登録情報 | データベース: PDB / ID: 2n82 |
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タイトル | solution structure of the complex of microRNA 20b pre-element with Rbfox RRM |
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要素 | - RNA (5'-R(*GP*GP*UP*AP*GP*UP*UP*UP*UP*GP*GP*CP*AP*UP*GP*AP*CP*UP*CP*UP*AP*CP*C)-3')
- RNA binding protein fox-1 homolog 1
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キーワード | RNA BINDING PROTEIN/RNA / microRNA / RRM / Rbfox / RNA BINDING PROTEIN-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
MECP2 regulates transcription factors / RNA transport / nuclear stress granule / regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome / RNA splicing / trans-Golgi network / cytoplasmic stress granule / mRNA processing / nervous system development / mRNA binding ...MECP2 regulates transcription factors / RNA transport / nuclear stress granule / regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome / RNA splicing / trans-Golgi network / cytoplasmic stress granule / mRNA processing / nervous system development / mRNA binding / RNA binding / nucleus / cytoplasm類似検索 - 分子機能 : / RNA binding protein Fox-1 / Fox-1 C-terminal domain / Calcitonin gene-related peptide regulator C terminal / FOX1, RNA recognition motif / RRM (RNA recognition motif) domain / RNA recognition motif / RNA recognition motif / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain ...: / RNA binding protein Fox-1 / Fox-1 C-terminal domain / Calcitonin gene-related peptide regulator C terminal / FOX1, RNA recognition motif / RRM (RNA recognition motif) domain / RNA recognition motif / RNA recognition motif / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / RNA-binding domain superfamily / Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 RNA / RNA (> 10) / RNA binding protein fox-1 homolog 1類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Homo sapiens (ヒト) synthetic construct (人工物) |
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手法 | 溶液NMR / restrained simulated annealing |
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データ登録者 | Yang, F. / Chen, Y. / Varani, G. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2016 タイトル: Rbfox proteins regulate microRNA biogenesis by sequence-specific binding to their precursors and target downstream Dicer. 著者: Chen, Y. / Zubovic, L. / Yang, F. / Godin, K. / Pavelitz, T. / Castellanos, J. / Macchi, P. / Varani, G. |
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履歴 | 登録 | 2015年9月30日 | 登録サイト: BMRB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2016年4月13日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年6月1日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年6月14日 | Group: Data collection / Database references / Other カテゴリ: database_2 / pdbx_database_status ...database_2 / pdbx_database_status / pdbx_nmr_software / pdbx_nmr_spectrometer / struct_ref_seq_dif Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_nmr_data / _pdbx_nmr_software.name / _pdbx_nmr_spectrometer.model / _struct_ref_seq_dif.details |
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改定 1.3 | 2024年5月15日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / Item: _database_2.pdbx_DOI |
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