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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 2ju7 | ||||||
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タイトル | Solution-State Structures of Oleate-Liganded LFABP, Protein Only | ||||||
要素 | Fatty acid-binding protein, liver | ||||||
キーワード | LIPID BINDING PROTEIN / protein (タンパク質) / apo / LFABP / iLBP / FABP / Acetylation (アセチル化) / Cytoplasm (細胞質) / Lipid-binding / Phosphorylation (リン酸化) / Transport | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 Regulation of lipid metabolism by PPARalpha / Triglyceride catabolism / lysophospholipid:sodium symporter activity / Heme degradation / response to vitamin B3 / Cytoprotection by HMOX1 / oleic acid binding / apical cortex / positive regulation of fatty acid beta-oxidation / bile acid binding ...Regulation of lipid metabolism by PPARalpha / Triglyceride catabolism / lysophospholipid:sodium symporter activity / Heme degradation / response to vitamin B3 / Cytoprotection by HMOX1 / oleic acid binding / apical cortex / positive regulation of fatty acid beta-oxidation / bile acid binding / intestinal absorption / long-chain fatty acid transmembrane transporter activity / heterocyclic compound binding / antioxidant activity / peroxisomal matrix / fatty acid transport / long-chain fatty acid transport / fatty acid binding / phospholipid binding / cellular response to hydrogen peroxide / cellular response to hypoxia / chromatin binding / negative regulation of apoptotic process / protein-containing complex / 核質 / 細胞核 / 細胞質基質 / 細胞質 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Rattus norvegicus (ドブネズミ) | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing, torsion angle dynamics | ||||||
Model details | The structures are that of the fully oleate-liganded LFABP (protein-ligand ratio 1:2). However, ...The structures are that of the fully oleate-liganded LFABP (protein-ligand ratio 1:2). However, they are drived from information pertaining protein alone. A major form of the complex coordinates is deposited separately. | ||||||
データ登録者 | He, Y. / Yang, X. / Wang, H. / Estephan, R. / Francis, F. / Kodukula, S. / Storch, J. / Stark, R.E. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2007 タイトル: Solution-State Molecular Structure of Apo and Oleate-Liganded Liver Fatty Acid-Binding Protein 著者: He, Y. / Yang, X. / Wang, H. / Estephan, R. / Francis, F. / Kodukula, S. / Storch, J. / Stark, R.E. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 2ju7.cif.gz | 394.2 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb2ju7.ent.gz | 340.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 2ju7.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ju/2ju7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ju/2ju7 | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
関連構造データ | 2ju3C 2ju8C C: 同じ文献を引用 (文献) |
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類似構造データ | |
その他のデータベース |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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NMR アンサンブル |
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-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 14293.544 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 遺伝子: Fabp1 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / Variant (発現宿主): pLys / 参照: UniProt: P02692 |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR 詳細: The structures are that of the fully oleate-liganded LFABP (protein-ligand ratio 1:2). However, they are drived from information pertaining protein alone. A major form of the complex ...詳細: The structures are that of the fully oleate-liganded LFABP (protein-ligand ratio 1:2). However, they are drived from information pertaining protein alone. A major form of the complex coordinates is deposited separately. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: RDC data from sample 4 are not used (and hence not reported) because the medium (C12E5) competes with LFABP for oleate |
-試料調製
詳細 |
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試料 |
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