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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ndf | |||||||||
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タイトル | Small-molecule inhibition of ppGalNAc-Ts selectively reduces mucin-type O-glycosylation | |||||||||
要素 | Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2 | |||||||||
キーワード | TRANSFERASE / GalNAc-T2 Inhibition Flavonoids Mucin-type O-glycosylation Alzheimer disease | |||||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 protein O-linked glycosylation via threonine / protein O-linked glycosylation via serine / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity / O-glycan processing / O-linked glycosylation of mucins / Golgi stack / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / protein O-linked glycosylation / Golgi cisterna membrane ...protein O-linked glycosylation via threonine / protein O-linked glycosylation via serine / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase / polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase activity / O-glycan processing / O-linked glycosylation of mucins / Golgi stack / COPI-independent Golgi-to-ER retrograde traffic / protein O-linked glycosylation / Golgi cisterna membrane / protein maturation / manganese ion binding / carbohydrate binding / Golgi membrane / endoplasmic reticulum membrane / perinuclear region of cytoplasm / Golgi apparatus / extracellular region / membrane 類似検索 - 分子機能 | |||||||||
生物種 | Homo sapiens (ヒト) | |||||||||
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.3 Å | |||||||||
データ登録者 | Hurtado-Guerrero, R. / De las Rivas, M. | |||||||||
資金援助 | スペイン, 2件
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引用 | ジャーナル: J. Biol. Chem. / 年: 2017 タイトル: The small molecule luteolin inhibits N-acetyl-alpha-galactosaminyltransferases and reduces mucin-type O-glycosylation of amyloid precursor protein. 著者: Liu, F. / Xu, K. / Xu, Z. / de Las Rivas, M. / Wang, C. / Li, X. / Lu, J. / Zhou, Y. / Delso, I. / Merino, P. / Hurtado-Guerrero, R. / Zhang, Y. / Wu, F. | |||||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 5ndf.cif.gz | 624.4 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb5ndf.ent.gz | 507.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 5ndf.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 5ndf_validation.pdf.gz | 3 MB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 5ndf_full_validation.pdf.gz | 3 MB | 表示 | |
XML形式データ | 5ndf_validation.xml.gz | 115.9 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 5ndf_validation.cif.gz | 156.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nd/5ndf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/nd/5ndf | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | 2ffvS S: 精密化の開始モデル |
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類似構造データ |
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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非結晶学的対称性 (NCS) | NCSドメイン:
NCSドメイン領域: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: LYS / Beg label comp-ID: LYS / Refine code: _
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