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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nhl | ||||||
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タイトル | SNAP-23N Structure | ||||||
![]() | Synaptosomal-associated protein 23 | ||||||
![]() | PROTEIN TRANSPORT / SNARE / COILED-COIL | ||||||
機能・相同性 | ![]() vesicle targeting / synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane / trans-Golgi Network Vesicle Budding / post-Golgi vesicle-mediated transport / SNAP receptor activity / SNARE complex / specific granule / histamine secretion by mast cell / RHOF GTPase cycle / syntaxin binding ...vesicle targeting / synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane / trans-Golgi Network Vesicle Budding / post-Golgi vesicle-mediated transport / SNAP receptor activity / SNARE complex / specific granule / histamine secretion by mast cell / RHOF GTPase cycle / syntaxin binding / azurophil granule / RHOB GTPase cycle / synaptic vesicle priming / RHOJ GTPase cycle / exocytosis / RHOQ GTPase cycle / tertiary granule membrane / CDC42 GTPase cycle / RHOA GTPase cycle / RAC3 GTPase cycle / specific granule membrane / RAC1 GTPase cycle / Translocation of SLC2A4 (GLUT4) to the plasma membrane / adherens junction / phagocytic vesicle membrane / protein transport / presynapse / ER-Phagosome pathway / membrane fusion / neuron projection / cilium / focal adhesion / Neutrophil degranulation / mitochondrion / extracellular exosome / nucleoplasm / plasma membrane / cytoplasm 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Freedman, S.J. / Song, H.K. / Xu, Y. / Eck, M.J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Homotetrameric Structure of the SNAP-23 N-terminal Coiled-coil Domain 著者: Freedman, S.J. / Song, H.K. / Xu, Y. / Sun, Z.Y. / Eck, M.J. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 22.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 14.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 410 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 411.7 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 6.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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2 | ![]()
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単位格子 |
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詳細 | The biological assembly is a tetramer. |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 6318.813 Da / 分子数: 1 / 断片: SNAP-23 N-terminal coiled-coil domain / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
Has protein modification | Y |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 1.97 Å3/Da / 溶媒含有率: 37.53 % | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: HEPES, CALCIUM CHLORIDE, PEG 400, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 23 ℃ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 4 / 検出器: CCD / 日付: 2002年9月2日 |
放射 | プロトコル: MAD / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.3→50 Å / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 50 Å / Num. obs: 1801 / % possible obs: 91.7 % / Rmerge(I) obs: 0.044 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.3→20 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 20 Å | ||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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