登録情報 データベース : PDB / ID : 2eax 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of human PGRP-IBETAC in complex with glycosamyl muramyl pentapeptide 要素GLYCOSAMYL MURAMYL PENTAPEPTIDE Peptidoglycan recognition protein-I-beta 詳細キーワード PEPTIDOGLYCAN-BINDING PROTEIN / ALPHA/BETA機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
peptidoglycan immune receptor activity / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity / peptidoglycan binding / Antimicrobial peptides / detection of bacterium / peptidoglycan catabolic process / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / protein heterodimerization activity ... peptidoglycan immune receptor activity / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase activity / peptidoglycan binding / Antimicrobial peptides / detection of bacterium / peptidoglycan catabolic process / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / protein heterodimerization activity / innate immune response / protein-containing complex / zinc ion binding / extracellular region / membrane 類似検索 - 分子機能 Peptidoglycan recognition protein family domain, metazoa/bacteria / Peptidoglycan recognition protein / Animal peptidoglycan recognition proteins homologous to Bacteriophage T3 lysozyme. / Lysozyme-like / Peptidoglycan recognition protein-like / Ami_2 / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain / N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase/PGRP domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 Peptidoglycan recognition protein 4 / Peptidoglycan recognition protein 4 類似検索 - 構成要素生物種 Homo sapiens (ヒト)手法 X線回折 / 分子置換 / 解像度 : 2.1 Å 詳細データ登録者 Cho, S. 引用ジャーナル : Proc.Natl.Acad.Sci.Usa / 年 : 2007タイトル : Structural insights into the bactericidal mechanism of human peptidoglycan recognition proteins著者 : Cho, S. / Wang, Q. / Swaminathan, C.P. / Hesek, D. / Lee, M. / Boons, G.J. / Mobashery, S. / Mariuzza, R.A. 履歴 登録 2007年2月3日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2007年10月2日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月27日 Group : Database references / Derived calculations / Non-polymer description改定 1.3 2011年9月14日 Group : Non-polymer description改定 1.4 2011年9月21日 Group : Source and taxonomy / Structure summary改定 1.5 2014年12月17日 Group : Atomic model / Derived calculations改定 2.0 2020年7月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Structure summary カテゴリ : atom_site / chem_comp ... atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_validate_polymer_linkage / struct_asym / struct_conn / struct_site / struct_site_gen Item : _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ... _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id 解説 : Carbohydrate remediation / Provider : repository / タイプ : Remediation改定 2.1 2023年10月25日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ : chem_comp / chem_comp_atom ... chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item : _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
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