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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1q10 | ||||||
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タイトル | Ensemble of 40 Structures of the Dimeric Mutant of the B1 Domain of Streptococcal Protein G | ||||||
![]() | Immunoglobulin G binding protein G | ||||||
![]() | PROTEIN BINDING / GB1 / core mutants / domain-swapping / oligomerization | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / simulated annealing | ||||||
Model type details | minimized average | ||||||
![]() | Byeon, I.J. / Louis, J.M. / Gronenborn, A.M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: A Protein Contortionist: Core Mutations of GB1 that Induce Dimerization and Domain Swapping 著者: Byeon, I.J. / Louis, J.M. / Gronenborn, A.M. #1: ![]() タイトル: A Novel, Highly Stable Fold of the Immunoglobulin Binding Domain of Streptococcal Protein G 著者: Gronenborn, A.M. / Filpula, D.R. / Essig, N.Z. / Achari, A. / Whitlow, M. / Wingfield, P.T. / Clore, G.M. #2: ![]() タイトル: Core Mutations Switch Monomeric Protein GB1 Into an Intertwined Tetramer 著者: Frank, M.K. / Dyda, F. / Dobrodumov, A. / Gronenborn, A.M. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 1.3 MB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 355.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 810 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 89.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 137 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: 抗体 | 分子量: 6226.835 Da / 分子数: 2 / 断片: B1 Domain / 変異: T228Q,L231V,F256V,Y259F,A260F / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 遺伝子: SPG / プラスミド: pET11A / 発現宿主: ![]() ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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NMR実験の詳細 | Text: The structure was determined using triple-resonance NMR spectroscopy. |
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試料調製
詳細 |
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試料状態 | イオン強度: 50mM sodium phosphate buffer / pH: 5.5 / 圧: ambient / 温度: 298 K | ||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 手法: other / 詳細: NMR |
-NMR測定
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M | ||||||||||||||||||||||||||||||
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放射波長 | 相対比: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||
NMRスペクトロメーター |
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解析
NMR software |
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精密化 | 手法: simulated annealing / ソフトェア番号: 1 詳細: The structures are based on a total of 1311 constraints per monomeric subunit: 1035 NOE-derived distance constraints, 72 hydrogen bond distance constraints, 148 dihedral angle constraints, ...詳細: The structures are based on a total of 1311 constraints per monomeric subunit: 1035 NOE-derived distance constraints, 72 hydrogen bond distance constraints, 148 dihedral angle constraints, and 56 residual N-H dipolar coupling constraints. | ||||||||||||||||||||||||
代表構造 | 選択基準: minimized average structure | ||||||||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy,target function 計算したコンフォーマーの数: 100 / 登録したコンフォーマーの数: 40 |