登録情報 | データベース: PDB / ID: 4i68 |
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タイトル | Crystal structure of the R444A / R449A double mutant of the HERA RNA helicase RRM domain |
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要素 | Heat resistant RNA dependent ATPase |
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キーワード | HYDROLASE / RNA recognition motif / ATP binding / nucleotide binding / rna binding protein / DEAD box protein |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
nucleic acid binding / RNA helicase activity / hydrolase activity / ATP binding / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 Alpha-Beta Plaits - #1800 / : / RNA helicase Hera, dimerization domain / : / DEAD-box subfamily ATP-dependent helicases signature. / ATP-dependent RNA helicase DEAD-box, conserved site / RNA helicase, DEAD-box type, Q motif / DEAD-box RNA helicase Q motif profile. / DEAD/DEAH box helicase / DEAD/DEAH box helicase domain ...Alpha-Beta Plaits - #1800 / : / RNA helicase Hera, dimerization domain / : / DEAD-box subfamily ATP-dependent helicases signature. / ATP-dependent RNA helicase DEAD-box, conserved site / RNA helicase, DEAD-box type, Q motif / DEAD-box RNA helicase Q motif profile. / DEAD/DEAH box helicase / DEAD/DEAH box helicase domain / Helicase conserved C-terminal domain / helicase superfamily c-terminal domain / Superfamilies 1 and 2 helicase C-terminal domain profile. / Superfamilies 1 and 2 helicase ATP-binding type-1 domain profile. / DEAD-like helicases superfamily / Helicase, C-terminal / Helicase superfamily 1/2, ATP-binding domain / Alpha-Beta Plaits / P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | ![](img/tx_bacteria.gif) Thermus thermophilus (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.63 Å |
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データ登録者 | Rudolph, M.G. / Klostermeier, D. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2013 タイトル: Recognition of two distinct elements in the RNA substrate by the RNA-binding domain of the T. thermophilus DEAD box helicase Hera. 著者: Steimer, L. / Wurm, J.P. / Linden, M.H. / Rudolph, M.G. / Wohnert, J. / Klostermeier, D. |
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履歴 | 登録 | 2012年11月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2013年4月24日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年5月15日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2013年7月17日 | Group: Database references |
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改定 1.3 | 2014年11月26日 | Group: Structure summary |
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改定 1.4 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.5 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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