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- PDB-5ndf: Small-molecule inhibition of ppGalNAc-Ts selectively reduces muci... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5ndf | |||||||||
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Title | Small-molecule inhibition of ppGalNAc-Ts selectively reduces mucin-type O-glycosylation | |||||||||
![]() | Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 | |||||||||
![]() | TRANSFERASE / GalNAc-T2 Inhibition Flavonoids Mucin-type O-glycosylation Alzheimer disease | |||||||||
Function / homology | ![]() protein O-linked glycosylation via threonine / protein O-linked glycosylation via serine / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity / O-glycan processing / O-linked glycosylation of mucins / Golgi stack / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / protein O-linked glycosylation / Golgi cisterna membrane ...protein O-linked glycosylation via threonine / protein O-linked glycosylation via serine / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity / O-glycan processing / O-linked glycosylation of mucins / Golgi stack / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / protein O-linked glycosylation / Golgi cisterna membrane / protein maturation / manganese ion binding / carbohydrate binding / Golgi membrane / endoplasmic reticulum membrane / perinuclear region of cytoplasm / Golgi apparatus / extracellular region / membrane Similarity search - Function | |||||||||
Biological species | ![]() | |||||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | |||||||||
![]() | Hurtado-Guerrero, R. / De las Rivas, M. | |||||||||
Funding support | ![]()
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![]() | ![]() Title: The small molecule luteolin inhibits N-acetyl-alpha-galactosaminyltransferases and reduces mucin-type O-glycosylation of amyloid precursor protein. Authors: Liu, F. / Xu, K. / Xu, Z. / de Las Rivas, M. / Wang, C. / Li, X. / Lu, J. / Zhou, Y. / Delso, I. / Merino, P. / Hurtado-Guerrero, R. / Zhang, Y. / Wu, F. | |||||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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PDBx/mmCIF format | ![]() | 624.4 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 507.8 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 3 MB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 3 MB | Display | |
Data in XML | ![]() | 115.9 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 156.9 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 2ffvS S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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5 | ![]()
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: LYS / Beg label comp-ID: LYS / Refine code: _
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