+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1yva | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | NMR solution structure of crambin in DPC micelles | ||||||
![]() | Crambin | ||||||
![]() | PLANT PROTEIN / crambin / DPC / micelles | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
![]() | Ahn, H.-C. / Markley, J.L. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Three-Dimensional Structure of the Water-Insoluble Protein Crambin in Dodecylphosphocholine Micelles and Its Minimal Solvent-Exposed Surface 著者: Ahn, H.-C. / Juranic, N. / Macura, S. / Markley, J.L. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 249.6 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 216.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 339.7 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 485.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 24.4 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 37.8 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| |||||||||
NMR アンサンブル |
|
-
要素
#1: タンパク質・ペプチド | 分子量: 4738.447 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 生物種: Crambe hispanica / 株: subsp. abyssinica / 遺伝子: THI2 / プラスミド: pET3a/SN_crambin / 発現宿主: ![]() ![]() |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
NMR実験 |
|
-
試料調製
詳細 | 内容: 0.5 mM crambin U-15N,13C, pH 6.0, 20 mM phosphate buffer, 300mM DPC, 90% H2O, 10% D2O 溶媒系: 300 mM DPC, 20 mM phosphate buffer, 90% H2O, 10% D2O |
---|---|
試料状態 | イオン強度: 0 / pH: 6.0 / 圧: ambient / 温度: 298 K |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
|
-
解析
NMR software |
| ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 | ||||||||||||
代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 20 |