.4683	0.2401	0.5534	0.0457	1.3735	-0.1659	0.2003	1.3982	0.1697	0.6048	7.9155	13.6881	3.3887
14	-0.0998	-0.6799	0.1305	6.405	0.1764	0.0394	-0.2861	1.1872	0.4424	-0.228	-0.2122	-0.1394	-0.3176	0.1517	0.2042	1.8509	-0.0257	0.0721	1.3565	0.3351	0.7304	2.6596	16.4687	-4.2061
15	1.7878	-0.4824	0.4456	0.73	0.6202	1.7084	-0.17	0.1698	0.451	-0.4909	-0.0756	-0.1523	-0.1243	0.0062	0.0573	1.1141	-0.2339	0.2059	1.4001	0.2517	0.8271	13.9275	15.9985	8.1272
16	3.8329	1.8445	0.4048	1.5077	0.0987	3.1486	-0.2105	-0.0315	0.4256	0.4096	-0.1633	-0.1334	-0.7143	0.4367	0.3664	1.0837	0.0709	-0.1064	0.4666	0.0762	0.9708	-10.2858	29.8122	52.5331
17	5.0948	1.6946	-3.6133	2.3881	-1.023	7.3261	0.0852	0.299	0.4718	-0.0284	-0.0594	0.0295	-0.3394	0.0546	-0.0695	0.5064	0.0323	-0.0373	0.3353	0.0383	0.6197	-6.4467	20.6567	56.2915
18	6.2422	0.2578	-0.6389	1.6388	-0.6356	0.6571	0.1725	0.2092	-0.1591	0.0948	-0.2295	0.5597	0.026	-0.1278	0.0654	0.9116	0.0009	-0.0867	0.5599	-0.0971	0.7496	-33.9687	15.8785	45.9732
19	1.9895	-0.0522	4.7667	3.6453	1.1272	7.7578	-0.398	-0.4655	0.4245	1.2388	0.2165	-0.2999	-0.1347	0.89	-0.0862	1.0171	0.0306	-0.0061	0.8537	0.0123	0.4824	14.2203	16.455	89.1399
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62	5.3483	0.8564	-0.239	8.411	-1.9354	8.4998	0.6014	-0.4414	-1.0787	-0.1491	-0.3876	-0.6553	1.7332	-0.1634	-0.1701	0.6866	-0.103	-0.1125	0.4963	0.0815	0.8271	-62.8045	-54.2431	77.6993
63	1.555	2.4916	-3.0057	7.0915	-2.615	6.7643	-0.4217	-1.1694	-1.3341	0.955	0.3756	-0.8428	0.5211	-0.1704	-0.1334	0.8659	-0.0956	0.0081	0.5096	0.1097	0.9734	-64.8931	-55.7602	84.4851
64	5.2784	1.0472	-0.3682	7.031	-2.1127	6.0332	0.1052	-0.4042	-0.8245	-0.1916	0.1523	0.5959	1.7735	-1.183	-0.6549	0.7767	-0.2141	0.1096	0.818	0.1882	0.8419	-73.5633	-55.071	77.8358
65	5.2567	-0.7112	-0.6243	6.048	-0.7051	5.7517	-0.1365	-0.7322	0.911	-0.451	0.1653	-0.1359	-1.7708	-0.9137	-0.0685	1.1343	0.3742	0.0384	0.8287	-0.1607	0.6718	-61.7072	3.2457	76.2187
66	5.3369	-2.3967	-1.2357	3.3346	-2.7459	5.8712	-0.03	-0.001	-0.1215	0.2009	0.2012	0.153	-0.3729	-0.6028	-0.1837	0.6308	0.088	-0.05	0.4188	-0.1469	0.4772	-71.1643	-1.3131	66.1686
67	2.7883	-0.0825	-0.6394	3.9601	-2.1706	3.3502	-0.1716	-0.4532	-0.1646	0.329	0.0149	0.0037	-0.1218	0.1552	0.1847	0.4527	0.0417	-0.0681	0.571	-0.0543	0.4676	-72.423	-7.8868	62.9328
68	6.9213	4.1534	0.549	4.5816	0.6956	3.1074	0.1304	-0.0781	0.4195	0.0551	0.0313	-0.4702	-0.197	0.4091	-0.1583	0.427	0.1126	0.004	0.4415	0.0071	0.5843	-42.53	-1.6783	71.1
69	4.7762	-1.8259	-1.2909	3.694	-0.6404	3.9594	0.1188	0.2326	0.1741	-0.8087	-0.4775	0.7812	-0.9529	-1.1077	0.3802	0.7258	0.154	-0.3075	0.8449	-0.1968	0.8889	-91.0463	8.6458	43.0187
70	2.8849	-0.4497	0.932	1.9654	1.3262	3.9314	-0.3117	0.1164	-0.408	-0.6405	-0.3788	1.451	0.0588	-1.3747	0.7926	0.88	0.1511	-0.3978	1.0224	-0.3074	1.1455	-93.0583	5.6368	45.2959
71	4.032	-2.1977	-0.0186	4.2678	-0.3695	3.939	-0.5107	-1.663	1.3705	0.5791	-0.7021	2.0939	0.3246	-0.7437	0.5089	1.002	0.3513	-0.0657	0.9385	-0.2691	1.284	-95.7797	21.9783	63.9014
72	4.2667	-2.7504	-1.0466	8.2372	1.4961	4.5153	-0.2224	-0.2768	0.4025	0.0134	0.1703	0.9035	0.2075	-0.6615	0.2381	0.3741	-0.0415	-0.1345	0.6434	-0.0882	0.7407	-85.971	16.1765	62.3719
73	4.8243	-3.7439	-0.7022	3.0913	0.2027	2.7392	-0.5158	0.5025	0.3318	-1.4113	0.4481	1.4403	-0.5711	-0.6634	0.1898	0.6557	0.0454	-0.229	0.8341	-0.1212	0.7256	-89.9584	21.5199	59.6928
74	3.4475	-1.5605	-0.2625	3.2392	1.5371	2.7991	-0.2276	-0.4671	-0.6641	-0.0917	0.0014	1.7234	0.0239	-0.7615	0.5437	0.5785	-0.0052	-0.0427	0.9307	-0.2073	1.3203	-95.4539	12.0452	60.0397

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 216 through 235 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 236 through 290 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 291 through 314 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 315 through 387 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 388 through 415 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 416 through 429 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 430 through 486 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 487 through 508 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 5 through 21 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 22 through 43 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 44 through 71 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 72 through 121 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 122 through 214 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 215 through 229 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 230 through 252 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 216 through 271 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 272 through 387 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 388 through 508 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 5 through 21 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 22 through 43 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 44 through 121 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 122 through 167 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 168 through 220 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 221 through 237 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 238 through 252 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 215 through 234 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 235 through 270 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'E' and (resid 271 through 336 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'E' and (resid 337 through 415 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'E' and (resid 416 through 429 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'E' and (resid 430 through 508 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 5 through 63 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 64 through 101 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 102 through 124 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'F' and (resid 125 through 177 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'F' and (resid 178 through 220 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'F' and (resid 221 through 237 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'F' and (resid 238 through 252 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'G' and (resid 216 through 270 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'G' and (resid 271 through 314 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'G' and (resid 315 through 387 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'G' and (resid 388 through 508 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resid 3 through 35 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'H' and (resid 36 through 53 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resid 54 through 121 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resid 122 through 220 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'H' and (resid 221 through 237 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'H' and (resid 238 through 252 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'I' and (resid 216 through 235 )
50	X-RAY DIFFRACTION	50	chain 'I' and (resid 236 through 251 )
51	X-RAY DIFFRACTION	51	chain 'I' and (resid 252 through 270 )
52	X-RAY DIFFRACTION	52	chain 'I' and (resid 271 through 314 )
53	X-RAY DIFFRACTION	53	chain 'I' and (resid 315 through 361 )
54	X-RAY DIFFRACTION	54	chain 'I' and (resid 362 through 415 )
55	X-RAY DIFFRACTION	55	chain 'I' and (resid 416 through 429 )
56	X-RAY DIFFRACTION	56	chain 'I' and (resid 430 through 508 )
57	X-RAY DIFFRACTION	57	chain 'J' and (resid 5 through 35 )
58	X-RAY DIFFRACTION	58	chain 'J' and (resid 36 through 53 )
59	X-RAY DIFFRACTION	59	chain 'J' and (resid 54 through 65 )
60	X-RAY DIFFRACTION	60	chain 'J' and (resid 66 through 123 )
61	X-RAY DIFFRACTION	61	chain 'J' and (resid 124 through 167 )
62	X-RAY DIFFRACTION	62	chain 'J' and (resid 168 through 220 )
63	X-RAY DIFFRACTION	63	chain 'J' and (resid 221 through 237 )
64	X-RAY DIFFRACTION	64	chain 'J' and (resid 238 through 252 )
65	X-RAY DIFFRACTION	65	chain 'K' and (resid 215 through 234 )
66	X-RAY DIFFRACTION	66	chain 'K' and (resid 235 through 314 )
67	X-RAY DIFFRACTION	67	chain 'K' and (resid 315 through 387 )
68	X-RAY DIFFRACTION	68	chain 'K' and (resid 388 through 508 )
69	X-RAY DIFFRACTION	69	chain 'L' and (resid 5 through 58 )
70	X-RAY DIFFRACTION	70	chain 'L' and (resid 59 through 121 )
71	X-RAY DIFFRACTION	71	chain 'L' and (resid 122 through 167 )
72	X-RAY DIFFRACTION	72	chain 'L' and (resid 168 through 220 )
73	X-RAY DIFFRACTION	73	chain 'L' and (resid 221 through 237 )
74	X-RAY DIFFRACTION	74	chain 'L' and (resid 238 through 252 )

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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