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Yorodumi- PDB-3u40: Crystal structure of a purine nucleoside phosphorylase from Entam... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3u40 | ||||||
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Title | Crystal structure of a purine nucleoside phosphorylase from Entamoeba histolytica bound to adenosine | ||||||
Components | Purine nucleoside phosphorylase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / Structural Genomics / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease / SSGCID / purine salvage / maltose binding protein / expression rescue / co-crystal | ||||||
Function / homology | Function and homology information uridine catabolic process / uridine phosphorylase activity / purine-nucleoside phosphorylase activity / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Entamoeba histolytica (eukaryote) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 2.05 Å | ||||||
Authors | Edwards, T.E. / Gardberg, A.S. / Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) | ||||||
Citation | Journal: Acta Crystallogr.,Sect.F / Year: 2011 Title: Expression of proteins in Escherichia coli as fusions with maltose-binding protein to rescue non-expressed targets in a high-throughput protein-expression and purification pipeline. Authors: Hewitt, S.N. / Choi, R. / Kelley, A. / Crowther, G.J. / Napuli, A.J. / Van Voorhis, W.C. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3u40.cif.gz | 532.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3u40.ent.gz | 436.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3u40.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 3u40_validation.pdf.gz | 2.3 MB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 3u40_full_validation.pdf.gz | 2.3 MB | Display | |
Data in XML | 3u40_validation.xml.gz | 55.8 KB | Display | |
Data in CIF | 3u40_validation.cif.gz | 77.4 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u4/3u40 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/u4/3u40 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 3sdsC 3tl6SC S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data | |
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-Links
-Assembly
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: MET / Beg label comp-ID: MET / Refine code: _
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