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Yorodumi- PDB-3bt7: Structure of E. coli 5-Methyluridine Methyltransferase TrmA in co... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3bt7 | ||||||
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Title | Structure of E. coli 5-Methyluridine Methyltransferase TrmA in complex with 19 nucleotide T-arm analogue | ||||||
Components |
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Keywords | TRANSFERASE/RNA / methyluridine / methyltransferase / TrmA / RUMT / S-adenosyl-L-methionine / tRNA processing / TRANSFERASE-RNA COMPLEX | ||||||
Function / homology | Function and homology information tRNA (uracil(54)-C5)-methyltransferase activity, S-adenosyl methionine-dependent / tRNA (uracil54-C5)-methyltransferase / tRNA methylation / Transferases; Transferring one-carbon groups; Methyltransferases / tRNA binding / rRNA binding / cytosol Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Escherichia coli (E. coli) synthetic construct (others) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / SAD / MAD / Resolution: 2.43 Å | ||||||
Authors | Alian, A. / Stroud, R.M. / Finer-Moore, J. | ||||||
Citation | Journal: Proc.Natl.Acad.Sci.Usa / Year: 2008 Title: Structure of a TrmA-RNA complex: A consensus RNA fold contributes to substrate selectivity and catalysis in m5U methyltransferases. Authors: Alian, A. / Lee, T.T. / Griner, S.L. / Stroud, R.M. / Finer-Moore, J. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3bt7.cif.gz | 186.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3bt7.ent.gz | 144.4 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3bt7.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 3bt7_validation.pdf.gz | 481.2 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 3bt7_full_validation.pdf.gz | 518.5 KB | Display | |
Data in XML | 3bt7_validation.xml.gz | 36.3 KB | Display | |
Data in CIF | 3bt7_validation.cif.gz | 51.6 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bt/3bt7 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/bt/3bt7 | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 2bh2S S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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