PDB-4kn2: Human folate receptor beta (FOLR2) in complex with antifolate pem...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4kn2

タイトル

Human folate receptor beta (FOLR2) in complex with antifolate pemetrexed

要素

Folate receptor beta

キーワード

MEMBRANE PROTEIN / Folate Receptor Beta / FOLR2 / folate receptor / Folic acid / folates / 5-methyltetrahydrofolate / antifolates / folate-conjugates / GPI-anchored protein on eukaryotic membrane / TRANSPORT PROTEIN

機能・相同性

機能・相同性情報

folic acid receptor activity / sperm-egg recognition / folic acid transport / fusion of sperm to egg plasma membrane involved in single fertilization / Post-translational modification: synthesis of GPI-anchored proteins / Metabolism of folate and pterines / folic acid binding / signaling receptor activity / cell adhesion / inflammatory response ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.6 Å

データ登録者

Wibowo, A.S. / Dann III, C.E.

引用

ジャーナル: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / 年: 2013
タイトル: Structures of human folate receptors reveal biological trafficking states and diversity in folate and antifolate recognition.
著者: Wibowo, A.S. / Singh, M. / Reeder, K.M. / Carter, J.J. / Kovach, A.R. / Meng, W. / Ratnam, M. / Zhang, F. / Dann, C.E.

履歴

登録	2013年5月8日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年8月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年10月2日	Group: Database references
改定 1.2	2017年11月15日	Group: Refinement description / カテゴリ: software / Item: _software.name
改定 1.3	2020年7月29日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: chem_comp / entity ...chem_comp / entity / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_nonpoly / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _chem_comp.name / _chem_comp.type ..._chem_comp.name / _chem_comp.type / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.name / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 1.4	2023年9月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.5	2024年11月6日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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文書・詳細版	4kn2_full_validation.pdf.gz	1.1 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kn/4kn2 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/kn/4kn2	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4km6C 4km7C 4kmxC 4kmyC 4kmzSC 4kn0C 4kn1C C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1loe-3 2qxj-d 1yp1-d 1o3g-d 1o3f-d 5izq-8 5tca-6 7bs2-d 1j8a-d 1z3u-3 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#34 - 2002年10月ジヒドロ葉酸還元酵素 (Dihydrofolate Reductase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Folate receptor beta

B: Folate receptor beta

C: Folate receptor beta

ヘテロ分子

74.2 kDa, 3 ポリマー
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1

A: Folate receptor beta

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
24.7 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Folate receptor beta

ヘテロ分子

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3

C: Folate receptor beta

ヘテロ分子

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24.7 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	97.443, 97.443, 348.105
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	98
Space group name H-M	I4₁22

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	B-407- HOH
2	1	B-426- HOH

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	chain A and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )
2	1	chain B and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )
3	1	chain C and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	chain A and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	A	25 - 55
1	2	1	chain A and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	A	57 - 73
1	3	1	chain A and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	A	75 - 112
1	4	1	chain A and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	A	118 - 226
2	1	1	chain B and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	B	25 - 55
2	2	1	chain B and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	B	57 - 73
2	3	1	chain B and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	B	75 - 112
2	4	1	chain B and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	B	118 - 226
3	1	1	chain C and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	C	25 - 55
3	2	1	chain C and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	C	57 - 73
3	3	1	chain C and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	C	75 - 112
3	4	1	chain C and (resseq 25:55 or resseq 57:73 or resseq 75:112 or resseq 118:226 )	C	118 - 226

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.479575, 0.014846, -0.877375), (-0.017043, 0.999826, 0.007603), (0.877335, 0.011307, 0.479745)	38.046398, -16.2132, 21.246099
2	given	(0.503626, 0.018325, -0.863728), (0.023008, -0.999705, -0.007794), (-0.863616, -0.015947, -0.503899)	37.180599, 64.9562, 66.182404

-
タンパク質 / 糖 , 2種, 6分子 ABC

#1: タンパク質

Folate receptor beta / FR-beta / Folate receptor 2 / Folate receptor / fetal/placental / Placental folate-binding protein / FBP

分子量: 24021.988 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: FOLR2 / プラスミド: pSGHV0 / 細胞株 (発現宿主): CHO
発現宿主:

Cricetulus griseus (モンゴルキヌゲネズミ)
参照: UniProt: P14207

#4: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

-
非ポリマー , 4種, 124分子

#2: 化合物	ChemComp-K / POTASSIUM ION 分子量: 39.098 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: K
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION 分子量: 35.453 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 化合物	ChemComp-LYA / 2-{4-[2-(2-AMINO-4-OXO-4,7-DIHYDRO-3H-PYRROLO[2,3-D]PYRIMIDIN-5-YL)-ETHYL]-BENZOYLAMINO}-PENTANEDIOIC ACID / LY231514 分子量: 427.411 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₀H₂₁N₅O₆
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 115 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.91 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.74 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.2 詳細: 1.5 M Ammonium phosphate dibasc, 0.1 M Tris pH 8.5, Vapor diffusion, sitting drop, temperature 293K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ALS

/ ビームライン: 4.2.2 / 波長: 0.9184 Å

検出器

タイプ: NOIR-1 / 検出器: CCD / 日付: 2011年3月2日
詳細: The NOIR-1 detector was built by E. Westbrook; 180 cm lens focused CCD

放射

モノクロメーター: SAGITALLY FOCUSED Si(III) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9184 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.6→50 Å / Num. obs: 26536 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 8.1 % / R_merge(I) obs: 0.113 / Χ²: 0.696 / Net I/σ(I): 6.6

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	Χ²	Diffraction-ID	% possible all
2.6-2.64	8.2	0.675	1317	0.379	1	100
2.64-2.69	8.3	0.568	1262	0.466	1	100
2.69-2.74	8.3	0.557	1308	0.404	1	100
2.74-2.8	8.3	0.479	1320	0.394	1	100
2.8-2.86	8.3	0.429	1292	0.425	1	100
2.86-2.93	8.3	0.37	1307	0.427	1	100
2.93-3	8.2	0.304	1298	0.488	1	100
3-3.08	8.3	0.269	1300	0.473	1	100
3.08-3.17	8.2	0.221	1326	0.546	1	100
3.17-3.28	8.2	0.177	1307	0.629	1	100
3.28-3.39	8.2	0.171	1299	0.719	1	100
3.39-3.53	8.2	0.148	1330	0.964	1	100
3.53-3.69	8.2	0.111	1314	0.865	1	100
3.69-3.88	8.2	0.097	1326	1.003	1	100
3.88-4.13	8.1	0.082	1322	0.81	1	100
4.13-4.45	8.1	0.074	1349	1.008	1	100
4.45-4.89	8.1	0.06	1347	0.97	1	100
4.89-5.6	8	0.058	1345	0.906	1	100
5.6-7.05	7.9	0.06	1387	1.062	1	99.7
7.05-50	7.3	0.047	1480	0.978	1	99.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALEPACK		データスケーリング
PHENIX	1.7.1_743	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
HKL-2000		データ収集
DENZO		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 4KMZ

4kmz

解像度: 2.6→48.721 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / FOM work R set: 0.841 / SU ML: 0.76 / σ(F): 0 / 位相誤差: 22.25 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2439	1341	5.06 %
R_work	0.1937	-	-
obs	0.1962	26486	99.86 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.72 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 52.37 Å² / k_sol: 0.386 e/Å³

原子変位パラメータ

B_iso max: 122.72 Å² / B_iso mean: 47.5735 Å² / B_iso min: 14.15 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	4.3539 Å²	0 Å²	-0 Å²
2-	-	4.3539 Å²	-0 Å²
3-	-	-	-8.7079 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.6→48.721 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	4821	0	141	115	5077

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.008	5154
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.067	6996
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.08	686
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	907
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.615	1796

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	タイプ	Rms dev position (Å)
1	1	A	1565	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.04
1	2	B	1565	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.04
1	3	C	1531	X-RAY DIFFRACTION	POSITIONAL	0.036

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 10

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
2.6-2.6897	0.3022	129	0.2449	2443	2572	100
2.6897-2.7974	0.3055	123	0.2334	2496	2619	100
2.7974-2.9247	0.2617	140	0.2289	2462	2602	100
2.9247-3.0789	0.2845	120	0.2138	2475	2595	100
3.0789-3.2718	0.2723	133	0.1959	2503	2636	100
3.2718-3.5243	0.2294	145	0.1983	2485	2630	100
3.5243-3.8788	0.2225	136	0.1847	2500	2636	100
3.8788-4.4398	0.2265	155	0.1596	2511	2666	100
4.4398-5.5924	0.2102	130	0.1757	2550	2680	100
5.5924-48.7301	0.2582	130	0.2061	2720	2850	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.9651	-1.1367	0.5152	4.4169	0.5812	2.5758	-0.1265	0.4559	0.1552	-0.4033	-0.0785	-0.7495	-0.0383	0.9555	0.1782	0.281	0.0128	0.0623	0.7956	0.0629	0.3591	44.6982	16.1936	25.7118
2	1.9113	-0.3364	0.2693	2.1587	-0.546	0.8401	0.0147	0.1592	-0.4533	-0.3595	-0.0962	-0.2013	0.2737	0.3977	0.0582	0.1806	0.2414	0.1065	0.5195	0.0261	0.3285	34.1585	5.3596	29.1735
3	1.8852	-1.2042	-0.4956	4.0121	0.7928	1.0852	-0.1327	-0.2835	0.168	0.2903	0.0418	-0.6893	0.1944	0.5163	-0.0144	0.1574	0.0153	0.0208	0.7483	0.1034	0.4334	43.5665	17.5252	37.7682
4	2.0375	2.926	-0.3127	4.237	-0.7122	1.8329	-0.1543	-0.0064	0.4189	0.1262	0.325	0.3298	0.0132	-0.5397	0.0522	0.1147	0.1691	0.0523	0.4487	0.0047	0.3531	23.0539	15.1184	35.9947
5	1.0304	1.1365	-1.4718	6.6694	4.3681	8.7333	0.0111	-0.3234	-0.101	0.0373	0.2759	0.2673	-0.2628	0.0267	-0.2491	0.287	0.1254	0.0298	0.3481	0.1349	0.4043	26.6094	3.0584	43.7288
6	6.3134	-1.7837	-4.4097	1.7687	-0.583	6.3583	-0.1554	-0.5797	-1.1432	-0.0726	-0.4544	-0.5252	0.3819	0.901	0.5777	0.3351	0.1544	0.0157	0.6099	0.1293	0.4404	35.6091	-2.3519	46.3358
7	1.144	0.4341	0.5488	3.6439	-0.6796	1.4519	-0.0773	-0.0218	0.01	-0.0538	0.0165	0.2534	-0.051	0.025	0.0455	0.1629	0.0863	0.0464	0.4507	0.0277	0.2886	27.4554	17.09	36.1317
8	2.3879	3.7162	3.9976	8.9279	6.7706	9.9162	-0.1363	0.8697	0.6738	-0.7924	0.1252	-0.0647	-0.9063	0.0447	0.0477	0.2631	0.0856	0.0244	0.6077	0.1841	0.3555	35.218	29.457	29.1444
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10	2.1753	-0.1928	-0.1561	2.2132	-0.302	1.5168	0.0798	0.3516	-0.1312	-0.191	-0.1629	0.0934	0.3842	0.0367	0.0691	0.1221	0.2731	-0.0066	0.2395	-0.1713	0.2288	3.6538	21.887	2.5699
11	3.3676	-1.2888	0.2975	1.9802	0.7468	0.5843	-0.1221	-0.1731	-0.3774	-0.0723	-0.0433	-0.1635	0.5001	0.1025	0.1624	0.2423	0.1349	-0.0174	0.2595	-0.0396	0.1869	5.9392	21.1401	12.9483
12	2.5639	0.2936	0.0075	6.7667	0.7314	3.7874	0.083	0.0797	-0.7992	-0.2447	0.003	-0.9262	0.3524	0.9684	-0.0261	0.3327	0.1647	0.0714	0.4241	-0.0621	0.3527	16.2144	34.2391	3.4785
13	4.9588	2.5935	-0.0577	8.1917	-4.1485	2.4854	-0.0134	-0.4366	0.2831	0.9206	0.2947	0.2592	-0.669	-0.7693	-0.2686	0.3632	0.0666	0.0711	0.3831	-0.0591	0.212	5.2108	31.27	20.4707
14	4.6404	4.4463	0.1119	8.2934	-1.5849	4.3476	0.1478	-0.2938	-0.2488	0.6268	0.2961	-0.3761	-0.5873	-0.1876	-0.4038	0.3915	0.1668	0.0056	0.2516	0.0176	0.2484	13.9028	19.3631	20.9645
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18	4.5053	2.2048	1.6061	6.9921	-0.8216	1.6344	-0.0188	0.7173	0.57	-0.6453	-0.4438	-0.8953	0.1276	0.3642	0.1942	0.2634	-0.0039	0.0689	0.7007	0.1197	0.5303	37.6143	49.5424	14.2825
19	3.9495	-4.1019	-6.1153	7.2397	5.4568	9.7392	0.0032	0.6207	0.6173	0.2443	0.3245	-1.1354	0.2446	-0.4412	-0.3422	0.2925	-0.1008	-0.0557	0.5376	0.1272	0.5153	37.4826	52.7267	23.4968
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22	7.0691	-5.0366	-3.6915	5.1263	5.2452	6.378	-0.3866	-1.0298	-0.3339	0.6416	0.3491	0.1264	0.6276	0.2484	0.0788	0.3367	-0.064	0.0751	0.4294	0.0909	0.3098	17.8977	50.3014	27.7667
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24	2.933	-1.8384	0.4702	4.8075	-0.2101	1.6459	0.155	-0.082	0.0055	-0.0753	0.0075	0.0414	0.082	0.2068	-0.1636	0.146	-0.0001	-0.0033	0.3244	0.0492	0.2646	19.9555	48.1486	23.92
25	4.0953	1.4371	-0.5882	7.0468	3.3474	8.6747	-0.1231	-0.5727	-0.095	-0.1089	-0.1433	-0.4757	0.813	0.1404	0.0121	0.2482	0.0704	0.0215	0.4946	0.1679	0.2832	30.4253	36.3534	21.0147

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resseq 25:48)	A	25 - 48
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resseq 49:103)	A	49 - 103
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resseq 104:125)	A	104 - 125
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resseq 126:140)	A	126 - 140
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resseq 141:150)	A	141 - 150
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resseq 151:170)	A	151 - 170
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resseq 171:214)	A	171 - 214
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resseq 215:226)	A	215 - 226
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resseq 25:48)	B	25 - 48
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resseq 49:79)	B	49 - 79
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resseq 80:103)	B	80 - 103
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resseq 104:125)	B	104 - 125
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resseq 126:140)	B	126 - 140
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resseq 141:150)	B	141 - 150
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resseq 151:170)	B	151 - 170
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resseq 171:214)	B	171 - 214
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resseq 215:226)	B	215 - 226
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resseq 25:48)	C	25 - 48
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resseq 49:61)	C	49 - 61
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resseq 62:103)	C	62 - 103
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resseq 104:125)	C	104 - 125
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resseq 126:140)	C	126 - 140
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resseq 141:170)	C	141 - 170
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resseq 171:214)	C	171 - 214
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resseq 215:225)	C	215 - 225

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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