PDB-3d32: Complex of GABA(A) receptor-associated protein (GABARAP) with a s...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 3d32

タイトル

Complex of GABA(A) receptor-associated protein (GABARAP) with a synthetic peptide

要素

Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein
K1 peptide

キーワード

TRANSPORT PROTEIN / alpha-beta / beta-grasp fold / Cytoskeleton / Golgi apparatus / Membrane / Microtubule / Transport

機能・相同性

機能・相同性情報

positive regulation of protein K48-linked ubiquitination / regulation of Rac protein signal transduction / GABA receptor binding / phosphatidylethanolamine binding / TBC/RABGAPs / cellular response to nitrogen starvation / microtubule associated complex / regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane / Macroautophagy / beta-tubulin binding ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)
synthetic construct (人工物)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.3 Å

データ登録者

Weiergraeber, O.H. / Stangler, T. / Willbold, D.

引用

ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 2008
タイトル: Ligand Binding Mode of GABA(A) Receptor-Associated Protein.
著者: Weiergraber, O.H. / Stangler, T. / Thielmann, Y. / Mohrluder, J. / Wiesehan, K. / Willbold, D.

履歴

登録	2008年5月9日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2008年8月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Version format compliance
改定 2.0	2020年3月4日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Polymer sequence / Source and taxonomy / Structure summary カテゴリ: atom_site / entity ...atom_site / entity / entity_name_com / entity_poly / entity_poly_seq / entity_src_gen / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entity_src_syn / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_poly_seq_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_conn_angle / struct_asym / struct_conn / struct_ref / struct_ref_seq / struct_ref_seq_dif Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.group_PDB / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.label_seq_id / _atom_site.type_symbol / _entity_name_com.name / _entity_poly.nstd_monomer / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code / _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can / _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num / _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene / _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id / _entity_src_gen.pdbx_seq_type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_struct_assembly_prop.value / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code / _struct_ref_seq.db_align_end / _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end / _struct_ref_seq.seq_align_end / _struct_ref_seq_dif.details
改定 2.1	2023年8月30日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 2.2	2024年11月13日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	3d32.cif.gz	81 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb3d32.ent.gz	62.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	3d32.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d3/3d32 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/d3/3d32	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	1gnuS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	6vd5-1 3kmt-2 3i2v-d 4flb-d 3ayc-1 1tvq-d 3aye-2 2ju7-d 3ifb-d 7aa0-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#175 - 2014年7月微小管 (Microtubules) 類似性 (1) #203 - 2016年11月アミノペプチダーゼ1とオートファジー (Aminopeptidase 1 and Autophagy) 類似性 (2) #252 - 2020年12月 C型肝炎ウイルスプロテアーゼ/ヘリカーゼ (Hepatitis C Virus Protease/Helicase) 類似性 (1) #115 - 2009年7月 β-セクレターゼ (beta-Secretase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

B: Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

C: K1 peptide

D: K1 peptide

ヘテロ分子

31.5 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

C: K1 peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
15.7 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein

D: K1 peptide

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
15.7 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	129.287, 35.415, 58.209
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 100.590, 90.000
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

#1: タンパク質	Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein / GABA(A) receptor-associated protein / MM46 分子量: 14086.176 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現詳細: Product contains an N-terminal cloning artifact (glycine-serine) preceding the sequence of native GABARAP. 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: GABARAP, FLC3B, HT004 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 / 参照: UniProt: O95166
#2: タンパク質・ペプチド	K1 peptide 分子量: 1488.601 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) synthetic construct (人工物)
#3: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 301 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.1 Å³/Da / 溶媒含有率: 41.49 %
結晶化	温度: 285 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 5.9 詳細: 30 % (w/v) PEG3350 800 mM NaCl 50 mM MES, pH 5.9, VAPOR DIFFUSION, temperature 285K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-1 / 波長: 0.934 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2006年11月23日 / 詳細: monochromators, mirrors
放射	モノクロメーター: diamond, germanium / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.934 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.3→63.5 Å / Num. all: 60022 / Num. obs: 60022 / % possible obs: 93.9 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 2.1 % / B_iso Wilson estimate: 12.1 Å² / R_merge(I) obs: 0.041 / R_sym value: 0.041 / Net I/σ(I): 16.3
反射シェル	解像度: 1.3→1.37 Å / 冗長度: 2.2 % / R_merge(I) obs: 0.32 / Mean I/σ(I) obs: 2.7 / Num. unique all: 8554 / R_sym value: 0.32 / % possible all: 92.3

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2 Å	25.83 Å
Translation	2 Å	25.83 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
MOSFLM		データ削減
SCALA	3.3.2	データスケーリング
MOLREP		位相決定
REFMAC		精密化
PDB_EXTRACT	3.005	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB entry 1GNU

1gnu

解像度: 1.3→27.17 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.964 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.958 / SU B: 1.604 / SU ML: 0.036 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / Isotropic thermal model: isotropic + tls / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.057 / ESU R Free: 0.056 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
詳細: The B factor column contains residual B values after TLS refinement.

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.195	3070	5.1 %	SHELLS
R_work	0.177	-	-	-
all	0.178	60022	-	-
obs	0.178	60022	93.9 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 10.922 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.38 Å²	0 Å²	0.19 Å²
2-	-	0.65 Å²	0 Å²
3-	-	-	-0.2 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.3→27.17 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	2160	0	11	301	2472

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.005	0.022	2372
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.3	1.948	3229
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.326	5	288
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	30.061	22.941	119
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	12.964	15	403
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	14.17	15	17
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.091	0.2	327
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.006	0.021	1879
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.61	1.5	1395
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	1.013	2	2283
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.639	3	977
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	2.244	4.5	946

LS精密化シェル

最高解像度: 1.3 Å / Num. reflection R_work: 4311 / Num. reflection all: 4312 / Total num. of bins used: 20

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	11.265	1.9872	-1.0094	5.5784	-1.9373	1.8754	-0.0205	-0.9284	-0.3204	0.7824	-0.0224	0.2628	0.0565	0.2316	0.0428	0.0505	0.026	0.0302	0.0691	0.0447	0.0634	58.009	10.608	19.223
2	12.6923	3.5095	1.2713	1.5977	-1.7743	11.5619	-0.1127	0.1224	-1.074	-0.2792	0.08	-0.4745	0.5463	0.2309	0.0327	-0.0052	0.0175	0.0235	0.0364	-0.0321	0.1402	61.53	10.932	10.721
3	7.9654	0.3681	-0.5673	6.541	0.9542	0.1877	-0.0067	0.5386	-0.0318	0.004	-0.0455	-0.1896	0.041	0.0025	0.0522	-0.0084	0.0104	-0.0186	0.1281	-0.0139	0.0031	66.569	18.046	8.514
4	8.303	-3.5118	1.5394	4.4923	-1.7525	6.593	0.0832	0.5515	0.3889	-0.1475	-0.08	-0.103	-0.0892	0.2966	-0.0032	-0.0026	-0.0218	-0.0069	0.1065	0.0347	0.0331	63.328	24.197	6.723
5	9.7951	0.1568	-3.0784	12.2311	3.0229	9.4108	0.1771	0.1447	0.27	0.0421	-0.1925	-0.1493	-0.1553	0.3271	0.0154	0.0374	-0.0188	-0.0219	0.0869	0.0367	0.045	57.368	28.134	5.887
6	8.0716	2.9672	-3.7849	3.4197	-3.9275	5.2449	0.1411	0.4318	0.3441	-0.1289	-0.0227	0.1207	-0.453	0.0499	-0.1185	0.079	0.0014	-0.0042	0.004	0.015	0.0301	51.111	29.366	6.244
7	2.369	1.4528	-1.9683	5.3657	-3.0922	3.3924	-0.1893	-0.0068	-0.106	-0.0207	0.069	-0.0155	0.1801	-0.0103	0.1202	0.0291	0.002	0.0003	0.0411	-0.0072	0.0487	52.292	14.407	14.696
8	11.377	1.0323	3.7746	10.2022	-0.5696	8.3104	-0.0838	-0.3967	-0.8665	0.5879	-0.031	-0.2451	0.8568	0.3476	0.1147	0.1679	0.0405	0.0774	-0.0178	0.0173	0.1401	48.064	2.674	20.221
9	4.3299	2.861	-2.8439	10.9449	-0.7968	2.0098	-0.2759	0.1787	-0.2519	-0.2052	0.1338	-0.0546	0.2602	-0.0059	0.1421	0.0594	-0.0019	0.0013	0.0256	-0.0194	0.0512	50.239	12.409	8.241
10	4.4014	-1.1518	-3.4608	3.3636	2.2411	4.7943	0.0437	0.1443	0.1321	-0.154	0.031	0.0086	-0.2032	-0.1546	-0.0748	0.0446	0.0043	-0.0147	0.041	0.0082	0.046	45.878	26.071	11.99
11	1.5792	0.8336	-0.4106	2.6309	0.4347	1.537	-0.0377	0.0018	-0.0211	-0.0926	-0.0471	0.0296	0.0572	-0.0791	0.0847	0.0302	0.0048	-0.0103	0.0432	-0.0031	0.0299	39.676	17.893	17.28
12	4.3285	1.974	-4.1011	5.0047	-7.0198	10.3461	-0.5339	0.3555	-0.2865	-0.3185	0.2144	-0.0228	0.7849	-0.6636	0.3195	0.0846	-0.0672	0.0286	0.0428	-0.0365	0.0178	37.803	9.442	12.603
13	1.3266	0.7426	0.6562	2.2831	0.0262	2.3468	0.0806	-0.0284	-0.1317	-0.0843	-0.0958	0.1543	0.2344	-0.1662	0.0152	0.0497	-0.0126	0.0054	0.0268	-0.0094	0.0346	37.297	9.134	23.58
14	7.1641	0.6696	1.4463	4.8781	2.9618	7.0084	-0.1517	-0.3848	-0.2384	0.1517	0.2116	-0.2861	0.0443	0.6546	-0.0599	0.0143	0.0199	-0.0055	0.1053	0.01	0.0214	51.937	16.353	24.562
15	8.7974	-5.8004	2.8923	5.6462	-1.7377	3.0492	-0.0185	-0.1863	0.182	0.1132	-0.0092	-0.1087	-0.0329	0.0725	0.0277	0.0435	-0.0023	-0.0038	0.0673	-0.0044	0.0163	45.731	21.379	26.471
16	9.2983	1.5017	0.3306	2.0297	-2.0463	3.9416	0.1953	-0.233	0.3823	0.04	0.0121	-0.0001	-0.2008	0.1117	-0.2074	0.0289	-0.0061	-0.0078	0.0315	-0.0185	0.0413	48.153	26.983	19.905
17	10.1583	-2.9155	-1.7579	5.5044	0.2148	10.409	-0.1009	-0.6864	0.5839	0.3015	0.201	-0.0977	-0.4256	-0.1257	-0.1001	0.0243	-0.015	-0.0227	0.0873	-0.0309	0.0625	55.304	27.457	20.399
18	7.215	0.0741	-0.2822	2.3069	0.7301	2.1447	-0.0521	-0.1965	0.2412	0.0233	0.067	-0.1069	0.0867	0.2415	-0.0149	0.003	-0.0032	-0.0083	0.0731	-0.0131	0.0358	60.568	22.769	15.352
19	4.9452	3.8612	-2.1986	3.5725	-2.1552	1.3223	-0.0482	-0.1209	-0.0876	0.0663	-0.0377	0.0553	0.0312	0.2499	0.0859	0.0383	-0.0013	0.0239	0.0363	-0.0037	0.0482	51.216	13.517	18.942
20	9.9252	0.1743	2.5905	8.1725	2.1034	10.496	-0.1682	-0.4013	-0.0471	0.534	0.2727	-0.7715	0.3109	0.5438	-0.1044	0.0486	0.0497	0.022	-0.0065	0.0304	0.0885	48.365	8.24	28.677
21	5.831	-0.4092	3.0303	4.2837	0.4968	8.3604	-0.0385	-0.6248	-0.0249	0.357	0.0824	-0.0167	0.1721	-0.4057	-0.044	0.0184	-0.0154	0.0002	0.0547	-0.0103	0.0282	23.099	15.392	44.248
22	3.3667	0.5954	-1.1006	10.0394	-0.7007	3.3885	-0.0649	-0.1342	0.2283	-0.1218	0.0504	0.2512	-0.2006	-0.0997	0.0145	0.0296	-0.0105	-0.0238	0.0464	-0.0002	0.055	18.98	12.498	38.007
23	5.9331	-0.0534	-1.5759	1.3123	-0.1349	2.941	-0.0803	0.3594	-0.0412	-0.0956	0.0586	-0.1318	-0.0679	-0.0495	0.0216	0.0431	-0.0323	0.0086	0.0395	-0.0124	0.0342	23.504	5.494	34.154
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25	1.6602	-1.6471	-1.9809	3.4613	2.7813	3.6456	-0.1164	-0.0871	-0.0475	0.0252	0.0544	-0.0176	0.2116	0.125	0.062	0.0613	-0.0006	0.0063	0.0296	0.0028	0.0398	35.761	9.893	37.546
26	0.9133	-3.9975	-1.7887	17.6696	7.0346	7.1471	0.0703	-0.1112	0.2115	0.108	-0.1686	0.1726	-0.7398	-0.6279	0.0983	0.1118	0.0518	-0.0245	0.0457	-0.0722	0.068	27.809	28.218	47.285
27	0.8542	-2.6794	-1.6954	12.5005	8.0271	11.5417	-0.0765	0.0348	0.3444	-0.2194	-0.0928	0.0933	-0.4769	-0.175	0.1693	0.0474	0.0149	0.0026	0.0383	0.0026	0.077	32.451	25.362	37.485
28	3.2218	-1.7636	-1.1096	4.9692	0.4091	0.6639	0.0392	0.0812	0.0013	-0.1169	-0.0716	0.104	-0.0613	-0.0704	0.0324	0.049	0.0036	0.0028	0.0252	-0.0051	0.0243	34.138	14.929	36.08
29	2.5675	2.3856	2.8468	2.8086	1.3107	7.1296	0.018	-0.0995	-0.3531	-0.0468	-0.1038	-0.2362	0.2351	0.3077	0.0859	-0.0004	0.0184	0.0002	0.061	0.0308	0.0695	44.574	10.172	41.829
30	2.3741	-0.372	1.0085	1.8256	0.0023	0.8046	0.0377	-0.0453	0.0443	-0.0348	-0.119	-0.0285	-0.0704	0.0696	0.0813	0.0133	-0.0127	-0.0143	0.0783	0.0132	0.0205	43.412	20.42	43.852
31	2.912	3.4851	1.1681	5.438	4.1668	6.519	0.0295	-0.1061	0.328	-0.1219	-0.3003	0.3067	-0.1987	0.0015	0.2708	0.0469	-0.0073	-0.0282	0.0242	0.0056	0.0541	41.938	27.219	40.721
32	9.9669	1.4747	-4.1938	4.4952	4.104	18.6499	0.4015	-1.3887	0.1904	0.3524	-0.1485	-0.2115	-0.494	0.7553	-0.2531	0.1133	-0.0599	-0.0068	0.1223	0.0006	0.1175	43.184	32.178	45.236
33	6.0005	3.6322	-3.8077	5.7143	-1.1352	7.4518	0.3823	-0.4153	0.2978	0.321	-0.2263	0.013	-0.4996	0.598	-0.156	0.0635	-0.056	-0.0178	0.0896	-0.0243	0.0144	37.089	23.534	50.332
34	15.2215	5.1934	0.5101	5.4196	0.8363	7.7347	0.046	-0.3411	-0.1982	0.051	-0.1569	0.1033	0.3107	-0.2493	0.1108	0.0832	-0.0179	-0.0029	0.053	0.009	0.0116	33.049	14.483	53.739
35	4.0659	1.4612	2.1733	3.8927	0.8403	2.8046	0.0197	-0.3305	-0.2828	0.1823	-0.0386	-0.1691	0.0594	0.0791	0.019	0.0059	-0.0059	-0.0118	0.0824	0.0514	0.0269	43.576	12.491	49.857
36	11.5937	2.8323	0.6625	7.396	2.3733	3.6883	0.0978	-0.296	-0.5744	0.408	-0.0671	-0.3022	0.2617	0.1316	-0.0306	0.0616	-0.0037	0.0017	0.0434	0.0205	0.0728	37.634	5.387	46.655
37	16.5782	-0.7139	1.844	4.3407	0.1505	6.7525	-0.1074	-0.2824	-0.1109	0.1535	0.008	-0.1118	0.009	0.0183	0.0994	0.0829	-0.0165	0.0081	0.0502	0.0165	0.0597	30.459	5.756	47.427
38	6.4517	4.3087	-1.8806	5.206	-0.2385	2.6072	-0.0166	-0.1011	-0.3712	-0.0928	-0.0421	-0.146	0.1431	-0.214	0.0587	0.0578	-0.0074	0.0003	0.0198	-0.004	0.0509	28.116	5.683	40.994
39	1.6139	2.6793	0.4063	8.0046	1.7055	1.1978	0.074	-0.0738	0.0554	0.1041	-0.1496	-0.0412	0.0229	-0.054	0.0756	0.0404	-0.0048	-0.008	0.0472	-0.0086	0.0285	31.401	18.593	45.691
40	5.5156	1.9338	-2.3326	5.9108	-1.3189	12.5678	-0.0695	-0.1952	0.301	0.0681	0.1898	0.535	-0.4009	-0.9251	-0.1203	0.0684	-0.0076	-0.0027	0.089	-0.0096	0.0122	30.596	24.865	54.362
41	3.2312	-2.6284	-1.6037	5.7652	4.0693	3.5463	-0.0013	0.2231	0.0314	-0.102	-0.1017	0.0849	-0.0643	-0.2047	0.1031	0.0255	0.0102	-0.0071	0.0347	0.0104	0.0242	38.568	23.055	10.639
42	13.136	0.1549	-0.8607	0.3528	-0.1851	4.4972	-0.0666	0.4385	-0.0488	-0.0177	0.0351	-0.074	0.0484	0.0755	0.0314	0.0604	-0.0056	-0.0152	0.0492	-0.0067	0.0435	46.374	20.583	4.724
43	3.6693	-0.9263	1.5983	1.631	-1.2674	2.195	0.0225	0.0697	-0.2022	0.0747	-0.0429	0.0074	-0.082	0.3	0.0204	0.0209	-0.0058	-0.0105	0.0622	0.0004	0.0193	47.323	16.569	37.875
44	4.4463	2.857	0.2119	2.0759	0.699	1.3297	-0.0235	0.046	-0.0457	0.0566	0.003	0.025	0.0595	0.0278	0.0205	0.0488	0.0011	0.0072	0.0517	-0.0016	0.0279	39.218	14.606	31.844

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	A	1 - 6	1 - 6
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	A	7 - 11	7 - 11
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	A	12 - 16	12 - 16
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	A	17 - 21	17 - 21
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	A	22 - 25	22 - 25
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	A	26 - 31	26 - 31
7	X-RAY DIFFRACTION	7	A	A	32 - 38	32 - 38
8	X-RAY DIFFRACTION	8	A	A	39 - 45	39 - 45
9	X-RAY DIFFRACTION	9	A	A	46 - 51	46 - 51
10	X-RAY DIFFRACTION	10	A	A	52 - 57	52 - 57
11	X-RAY DIFFRACTION	11	A	A	58 - 67	58 - 67
12	X-RAY DIFFRACTION	12	A	A	68 - 72	68 - 72
13	X-RAY DIFFRACTION	13	A	A	73 - 79	73 - 79
14	X-RAY DIFFRACTION	14	A	A	80 - 84	80 - 84
15	X-RAY DIFFRACTION	15	A	A	85 - 90	85 - 90
16	X-RAY DIFFRACTION	16	A	A	91 - 96	91 - 96
17	X-RAY DIFFRACTION	17	A	A	97 - 100	97 - 100
18	X-RAY DIFFRACTION	18	A	A	101 - 107	101 - 107
19	X-RAY DIFFRACTION	19	A	A	108 - 112	108 - 112
20	X-RAY DIFFRACTION	20	A	A	113 - 118	113 - 118
21	X-RAY DIFFRACTION	21	B	B	3 - 8	3 - 8
22	X-RAY DIFFRACTION	22	B	B	9 - 13	9 - 13
23	X-RAY DIFFRACTION	23	B	B	14 - 20	14 - 20
24	X-RAY DIFFRACTION	24	B	B	21 - 26	21 - 26
25	X-RAY DIFFRACTION	25	B	B	27 - 36	27 - 36
26	X-RAY DIFFRACTION	26	B	B	37 - 42	37 - 42
27	X-RAY DIFFRACTION	27	B	B	43 - 48	43 - 48
28	X-RAY DIFFRACTION	28	B	B	49 - 53	49 - 53
29	X-RAY DIFFRACTION	29	B	B	54 - 58	54 - 58
30	X-RAY DIFFRACTION	30	B	B	59 - 66	59 - 66
31	X-RAY DIFFRACTION	31	B	B	67 - 70	67 - 70
32	X-RAY DIFFRACTION	32	B	B	71 - 75	71 - 75
33	X-RAY DIFFRACTION	33	B	B	76 - 81	76 - 81
34	X-RAY DIFFRACTION	34	B	B	82 - 87	82 - 87
35	X-RAY DIFFRACTION	35	B	B	88 - 93	88 - 93
36	X-RAY DIFFRACTION	36	B	B	94 - 98	94 - 98
37	X-RAY DIFFRACTION	37	B	B	99 - 102	99 - 102
38	X-RAY DIFFRACTION	38	B	B	103 - 107	103 - 107
39	X-RAY DIFFRACTION	39	B	B	108 - 112	108 - 112
40	X-RAY DIFFRACTION	40	B	B	113 - 118	113 - 118
41	X-RAY DIFFRACTION	41	C	C	1 - 6	1 - 6
42	X-RAY DIFFRACTION	42	C	C	7 - 12	7 - 12
43	X-RAY DIFFRACTION	43	D	D	1 - 6	1 - 6
44	X-RAY DIFFRACTION	44	D	D	7 - 12	7 - 12

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