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Yorodumi- PDB-1tmf: THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THEILER MURINE ENCEPHALOMYELITIS V... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 1tmf | |||||||||
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Title | THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THEILER MURINE ENCEPHALOMYELITIS VIRUS (BEAN STRAIN) | |||||||||
Components |
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Keywords | VIRUS / COAT PROTEIN / Icosahedral virus | |||||||||
Function / homology | Function and homology information RNA-protein covalent cross-linking / : / host cell nucleolus / symbiont-mediated suppression of host mRNA export from nucleus / picornain 3C / T=pseudo3 icosahedral viral capsid / host cell cytoplasmic vesicle membrane / : / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity ...RNA-protein covalent cross-linking / : / host cell nucleolus / symbiont-mediated suppression of host mRNA export from nucleus / picornain 3C / T=pseudo3 icosahedral viral capsid / host cell cytoplasmic vesicle membrane / : / protein complex oligomerization / monoatomic ion channel activity / symbiont-mediated suppression of host cytoplasmic pattern recognition receptor signaling pathway via inhibition of IRF3 activity / RNA helicase activity / RNA helicase / induction by virus of host autophagy / RNA-directed RNA polymerase / symbiont entry into host cell / symbiont-mediated suppression of host gene expression / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / structural molecule activity / virion attachment to host cell / ATP hydrolysis activity / proteolysis / RNA binding / ATP binding / membrane / metal ion binding Similarity search - Function | |||||||||
Biological species | Theiler's encephalomyelitis virus | |||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / Resolution: 3.5 Å | |||||||||
Authors | Luo, M. / Toth, K.S. | |||||||||
Citation | Journal: Proc.Natl.Acad.Sci.USA / Year: 1992 Title: Three-dimensional structure of Theiler murine encephalomyelitis virus (BeAn strain). Authors: Luo, M. / He, C. / Toth, K.S. / Zhang, C.X. / Lipton, H.L. | |||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 1tmf.cif.gz | 159.3 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb1tmf.ent.gz | 117.9 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 1tmf.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tm/1tmf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/tm/1tmf | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Similar structure data |
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-Links
-Assembly
Deposited unit |
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1 |
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
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3 |
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| x 6|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 |
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6 |
| x 30|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Atom site foot note | 1: PEPTIDE BOND DEVIATES SIGNIFICANTLY FROM TRANS CONFORMATION 2: CIS PROLINE - PRO 2 85 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Symmetry | Point symmetry: (Hermann–Mauguin notation: 532 / Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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