PDB-2j1k: CAV-2 fibre head in complex with CAR D1

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 2j1k

タイトル

CAV-2 fibre head in complex with CAR D1

要素

COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR
FIBER PROTEIN

キーワード

VIRUS/RECEPTOR / VIRUS-RECEPTOR COMPLEX / COMPLEX / MEMBRANE / RECEPTOR / PALMITATE / DOMAIN D1 / IMMUNOGLOBULIN DOMAIN / HOST-VIRUS INTERACTION / GLYCOPROTEIN / FIBER PROTEIN / CELL ADHESION / PHOSPHORYLATION / TRANSMEMBRANE / TIGHT JUNCTION / COXSACKIEVIRUS / FIBER HEAD / ADENOVIRUS / FIBRE HEAD / LIPOPROTEIN / CAR / KNOB / FIBER / FIBRE / CAV-2 / CANINE

機能・相同性

機能・相同性情報

AV node cell-bundle of His cell adhesion involved in cell communication / cell adhesive protein binding involved in AV node cell-bundle of His cell communication / homotypic cell-cell adhesion / AV node cell to bundle of His cell communication / epithelial structure maintenance / regulation of AV node cell action potential / gamma-delta T cell activation / germ cell migration / apicolateral plasma membrane / transepithelial transport ...
類似検索 - 分子機能

生物種

HOMO SAPIENS (ヒト)

CANINE ADENOVIRUS 2 (ウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.3 Å

データ登録者

Seiradake, E. / Lortat-Jacob, H. / Billet, O. / Kremer, E.J. / Cusack, S.

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2006
タイトル: Structural and Mutational Analysis of Human Ad37 and Canine Adenovirus 2 Fiber Heads in Complex with the D1 Domain of Coxsackie and Adenovirus Receptor.
著者: Seiradake, E. / Lortat-Jacob, H. / Billet, O. / Kremer, E.J. / Cusack, S.

履歴

登録	2006年8月14日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2006年9月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2011年7月13日	Group: Advisory / Refinement description / Version format compliance
改定 1.2	2023年12月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf

Remark 700

SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN ...

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
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PDB形式	pdb2j1k.ent.gz	596.8 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j1/2j1k ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/j1/2j1k	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	2j12C 2j2jC 1kacS 1nob 1p69 1p6a S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4dep-2 5ilq-d 7jve-1 3osv-d 4dep-1 1a3g-d 3csu-d 5vmq-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#132 - 2010年12月アデノウイルス (Adenovirus) 類似性 (7) #247 - 2020年7月ミエリン関連糖タンパク質 (Myelin-associated Glycoprotein) 類似性 (1) #267 - 2022年3月血管内皮増殖因子と血管新生 (Vascular Endothelial Growth Factor (VegF) 類似性 (1)

登録構造単位

A: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

B: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

C: FIBER PROTEIN

D: FIBER PROTEIN

E: FIBER PROTEIN

F: FIBER PROTEIN

G: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

H: FIBER PROTEIN

I: FIBER PROTEIN

J: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

K: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

L: FIBER PROTEIN

M: FIBER PROTEIN

N: FIBER PROTEIN

O: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

P: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

Q: FIBER PROTEIN

R: FIBER PROTEIN

S: FIBER PROTEIN

T: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

V: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

X: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

Y: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

Z: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

431 kDa, 24 ポリマー
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1

C: FIBER PROTEIN

H: FIBER PROTEIN

I: FIBER PROTEIN

J: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

P: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

T: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
108 kDa, 6 ポリマー
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2

B: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

D: FIBER PROTEIN

E: FIBER PROTEIN

F: FIBER PROTEIN

K: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

O: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

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108 kDa, 6 ポリマー
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3

L: FIBER PROTEIN

M: FIBER PROTEIN

N: FIBER PROTEIN

V: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

X: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

Y: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
108 kDa, 6 ポリマー
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4

A: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

G: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

Q: FIBER PROTEIN

R: FIBER PROTEIN

S: FIBER PROTEIN

Z: COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
108 kDa, 6 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	219.940, 219.940, 387.530
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	97
Space group name H-M	I422

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	J
2	1	T
3	1	O
4	1	K
5	1	P
6	1	V
7	1	X
8	1	Y
9	1	A
10	1	G
11	1	Z

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	5	J	19 - 138
2	1	1	5	T	19 - 138
3	1	1	5	O	19 - 138
4	1	1	5	K	19 - 138
5	1	1	5	P	19 - 138
6	1	1	5	V	19 - 138
7	1	1	5	X	19 - 138
8	1	1	5	Y	19 - 138
9	1	1	5	A	19 - 138
10	1	1	5	G	19 - 138
11	1	1	5	Z	19 - 138

NCS oper:

ID	Code	Matrix	ベクター
1	given	(0.53004, 0.61192, -0.58704), (-0.34421, -0.47742, -0.80845), (-0.77497, 0.63058, -0.04242)	-54.14565, -73.6629, -96.04448
2	given	(0.65, -0.43147, -0.62557), (-0.48625, 0.39647, -0.7787), (0.58401, 0.81033, 0.04791)	-56.84053, -72.25405, -92.4303
3	given	(0.97581, 0.21846, -0.00865), (0.21847, -0.97584, 0.00035), (-0.00837, -0.00223, -0.99996)	-0.41819
4	given	(0.51792, -0.33659, -0.78643), (0.62118, -0.48408, 0.61628), (-0.58812, -0.8077, -0.04163)	-72.16747, 57.94273, -95.43645
5	given	(-0.75802, 0.6492, -0.06284), (0.09012, 0.00883, -0.99589), (-0.64598, -0.76057, -0.06519)	-112.36643
6	given	(0.0393, 0.00671, 0.99921), (0.64005, 0.76773, -0.03033), (-0.76733, 0.64074, 0.02587)	-14.26311
7	given	(-0.56797, -0.81982, -0.07288), (0.82276, -0.56788, -0.02384), (-0.02184, -0.07351, 0.99706)	-112.47817
8	given	(0.06908, 0.0029, 0.99761), (-0.81144, 0.58189, 0.0545), (-0.58034, -0.81326, 0.04255)	-13.37688
9	given	(-0.55491, -0.82684, -0.09168), (-0.10464, -0.03995, 0.99371), (-0.8253, 0.56101, -0.06435)	-113.47434
10	given	(-0.74554, 0.66137, -0.08221), (-0.66413, -0.74756, 0.00876), (-0.05567, 0.06113, 0.99658)	-113.29464
11	given	(0.4467, 0.48702, -0.75052), (0.45129, 0.60167, 0.65904), (0.77253, -0.63309, 0.04897)	-68.69341, 60.02513, -91.79252

#1: タンパク質	COXSACKIEVIRUS AND ADENOVIRUS RECEPTOR / COXSACKIEVIRUS B-ADENOVIRUS RECEPTOR / HCAR / CVB3-BINDING PROTEIN / HCVADR 分子量: 14251.245 Da / 分子数: 12 / 断片: D1 DOMAIN, RESIDUES 15-140 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) HOMO SAPIENS (ヒト) / プラスミド: PAB3 / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): XL1 BLUE / 参照: UniProt: P78310
#2: タンパク質	FIBER PROTEIN / CANINE ADENOVIRUS 2 FIBRE HEAD / PIV 分子量: 21685.541 Da / 分子数: 12 / 断片: FIBRE HEAD DOMAIN, RESIDUES 358-542 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) CANINE ADENOVIRUS 2 (ウイルス) / プラスミド: PQE / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): M15 / 参照: UniProt: Q65914
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1881 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
配列の詳細	CONTAINS N-TERMINAL 6XHIS TAG

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.8 Å³/Da / 溶媒含有率: 56 %

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-2 / 波長: 0.933
検出器	タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.933 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.3→47.7 Å / Num. obs: 200033 / % possible obs: 96 % / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.01 / Net I/σ(I): 13.37
反射シェル	解像度: 2.3→2.38 Å / 冗長度: 3.75 % / R_merge(I) obs: 0.47 / Mean I/σ(I) obs: 3.1 / % possible all: 93

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
REFMAC	5.2.0019	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1KAC

1kac

解像度: 2.3→192.45 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.955 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.931 / SU B: 10.615 / SU ML: 0.14 / TLS residual ADP flag: LIKELY RESIDUAL / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.27 / ESU R Free: 0.208 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.22	1890	1 %	RANDOM
R_work	0.172	-	-	-
obs	0.172	188596	92 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso mean: 27.18 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.29 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.29 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.57 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.3→192.45 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	28097	0	0	1881	29978

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.01	0.022	28743
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.001	0.02	19279
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.248	1.962	39134
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	0.843	3.001	47293
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.86	5	3596
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	36.774	24.727	1189
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.935	15	4769
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	12.308	15	127
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.073	0.2	4480
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.004	0.02	31714
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.001	0.02	5513
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_refined	0.179	0.2	4624
X-RAY DIFFRACTION	r_nbd_other	0.192	0.2	20235
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_refined	0.169	0.2	13842
X-RAY DIFFRACTION	r_nbtor_other	0.083	0.2	15527
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_refined	0.153	0.2	1757
X-RAY DIFFRACTION	r_xyhbond_nbd_other
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_refined	0.155	0.2	17
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_vdw_other	0.184	0.2	57
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_refined	0.227	0.2	18
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_hbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_symmetry_metal_ion_other
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.594	1.5	23304
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	0.086	1.5	7270
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.699	2	29460
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	1.135	3	12570
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_other
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	1.649	4.5	9674
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_other
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_refined
X-RAY DIFFRACTION	r_long_range_B_other
X-RAY DIFFRACTION	r_rigid_bond_restr
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_free
X-RAY DIFFRACTION	r_sphericity_bonded

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	数	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	J	669	medium positional	0.19	0.5
2	T	669	medium positional	0.15	0.5
3	O	669	medium positional	0.27	0.5
4	K	669	medium positional	0.19	0.5
5	P	669	medium positional	0.18	0.5
6	V	669	medium positional	0.2	0.5
7	X	669	medium positional	0.18	0.5
8	Y	669	medium positional	0.16	0.5
9	A	669	medium positional	0.17	0.5
10	G	669	medium positional	0.18	0.5
11	Z	669	medium positional	0.24	0.5
1	J	827	loose positional	0.6	5
2	T	827	loose positional	0.67	5
3	O	827	loose positional	0.72	5
4	K	827	loose positional	0.66	5
5	P	827	loose positional	0.66	5
6	V	827	loose positional	0.63	5
7	X	827	loose positional	0.65	5
8	Y	827	loose positional	0.64	5
9	A	827	loose positional	0.7	5
10	G	827	loose positional	0.62	5
11	Z	827	loose positional	0.86	5
1	J	669	medium thermal	0.28	2
2	T	669	medium thermal	0.21	2
3	O	669	medium thermal	0.3	2
4	K	669	medium thermal	0.27	2
5	P	669	medium thermal	0.24	2
6	V	669	medium thermal	0.2	2
7	X	669	medium thermal	0.23	2
8	Y	669	medium thermal	0.21	2
9	A	669	medium thermal	0.21	2
10	G	669	medium thermal	0.32	2
11	Z	669	medium thermal	0.21	2
1	J	827	loose thermal	0.86	10
2	T	827	loose thermal	0.69	10
3	O	827	loose thermal	0.73	10
4	K	827	loose thermal	0.84	10
5	P	827	loose thermal	0.62	10
6	V	827	loose thermal	0.62	10
7	X	827	loose thermal	0.7	10
8	Y	827	loose thermal	0.52	10
9	A	827	loose thermal	0.59	10
10	G	827	loose thermal	0.9	10
11	Z	827	loose thermal	0.58	10

LS精密化シェル

解像度: 2.3→2.36 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.295	141	-
R_work	0.214	14134	-
obs	-	-	94.54 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	5.4057	0.1179	0.2549	3.068	-0.0615	3.2304	0.0686	-0.0309	-0.133	-0.1588	-0.1428	-0.7713	0.1558	0.6412	0.0742	-0.1667	0.0887	0.1448	0.1926	0.0414	0.2473	-48.3284	22.0717	-182.8389
2	7.3837	0.6382	-1.4214	4.5429	2.0652	2.7868	-1.0065	0.4324	-1.2312	0.7792	0.1159	0.2702	1.4614	-0.3694	0.8905	0.6498	-0.2607	0.475	-0.1015	-0.0633	0.1041	-52.4484	-32.1012	-101.021
3	0.9598	-0.0747	-0.2922	5.9427	0.6862	1.9139	0.0652	0.128	-0.0679	-0.5	-0.0294	-0.1305	-0.2796	-0.1226	-0.0358	-0.0435	0.1145	0.0581	-0.1322	0.0133	-0.2226	-103.1202	57.5347	-176.2967
4	2.5018	0.0911	-0.6885	0.9164	-0.1396	4.0701	-0.1287	-0.4093	0.0934	-0.0425	0.0032	-0.1303	0.0788	0.4543	0.1255	-0.2364	0.0504	-0.0707	0.002	-0.0868	-0.111	-21.9713	5.8628	-33.4058
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22	1.2181	-0.3066	0.1877	0.9525	-0.1049	0.8652	0.0399	0.1301	0.0679	-0.0351	-0.0828	-0.1971	-0.0863	0.0764	0.0429	-0.0776	-0.0097	0.0344	-0.0578	-0.0079	0.0022	-70.6951	33.7594	-174.5647
23	1.0816	-0.1197	0.0346	1.17	-0.0788	0.5339	-0.0154	-0.0466	-0.0304	0.1852	0.0383	0.0282	-0.0983	-0.0542	-0.0229	-0.0186	0.0303	0.0277	-0.0671	-0.0176	-0.0512	-92.3795	38.1126	-161.075
24	1.0171	-0.382	-0.1872	1.086	0.095	0.9252	-0.1087	-0.1571	-0.1995	0.1603	0.0856	-0.0907	0.0063	0.0633	0.0231	-0.0523	0.0247	-0.0213	-0.0815	0.0301	0.0049	-76.3341	19.0429	-154.056

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	19 - 135
2	X-RAY DIFFRACTION	2	B	17 - 138
3	X-RAY DIFFRACTION	3	G	17 - 139
4	X-RAY DIFFRACTION	4	J	17 - 139
5	X-RAY DIFFRACTION	5	K	16 - 138
6	X-RAY DIFFRACTION	6	O	19 - 139
7	X-RAY DIFFRACTION	7	P	17 - 139
8	X-RAY DIFFRACTION	8	T	19 - 137
9	X-RAY DIFFRACTION	9	V	17 - 137
10	X-RAY DIFFRACTION	10	X	17 - 139
11	X-RAY DIFFRACTION	11	Y	19 - 137
12	X-RAY DIFFRACTION	12	Z	19 - 135
13	X-RAY DIFFRACTION	13	C	361 - 542
14	X-RAY DIFFRACTION	14	D	361 - 542
15	X-RAY DIFFRACTION	15	E	361 - 542
16	X-RAY DIFFRACTION	16	F	361 - 542
17	X-RAY DIFFRACTION	17	H	361 - 542
18	X-RAY DIFFRACTION	18	I	361 - 542
19	X-RAY DIFFRACTION	19	L	361 - 542
20	X-RAY DIFFRACTION	20	M	361 - 542
21	X-RAY DIFFRACTION	21	N	361 - 542
22	X-RAY DIFFRACTION	22	Q	361 - 542
23	X-RAY DIFFRACTION	23	R	361 - 542
24	X-RAY DIFFRACTION	24	S	361 - 542

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlc1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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