PDB-4f21: Crystal structure of carboxylesterase/phospholipase family protei...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4f21

タイトル

Crystal structure of carboxylesterase/phospholipase family protein from Francisella tularensis

要素

Carboxylesterase/phospholipase family protein

キーワード

HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / Structural Genomics / NIAID / National Institute of Allergy and Infectious Diseases / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases / CSGID / carboxylesterase / phospholipase / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

加水分解酵素; エステル加水分解酵素; カルボン酸エステル加水分解酵素 / hydrolase activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Francisella tularensis subsp. tularensis (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.5 Å

データ登録者

Filippova, E.V. / Minasov, G. / Kuhn, M. / Wawrzak, Z. / Shuvalova, L. / Dubrovska, I. / Winsor, J.R. / Kiryukhina, O. / Becker, D.P. / Armoush, N. ...

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2013
タイトル: Large scale structural rearrangement of a serine hydrolase from Francisella tularensis facilitates catalysis.
著者: Filippova, E.V. / Weston, L.A. / Kuhn, M.L. / Geissler, B. / Gehring, A.M. / Armoush, N. / Adkins, C.T. / Minasov, G. / Dubrovska, I. / Shuvalova, L. / Winsor, J.R. / Lavis, L.D. / Satchell, ...

履歴

登録	2012年5月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年8月29日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年10月9日	Group: Database references
改定 1.2	2017年11月15日	Group: Advisory / Refinement description / カテゴリ: pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / software / Item: _software.name
改定 1.3	2018年1月24日	Group: Structure summary / カテゴリ: audit_author / Item: _audit_author.name
改定 1.4	2023年9月13日	Group: Advisory / Data collection ...Advisory / Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.5	2024年10月16日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4f21.cif.gz	677.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4f21.ent.gz	562 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4f21.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f2/4f21 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f2/4f21	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	1fj2S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	2fmd-d 6flm-2 6zyr-4 3ax4-d 1rin-2 6zys-1 1ioa-1 1z3u-3 6dn8-1 2j61-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: CSGID-IDP01809

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: Carboxylesterase/phospholipase family protein

B: Carboxylesterase/phospholipase family protein

C: Carboxylesterase/phospholipase family protein

D: Carboxylesterase/phospholipase family protein

E: Carboxylesterase/phospholipase family protein

F: Carboxylesterase/phospholipase family protein

G: Carboxylesterase/phospholipase family protein

H: Carboxylesterase/phospholipase family protein

ヘテロ分子

220 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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2

B: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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3

C: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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4

D: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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5

E: Carboxylesterase/phospholipase family protein

ヘテロ分子

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6

F: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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7

G: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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8

H: Carboxylesterase/phospholipase family protein

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単位格子

Length a, b, c (Å)	50.997, 64.416, 139.039
Angle α, β, γ (deg.)	94.89, 90.12, 89.96
Int Tables number	1
Space group name H-M	P1

#1: タンパク質	Carboxylesterase/phospholipase family protein 分子量: 27439.318 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Francisella tularensis subsp. tularensis (バクテリア) 株: SCHU S4 / Schu 4 / 遺伝子: FTT_0258 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3)-Magic 参照: UniProt: Q5NI32, 加水分解酵素; エステル加水分解酵素; カルボン酸エステル加水分解酵素
#2: 化合物	ChemComp-0S1 / N-((1R,2S)-2-allyl-4-oxocyclobutyl)-4-methylbenzenesulfonamide, bound form 分子量: 281.371 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₄H₁₉NO₃S
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 458 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.07 Å³/Da / 溶媒含有率: 40.67 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: 0.1 M ammonium acetate, 0.1 M Bis-Tris, 17% PEG10000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 21-ID-F / 波長: 0.97872 Å
検出器	タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2011年11月21日 / 詳細: Beryllium lenses
放射	モノクロメーター: Diamond(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97872 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.5→30 Å / Num. all: 58087 / Num. obs: 58087 / % possible obs: 94.4 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 1.9 % / B_iso Wilson estimate: 47.2 Å² / R_merge(I) obs: 0.078 / Net I/σ(I): 8.4
反射シェル	解像度: 2.5→2.54 Å / 冗長度: 1.8 % / R_merge(I) obs: 0.36 / Mean I/σ(I) obs: 2.2 / Num. unique all: 2970 / % possible all: 97.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
Blu-Ice	Max	データ収集
MOLREP		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.7.3_928)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1FJ2

1fj2

解像度: 2.5→29.458 Å / Isotropic thermal model: ISOTROPIC / σ(F): 1.97 / 位相誤差: 29.74 / 立体化学のターゲット値: TWIN_LSQ_F

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2585	2972	5.17 %
R_work	0.1991	-	-
obs	0.204	57489	94.3 %
all	-	57489	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 38.632 Å² / k_sol: 0.306 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	2.4018 Å²	0.7993 Å²	-0.9668 Å²
2-	-	-17.2951 Å²	-1.6765 Å²
3-	-	-	14.8932 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.5→29.458 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	13259	0	5	458	13722

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.003	13560
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.802	18322
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.794	4879
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.052	2080
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	2322

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.5-2.5436	0.3273	140	0.2826	2832	X-RAY DIFFRACTION	93
2.5436-2.5898	0.3447	133	0.2815	2814	X-RAY DIFFRACTION	93
2.5898-2.6395	0.3525	160	0.2818	2812	X-RAY DIFFRACTION	92
2.6395-2.6933	0.3358	140	0.2595	2890	X-RAY DIFFRACTION	93
2.6933-2.7518	0.2922	164	0.26	2757	X-RAY DIFFRACTION	92
2.7518-2.8158	0.3644	150	0.2761	2902	X-RAY DIFFRACTION	93
2.8158-2.8861	0.3023	157	0.2546	2761	X-RAY DIFFRACTION	93
2.8861-2.964	0.3152	159	0.23	2864	X-RAY DIFFRACTION	93
2.964-3.0511	0.2569	162	0.2279	2817	X-RAY DIFFRACTION	93
3.0511-3.1494	0.3011	150	0.2139	2848	X-RAY DIFFRACTION	93
3.1494-3.2618	0.2933	128	0.2102	2852	X-RAY DIFFRACTION	94
3.2618-3.3921	0.2684	167	0.1942	2881	X-RAY DIFFRACTION	93
3.3921-3.5461	0.2818	157	0.1787	2781	X-RAY DIFFRACTION	92
3.5461-3.7325	0.2938	62	0.1489	1143	X-RAY DIFFRACTION	38
3.7325-3.9655	0.2232	134	0.1569	2273	X-RAY DIFFRACTION	75
3.9655-4.2704	0.2078	150	0.1605	2862	X-RAY DIFFRACTION	93
4.2704-4.6977	0.1923	162	0.1459	2789	X-RAY DIFFRACTION	93
4.6977-5.372	0.2233	148	0.1816	2904	X-RAY DIFFRACTION	94
5.372-6.7474	0.2539	138	0.2104	2861	X-RAY DIFFRACTION	95
6.7474-25.5195	0.2418	144	0.1865	2889	X-RAY DIFFRACTION	94

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.659	-0.3266	1.0156	1.0355	0.4773	2.664	-0.0621	0.1353	0.1896	0.1074	-0.0196	-0.0475	-0.1553	0.0587	0.085	0.1611	-0.0245	-0.0519	0.2368	-0.0226	0.1036	-10.79	7.2822	-0.4596
2	1.271	-0.3444	-1.3065	0.3189	0.4758	1.4088	0.2148	-0.1081	0.2706	-0.0195	0.1062	-0.1222	-0.2826	0.2618	-0.1519	0.1267	-0.0097	0.0577	0.3313	-0.025	0.0908	9.8953	2.2896	-6.642
3	6.6833	-3.2569	-5.593	2.9207	3.0129	6.2335	0.1585	-0.0023	0.1427	-0.2423	0.1531	-0.1693	-0.3289	0.5151	-0.1659	0.2055	0.0049	-0.1078	0.2458	-0.1563	0.2194	2.9706	9.8484	8.5108
4	0.3276	-0.0407	-0.5362	0.3365	0.1052	0.892	-0.0271	-0.2231	0.0079	0.1448	0.1	-0.0807	-0.008	0.324	-0.0637	0.0672	0.0963	0.016	0.3388	-0.0615	0.0333	2.8238	-2.6343	3.3698
5	0.143	0.265	-0.0667	0.7111	0.3832	1.2415	-0.0131	-0.0657	-0.1325	0.1186	0.0569	-0.187	0.1744	0.1659	-0.1029	0.0169	-0.012	-0.041	0.1965	-0.0391	0.0655	-4.0791	-9.041	-2.6911
6	2.0231	-0.7572	0.1988	1.9627	0.5175	2.3098	0.095	-0.0146	0.2128	-0.1512	-0.0391	-0.2331	-0.1982	0.1274	0.0687	0.0907	-0.0526	-0.0251	0.153	0.0347	0.0179	10.3211	-30.1502	68.492
7	0.691	0.9328	0.8236	2.3853	1.6933	3.1511	-0.0266	-0.4218	0.1915	0.3542	-0.1274	-0.0571	-0.1669	-0.1769	-0.0525	0.2203	-0.089	-0.1213	0.3713	-0.0916	0.1791	35.5766	-41.0124	59.1749
8	0.198	0.0423	0.2157	0.2751	0.2103	0.4994	-0.0309	-0.069	0.0783	0.1131	0.0229	-0.0991	-0.0695	0.1894	0.025	0.0197	0.0152	-0.1611	0.2177	-0.1161	-0.0358	21.2079	-37.7818	73.7774
9	0.0703	-0.009	0.2262	0.3837	0.0925	1.5688	-0.0655	0.0033	-0.0186	0.0494	0.0771	-0.0064	0.1282	0.0647	-0.0094	0.0184	0.0473	-0.014	0.2589	-0.0229	0.0376	14.6276	-47.2849	66.7567
10	0.6057	0.0098	0.6269	0.5285	0.0954	1.6844	-0.0187	0.1165	-0.0188	0.0264	-0.0346	-0.0192	-0.015	0.0399	-0.0726	0.0099	-0.151	-0.0143	0.1357	-0.0098	-0.026	14.9217	-15.2657	-31.3589
11	1.8353	0.1866	-0.6365	0.9759	-0.7806	2.0039	0.027	-0.2419	-0.0488	0.0985	-0.1118	-0.1503	-0.108	0.3678	0.1169	0.076	-0.0406	0.003	0.1763	0.042	0.0317	25.4948	-17.2321	-30.0908
12	0.383	0.4786	0.272	1.3844	1.4476	2.7457	0.0736	0.2569	-0.1448	-0.1562	0.0159	0.1142	0.091	-0.0929	-0.0828	0.0796	0.0233	-0.1064	0.2283	-0.0232	0.1295	42.9551	-4.615	-21.641
13	1.0027	-0.2333	0.0431	0.5123	0.0943	0.1971	0.0085	0.2394	0.04	-0.069	0.0421	-0.0649	0.0248	0.1343	-0.0234	-0.025	0.0061	-0.0038	0.2259	-0.0118	0.0223	28.1196	-10.8229	-37.8437
14	1.6927	-0.0873	-0.8954	0.1068	0.1988	0.7016	0.0042	0.0665	0.0982	0.0187	-0.0165	-0.0643	-0.0136	0.3805	0.0689	0.3357	-0.029	0.105	0.3268	0.0432	0.1381	31.3435	-2.7401	-44.786
15	0.5972	0.3635	0.6314	0.3746	0.3857	0.6759	-0.1367	0.0424	0.2413	-0.1037	0.0391	0.0695	-0.1042	-0.0215	-0.1106	-0.0384	-0.0769	-0.0026	0.2347	0.0224	0.0507	22.6816	1.0039	-28.0727
16	0.3548	-0.0531	0.1048	0.6023	-0.3372	0.8477	0.0019	-0.0025	-0.0043	0.0911	-0.0937	-0.1038	-0.0293	0.0747	0.0221	0.0188	-0.1213	-0.0001	0.2306	0.0782	-0.0017	38.5881	-53.1878	39.4035
17	2.5242	1.7154	2.4763	1.6641	1.5139	4.4287	0.0562	0.4396	-0.2672	-0.0705	0.1633	-0.2045	0.12	0.2848	-0.4211	0.1093	-0.0232	-0.0846	0.2214	0.0073	0.1401	61.8368	-40.7851	46.748
18	0.5298	-0.0824	0.0632	0.2755	-0.2184	0.945	0.0148	0.1978	-0.0712	-0.095	-0.0067	0.0147	0.1159	0.05	-0.0342	-0.0098	0.0251	0.0139	0.1474	-0.0489	-0.0588	44.7846	-50.3721	30.3904
19	4.1357	1.108	-2.6126	0.5509	0.1982	4.8235	-0.4317	-0.0321	-0.5497	-0.2056	0.1047	-0.6414	0.5878	0.7133	0.4265	0.1208	0.042	0.0773	0.1657	0.0278	0.2701	55.5365	-41.8122	37.3072
20	0.2229	-0.1946	0.1863	0.4147	0.1196	0.4933	-0.0196	0.0942	0.0267	-0.135	-0.0213	-0.0245	-0.1046	0.0573	-0.2443	0.0523	-0.0761	-0.0037	0.1524	-0.0028	-0.032	48.7559	-37.3837	36.9247
21	1.7226	0.2371	0.1898	1.4648	0.3818	0.4372	-0.1684	0.0155	0.1511	-0.1164	-0.0781	0.0684	-0.1083	-0.0871	0.0193	0.0189	-0.0091	-0.0476	0.1995	0.0222	0.0919	36.0667	-38.2754	40.7293
22	0.5457	-0.0544	0.052	1.0419	-0.4323	1.4441	0.0635	0.0754	-0.0006	-0.1042	-0.041	-0.1591	0.1113	0.3654	0.0894	-0.006	-0.0083	0.0219	0.1834	-0.0191	0.0092	17.405	30.384	-31.52
23	3.1286	0.4181	-0.9287	0.4627	-0.393	1.7504	0.0583	-0.2527	0.3009	0.0877	0.0535	0.1487	-0.1657	-0.1917	-0.0532	0.0435	-0.0191	-0.0297	0.0542	-0.0461	0.0102	3.212	34.1871	-25.8934
24	0.1775	-0.0559	0.1764	0.2146	-0.1878	0.4704	-0.0244	0.1341	0.0629	-0.0795	0.0387	0.0667	-0.0177	-0.1053	0.078	0.145	0.0652	-0.1469	0.2665	0.0041	0.1017	7.1739	28.6035	-38.1227
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31	0.7221	0.1659	-0.4326	0.1152	0.0035	0.4206	-0.1326	0.1085	-0.0191	-0.3	-0.0336	0.749	0.4993	-0.3308	0.1795	0.3518	-0.053	-0.105	0.1456	0.0095	0.5557	18.8156	-27.0432	39.9424
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33	2.368	1.4262	-0.4678	1.6417	0.5527	0.9816	0.1059	-0.1595	-0.9396	0.33	-0.0788	-0.1325	0.1687	0.1505	-0.0423	0.3501	0.0044	-0.1637	0.1989	0.0678	0.543	-7.86	-43.7	4.61
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39	5.1762	2.4086	4.477	2.0269	2.0638	3.8968	0.2855	-0.1778	-0.1308	0.057	-0.3344	-0.015	0.1037	-0.0949	-0.1962	0.361	0.0602	-0.2189	0.2	0.0265	0.343	10.763	-81.768	73.952
40	0.4634	-0.3252	-0.1065	0.4668	-0.054	0.3394	-0.0429	-0.0208	-0.1354	-0.0195	-0.0784	0.0448	-0.019	0.0288	-0.0145	0.2458	0.0576	-0.2096	0.1995	-0.0495	0.56	12.0906	-72.9907	66.964
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42	1.3693	-0.3857	0.9403	1.0876	-0.8762	1.9196	0.0338	-0.2317	-0.1436	0.1577	0.0073	-0.0188	0.167	0.0257	-0.0571	0.1382	0.0733	-0.0537	0.119	0.0708	0.1463	0.2002	-75.0887	75.5635
43	6.8712	-2.3592	0.2248	1.431	0.1874	4.0783	-0.1186	-1.301	-0.5808	1.0537	0.0233	0.0296	0.3585	0.1056	0.1137	0.5055	-0.0973	-0.0087	0.2836	0.0239	0.1992	0.2614	-68.433	77.909
44	0.6234	0.6274	1.3066	0.753	2.0643	7.3482	0.1212	-0.5449	0.4407	0.4804	-0.2804	0.5825	-0.0357	-1.7337	0.2198	0.4433	0.1211	0.1301	0.5568	-0.0318	0.3207	-9.0932	-64.9912	75.2943
45	3.8154	-0.0772	3.1974	2.5095	1.6979	4.7203	-0.2059	-0.089	0.5401	0.0855	-0.0004	0.032	-0.2172	-0.0872	0.2405	0.0807	0.02	-0.0674	0.0914	0.0033	0.3188	-3.7544	-59.1855	63.6898
46	0.8259	0.7509	0.7844	1.3458	-0.8666	4.5065	-0.0479	-0.132	0.1789	0.1512	-0.0999	-0.0519	-0.4394	-0.4048	0.134	0.2045	0.0438	-0.1718	0.112	-0.0422	0.2219	1.4997	-59.1218	63.9253
47	5.9498	2.079	1.5551	4.5167	-0.4696	1.5386	0.1044	-0.4386	0.2912	0.2635	-0.1982	0.1044	-0.1176	-0.316	0.0928	0.1504	-0.0459	-0.1113	0.1639	0.038	0.4158	13.3028	-62.7897	69.3167

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resseq -1:42)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resseq 43:82)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resseq 83:103)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resseq 105:174)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resseq 175:222)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'B' and (resseq -1:57)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resseq 58:82)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resseq 83:174)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resseq 175:222)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resseq -1:42)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resseq 43:58)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resseq 59:82)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resseq 83:149)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resseq 150:160)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resseq 161:222)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resseq -1:64)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resseq 65:82)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resseq 83:139)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resseq 140:148)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resseq 149:188)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resseq 189:222)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resseq -2:39)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resseq 40:84)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resseq 85:127)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resseq 128:174)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'E' and (resseq 175:186)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'E' and (resseq 187:222)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resseq -2:39)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resseq 40:145)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resseq 146:174)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resseq 175:186)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resseq 187:222)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'G' and (resseq -2:13)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'G' and (resseq 14:42)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'G' and (resseq 43:84)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'G' and (resseq 85:106)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'G' and (resseq 107:175)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'G' and (resseq 176:222)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'H' and (resseq -2:13)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'H' and (resseq 14:42)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'H' and (resseq 43:84)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'H' and (resseq 85:126)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'H' and (resseq 127:139)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'H' and (resseq 140:160)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'H' and (resseq 161:186)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'H' and (resseq 187:205)
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'H' and (resseq 206:222)

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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万見 (Yorodumi)