PDB-5ng1: TUBULIN-MTC-zampanolide complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ng1

タイトル

TUBULIN-MTC-zampanolide complex

要素

Stathmin-4
Tubulin alpha-1B chain
Tubulin beta-2B chain
Tubulin-Tyrosine Ligase

キーワード

CELL CYCLE / TUBULIN FOLD / CYTOSKELETON / MICROTUBULE

機能・相同性

機能・相同性情報

tubulin-tyrosine ligase activity / positive regulation of axon guidance / microtubule depolymerization / microtubule-based process / regulation of microtubule polymerization or depolymerization / tubulin binding / spindle microtubule / 加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 / protein modification process / structural constituent of cytoskeleton ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Rattus norvegicus (ドブネズミ)

Gallus gallus (ニワトリ)

Bos taurus (ウシ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

フーリエ合成 / 解像度: 2.2 Å

データ登録者

Field, J.J. / Pera, B. / Estevez Gallego, J. / Calvo, E. / Rodriguez-Salarichs, J. / Saez-Calvo, G. / Zuwerra, D. / Jordi, M. / Prota, A.E. / Menchon, G. ...

引用

ジャーナル: J. Nat. Prod. / 年: 2018
タイトル: Zampanolide Binding to Tubulin Indicates Cross-Talk of Taxane Site with Colchicine and Nucleotide Sites.
著者: Field, J.J. / Pera, B. / Gallego, J.E. / Calvo, E. / Rodriguez-Salarichs, J. / Saez-Calvo, G. / Zuwerra, D. / Jordi, M. / Andreu, J.M. / Prota, A.E. / Menchon, G. / Miller, J.H. / Altmann, K.H. / Diaz, J.F.

履歴

登録	2017年3月16日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2017年10月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年4月4日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.year
改定 1.2	2018年5月2日	Group: Data collection / カテゴリ: reflns / Item: _reflns.pdbx_Rpim_I_all
改定 1.3	2024年1月17日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5ng1.cif.gz	922.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5ng1.ent.gz	756.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5ng1.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ng/5ng1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ng/5ng1	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5nfzC 4i4tS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4o4i-d 7dad-d 6knz-d 5jh7-d 6bry-d 5cb4-d 4tv9-d 5jvd-d 6fkj-d 5ezy-d 5nfz-d 7dae-d 4zhq-d 5h7o-d 5gon-d 5lxt-d 5xke-d 5iyz-d 5xiw-d 6eg5-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#175 - 2014年7月微小管 (Microtubules) 類似性 (28) #176 - 2014年8月ダイニン (Dynein) 類似性 (19) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (19) #118 - 2009年10月ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump) 類似性 (1) #168 - 2013年12月 DNAヘリカーゼ (DNA Helicase) 類似性 (1) #195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#175 - 2014年7月
微小管 (Microtubules)
類似性 (28)
#176 - 2014年8月
ダイニン (Dynein)
類似性 (19)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (19)
#118 - 2009年10月
ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump)
類似性 (1)
#168 - 2013年12月
DNAヘリカーゼ (DNA Helicase)
類似性 (1)
#195 - 2016年3月
RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Tubulin alpha-1B chain

B: Tubulin beta-2B chain

C: Tubulin alpha-1B chain

D: Tubulin beta-2B chain

E: Stathmin-4

F: Tubulin-Tyrosine Ligase

ヘテロ分子

266 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: equilibrium centrifugation

単位格子

Length a, b, c (Å)	104.237, 157.418, 178.858
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

#1: タンパク質	Tubulin alpha-1B chain / Alpha-tubulin ubiquitous / Tubulin K-alpha-1 / Tubulin alpha-ubiquitous chain 分子量: 50204.445 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 器官: Brain / 参照: UniProt: P81947
#2: タンパク質	Tubulin beta-2B chain 分子量: 49999.887 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 器官: Brain / 参照: UniProt: Q6B856
#3: タンパク質	Stathmin-4 / Stathmin-like protein B3 / RB3 分子量: 16844.162 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 遺伝子: Stmn4 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63043
#4: タンパク質	Tubulin-Tyrosine Ligase 分子量: 44378.496 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: TTL / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: E1BQ43

-
非ポリマー , 11種, 588分子

#5: 化合物	ChemComp-GTP / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP 分子量: 523.180 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₄P₃ / コメント: GTP, エネルギー貯蔵分子*YM
#6: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#7: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#8: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#9: 化合物	ChemComp-8WB / 2-methoxy-5-(2,3,4-trimethoxyphenyl)cyclohepta-2,4,6-trien-1-one / 2-メトキシ-5-(2,3,4-トリメトキシフェニル)-2,4,6-シクロヘプタトリエン-1-オン分子量: 302.322 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₇H₁₈O₅
#10: 化合物	ChemComp-8WE / (2~{Z},4~{E})-~{N}-[(~{S})-oxidanyl-[(1~{S},2~{E},5~{S},11~{R},17~{S},19~{R})-3,11,19-trimethyl-7,13-bis(oxidanylidene)-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicos-2-en-5-yl]methyl]hexa-2,4-dienamide 分子量: 503.671 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₉H₄₅NO₆
#11: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#12: 化合物	ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸分子量: 195.237 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#13: 化合物	ChemComp-ZPN / (2Z,4E)-N-[(S)-[(1S,2E,5S,8E,10Z,17S)-3,11-dimethyl-19-methylidene-7,13-dioxo-6,21-dioxabicyclo[15.3.1]henicosa-2,8,10-trien-5-yl](hydroxy)methyl]hexa-2,4-dienamide / (-)-ZAMPANOLIDE (Bound form) 分子量: 497.623 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₉H₃₉NO₆
#14: 化合物	ChemComp-ACP / PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER / ADENOSINE-5'-[BETA, GAMMA-METHYLENE]TRIPHOSPHATE / β,γ-メチレンATP 分子量: 505.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₈N₅O₁₂P₃ コメント: AMP-PCP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM
#15: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 570 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.8 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.14 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 6.7 詳細: 5% PEG 4K, 12-14% glycerol, 30 mM MgCl2, 30 mM CaCl2, 100 mM MES/Imidazole, pH 6.7

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X06DA / 波長: 1.00003 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 2 / 検出器: PIXEL / 日付: 2016年10月18日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.00003 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.2→47.69 Å / Num. obs: 149309 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 6.7 % / CC_1/2: 0.999 / R_merge(I) obs: 0.107 / R_pim(I) all: 0.046 / Net I/σ(I): 13.4
反射シェル	解像度: 2.2→2.26 Å / 冗長度: 6.5 % / R_merge(I) obs: 2.047 / Mean I/σ(I) obs: 0.9 / Num. unique obs: 11007 / CC_1/2: 0.291 / R_pim(I) all: 0.922 / % possible all: 99.8

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(dev_2420: ???)	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

フーリエ合成
開始モデル: 4I4T

4i4t

解像度: 2.2→47.686 Å / SU ML: 0.29 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 23.72

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2198	7478	5.01 %
R_work	0.1729	-	-
obs	0.1753	149309	99.95 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.2→47.686 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17458	0	292	570	18320

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008	18191
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.957	24662
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	21.4	6777
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.079	2675
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	3184

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.2-2.225	0.3419	275	0.3119	4612	X-RAY DIFFRACTION	99
2.225-2.2512	0.3737	252	0.297	4665	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2512-2.2786	0.3251	248	0.2787	4677	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2786-2.3075	0.3206	245	0.2735	4676	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3075-2.3378	0.3284	233	0.2671	4689	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3378-2.3699	0.2852	269	0.2542	4702	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3699-2.4037	0.3227	224	0.2528	4667	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4037-2.4396	0.3118	228	0.2478	4709	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4396-2.4777	0.2988	258	0.2329	4704	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4777-2.5183	0.2965	262	0.2354	4681	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5183-2.5618	0.2791	271	0.2107	4655	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5618-2.6083	0.263	250	0.1985	4686	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6083-2.6585	0.2724	220	0.1966	4733	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6585-2.7128	0.269	235	0.2002	4709	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7128-2.7717	0.2664	251	0.1984	4709	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7717-2.8362	0.238	234	0.1922	4730	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8362-2.9071	0.2552	229	0.1904	4721	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9071-2.9857	0.2517	235	0.1845	4733	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9857-3.0736	0.2446	263	0.1757	4704	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0736-3.1727	0.2251	240	0.1764	4715	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1727-3.2861	0.2195	274	0.1744	4702	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2861-3.4177	0.2378	250	0.1705	4720	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4177-3.5731	0.2087	281	0.1604	4734	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5731-3.7615	0.1921	253	0.1538	4736	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7615-3.997	0.1825	269	0.1417	4739	X-RAY DIFFRACTION	100
3.997-4.3054	0.1747	219	0.138	4783	X-RAY DIFFRACTION	100
4.3054-4.7384	0.1588	248	0.1205	4827	X-RAY DIFFRACTION	100
4.7384-5.4232	0.1795	259	0.1395	4796	X-RAY DIFFRACTION	100
5.4232-6.8294	0.2137	229	0.1754	4878	X-RAY DIFFRACTION	100
6.8294-47.6975	0.1925	274	0.1668	5039	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.1167	-0.1527	-0.388	0.8839	-0.2856	1.0142	0.1878	0.1378	0.1447	-0.2362	0.0066	0.0505	-0.4323	0.1247	0.0001	0.5638	0.0051	0.0989	0.3979	-0.0746	0.4378	27.8642	96.2298	50.7035
2	0.5642	-0.4241	-0.3865	1.3388	0.0955	0.8437	0.0891	0.0365	-0.0049	-0.0302	0.085	-0.1674	-0.0753	0.2128	0.0001	0.3274	-0.0346	0.0517	0.3872	-0.1614	0.3895	34.4965	78.498	52.8857
3	0.8592	-0.3338	0.1176	0.9994	0.1829	1.449	0.1903	0.1123	-0.0109	0.1687	-0.0535	0.0208	-0.187	0.0028	-0.0001	0.3626	0.0373	0.0601	0.332	-0.1004	0.3872	20.7769	84.4104	64.0123
4	0.352	0.0476	-0.2335	0.0725	0.1884	0.6499	0.458	-0.0741	-0.0981	0.3434	-0.3291	0.6273	0.2942	-0.5244	0.0088	0.4662	0.0203	0.1757	0.422	-0.1504	0.5883	8.858	84.5214	71.0161
5	0.6233	0.5001	0.2662	1.6035	0.2188	0.9823	0.0494	-0.1423	0.1128	0.4956	-0.0049	0.1166	-0.0787	-0.0726	0.0003	0.5256	0.0061	0.1236	0.388	-0.1277	0.3442	18.7363	83.2889	72.7817
6	0.8082	0.4465	-0.142	0.6473	-0.1824	0.0636	0.0588	0.0362	-0.1224	0.3371	0.1671	-0.0807	0.3281	0.3093	-0.0001	0.4487	0.0933	-0.0241	0.3024	-0.1199	0.4302	31.9442	62.2216	62.4897
7	1.0774	-0.0595	-0.4633	0.4441	-0.62	0.8888	0.1519	0.2086	0.4165	-0.3315	-0.2151	0.1929	-0.6948	-0.1869	-0	0.5671	0.0758	-0.0432	0.345	-0.0767	0.485	15.7568	72.2475	21.7377
8	0.0198	0.0088	-0.041	-0.0072	0.0156	0.1894	0.1072	0.5479	0.0022	-0.8225	-0.2226	0.1202	-0.343	-0.0718	-0.0004	0.5109	0.0703	-0.0776	0.4105	-0.0788	0.4651	17.5666	62.4085	10.882
9	0.1112	-0.1922	-0.1985	0.1791	0.2102	0.4997	0.0735	0.4011	-0.0986	-0.3305	0.0541	-0.0841	-0.2426	0.2922	0.0001	0.3465	-0.0621	0.0431	0.3833	-0.0661	0.3267	29.1452	56.0434	14.1803
10	0.7755	-0.5129	-0.2243	1.2425	0.6919	2.1202	0.0165	-0.0436	-0.056	-0.0464	-0.1146	0.0349	-0.1684	-0.1333	-0.0043	0.2223	0.0169	0.0124	0.3392	-0.1462	0.3349	17.551	53.176	26.1598
11	0.1677	-0.1437	-0.1751	0.2164	-0.0228	0.2129	0.0653	-0.2197	0.3123	0.3103	-0.1184	-0.1739	-0.2575	0.0615	-0.0642	0.3738	0.0277	0.0733	0.3088	-0.2436	0.4805	20.3337	64.5498	39.0791
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13	0.353	-0.5047	0.0276	0.5992	-0.1959	0.0941	-0.7274	-0.6947	0.4922	0.6811	0.2823	-0.2778	-0.4796	-1.1732	-0.3305	0.5942	0.2754	0.0211	0.8272	-0.2745	0.5094	4.6526	64.8027	46.3789
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16	-0.1005	0.2636	0.0006	0.6633	0.2719	0.2601	-0.0107	-0.1378	-0.2686	0.4104	0.0788	-0.175	0.5622	0.693	0.0022	0.3527	0.0083	-0.0388	0.4077	-0.0387	0.2973	25.9872	38.0408	30.7469
17	1.3884	-0.1696	-0.0785	1.7395	0.2393	1.4418	0.0015	0.1755	0.0562	-0.1821	0.0436	-0.0295	-0.106	0.124	-0.0001	0.2167	-0.0653	0.0253	0.2904	-0.0558	0.2406	20.4746	32.7822	-11.9651
18	1.0433	-0.5187	0.0606	1.3836	0.9357	1.4189	-0.0292	-0.0106	0.036	0.0969	-0.0434	0.0668	0.0802	-0.1566	-0.0003	0.1998	-0.0531	0.0319	0.254	-0.0414	0.2556	8.0502	25.7201	3.1181
19	0.9667	-0.119	0.137	0.409	-0.3608	0.6495	-0.1832	0.4447	0.2767	-0.1927	0.2665	-0.0712	-0.2134	-0.0332	-0	0.5183	-0.1396	0.0295	0.6811	-0.0224	0.4228	15.5071	12.2064	-41.709
20	0.7781	-0.122	-0.0318	0.5822	-0.4892	0.8095	-0.2415	0.5177	-0.0534	-0.3731	0.3286	-0.2512	0.0374	0.3521	-0.0042	0.5122	-0.111	0.1268	0.7522	-0.2302	0.4456	29.3203	1.0784	-42.8473
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22	0.8425	-0.0772	-0.6158	0.6279	0.028	1.0377	-0.1421	0.3905	0.0198	-0.1364	0.2475	-0.1182	0.0647	-0.1505	-0.0002	0.3797	-0.0718	0.0149	0.516	-0.1221	0.3533	13.3577	1.1965	-29.8427
23	0.1009	-0.0074	-0.1076	0.1977	0.2692	0.3652	0.0929	0.057	-0.0922	0.1295	0.0124	0.1087	0.423	-0.4942	0.0003	0.4497	-0.1446	-0.0204	0.6591	-0.1502	0.4281	-0.9904	-3.4042	-28.3695
24	0.8767	0.2688	-0.2413	0.5899	-0.1	1.554	-0.137	0.1779	-0.0674	-0.0214	0.2016	0.1127	0.2287	-0.2305	0.001	0.4186	-0.0338	0.0058	0.4045	-0.0908	0.3826	8.5452	-3.103	-21.1327
25	1.0357	-0.361	-0.2128	0.8645	0.0702	0.5062	-0.3797	-0.2755	-1.0041	0.4531	0.0723	-0.1101	0.8531	0.7115	-0.0886	0.5695	0.1104	0.0521	0.4801	-0.2678	0.6901	30.2529	-17.1454	-24.6356
26	1.4198	0.0757	0.0425	0.0384	0.1607	-0.009	0.0412	-0.0231	0.4325	0.4792	0.0472	-0.2711	0.0318	0.0965	0.0269	0.9257	-0.0939	0.0314	0.4706	-0.16	0.4786	27.2299	92.9074	81.3325
27	0.092	-0.0739	-0.1081	0.1604	0.038	0.0642	-0.1006	0.0088	0.0029	0.2281	0.2948	-0.1454	0.3211	0.486	0.0054	0.3283	0.0385	0.0367	0.5768	-0.2605	0.4871	43.0663	27.879	3.9283
28	1.2464	0.3451	-0.9745	0.2095	-0.2733	0.6275	-0.4465	0.3234	-0.3432	-0.1436	-0.0555	-0.1817	0.8809	0.0586	-0.1373	0.7518	-0.0997	0.1322	0.4474	-0.1311	0.469	7.7896	56.4995	73.8052
29	0.433	0.3251	-0.1059	0.3662	0.3297	0.3753	0.0496	-0.5559	0.0301	0.3046	-0.0874	-0.4429	0.0106	0.9416	0.0023	0.6429	0.1114	-0.1167	1.0313	0.0687	0.7272	18.5218	58.7493	105.8574
30	1.2124	-0.0326	-0.6876	0.1222	0.2917	0.4728	-0.2554	-0.0673	-0.3853	0.0024	0.0682	-0.1143	0.8315	-0.1106	-0.0143	0.7579	-0.0242	0.1101	0.2745	0.0718	0.5333	-1.8257	53.4427	96.3851
31	0.1141	0.067	-0.0727	0.0276	-0.0431	0.018	-0.2918	0.3106	-0.3105	-0.2175	0.6526	-0.6111	0.163	0.195	-0.0004	1.3577	0.3225	0.0498	0.9436	0.1821	1.2674	8.197	41.6949	105.8333
32	1.2737	-0.2081	-0.3998	0.1703	0.4322	1.3647	-0.22	0.0372	-0.4355	0.0281	0.1397	-0.0571	0.5324	-0.0468	-0.013	0.7328	0.0155	0.1251	0.2954	0.0313	0.5151	-1.7849	55.5838	95.4133
33	0.0829	0.0334	0.015	0.0068	-0.005	0.1861	-0.3162	0.5617	-0.5386	0.0444	0.3719	0.1349	0.8534	-0.6245	-0.0003	0.7211	-0.253	0.0724	0.7043	-0.0899	0.6898	-7.548	56.1291	79.2076

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 88 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 89 through 199 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 200 through 273 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 274 through 311 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 312 through 401 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 402 through 440 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 1 through 64 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 65 through 88 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 89 through 127 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 128 through 238 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 239 through 266 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 267 through 311 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 312 through 338 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 339 through 372 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 373 through 401 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 402 through 438 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 1 through 199 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 200 through 440 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 1 through 64 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 65 through 160 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 161 through 214 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 215 through 266 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 267 through 295 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 296 through 399 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 400 through 441 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resid 6 through 46 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resid 47 through 143 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 1 through 83 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 84 through 184 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 185 through 223 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 224 through 248 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 249 through 339 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 340 through 380 )

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