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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3gfu | ||||||
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Title | FaeE-FaeG chaperone-major pilin complex of F4 ac 5/95 fimbriae | ||||||
![]() |
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![]() | CELL ADHESION / immunoglobulin like fold / Chaperone / Fimbrium / Immunoglobulin domain | ||||||
Function / homology | ![]() chaperone-mediated protein folding / cell wall organization / outer membrane-bounded periplasmic space Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Van Molle, I. / Moonens, K. / Garcia-Pino, A. / Buts, L. / Bouckaert, J. / De Greve, H. | ||||||
![]() | ![]() Title: Structural and thermodynamic characterization of pre- and postpolymerization states in the F4 fimbrial subunit FaeG Authors: Van Molle, I. / Moonens, K. / Garcia-Pino, A. / Buts, L. / De Kerpel, M. / Wyns, L. / Bouckaert, J. / De Greve, H. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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Downloads & links
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Download
PDBx/mmCIF format | ![]() | 329.5 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 265.7 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | ![]() 3geaC ![]() 3gewSC ![]() 3gghC ![]() 3hlrC S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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Unit cell |
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Components
#1: Protein | Mass: 24801.287 Da / Num. of mol.: 2 Source method: isolated from a genetically manipulated source Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: Protein | Mass: 26417.527 Da / Num. of mol.: 2 Source method: isolated from a genetically manipulated source Details: residues 5 to 21 were replaced by 6xHis-tag / Source: (gene. exp.) ![]() ![]() ![]() ![]() #3: Chemical | ChemComp-SO4 / #4: Water | ChemComp-HOH / | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.6 Å3/Da / Density % sol: 52.61 % |
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Crystal grow | Temperature: 283 K / Method: vapor diffusion, hanging drop / pH: 4.6 Details: 1.6M (NH4)2SO4, 0.1M Na acetate pH 4.6 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 100 K |
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() |
Detector | Type: MARMOSAIC 225 mm CCD / Detector: CCD / Date: Jun 24, 2007 |
Radiation | Monochromator: graphite / Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray |
Radiation wavelength | Wavelength: 0.815 Å / Relative weight: 1 |
Reflection | Resolution: 1.99→35 Å / Num. all: 67757 / Num. obs: 67757 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / Redundancy: 4.8 % / Biso Wilson estimate: 25.44 Å2 / Rmerge(I) obs: 0.091 / Net I/σ(I): 9.48 |
Reflection shell | Resolution: 2→2.09 Å / Redundancy: 4 % / Rmerge(I) obs: 0.48 / Mean I/σ(I) obs: 2.6 / % possible all: 78.6 |
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]() Starting model: PDB ENTRY 3GEW Resolution: 1.991→28.802 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.5 / SU ML: 0.34 / σ(F): 1.34 / Phase error: 34.99 / Stereochemistry target values: ML
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Solvent computation | Shrinkage radii: 0.9 Å / VDW probe radii: 1.11 Å / Solvent model: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 41.67 Å2 / ksol: 0.355 e/Å3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso mean: 29.173 Å2
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Refinement step | Cycle: LAST / Resolution: 1.991→28.802 Å
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Refine LS restraints |
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LS refinement shell |
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Refinement TLS params. | Method: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION
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Refinement TLS group |
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