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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1nco | ||||||
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タイトル | STRUCTURE OF THE ANTITUMOR PROTEIN-CHROMOPHORE COMPLEX NEOCARZINOSTATIN | ||||||
![]() | HOLO-NEOCARZINOSTATIN | ||||||
![]() | ANTIBACTERIAL AND ANTITUMOR PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Kim, K.-H. / Kwon, B.-M. / Myers, A.G. / Rees, D.C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of neocarzinostatin, an antitumor protein-chromophore complex. 著者: Kim, K.H. / Kwon, B.M. / Myers, A.G. / Rees, D.C. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 55.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 39.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Atom site foot note | 1: RESIDUES PRO A 9 AND PRO B 9 ARE CIS PROLINES. | ||||||||
詳細 | THE GENERAL NON-CRYSTALLOGRAPHIC TWO-FOLD AXIS BETWEEN TWO MOLECULES IN THE ASYMMETRIC UNIT WAS DETERMINED BY DENSITY CORRELATION STUDIES AND MANUAL MOLECULAR REPLACEMENT WITH MACROMOMYCIN STRUCTURE AS A MODEL. THE MOLECULE PREFIXED WITH "B" IS THE HOLO-NEOCARZINOSTATIN AND THE MOLECULE WITH "A" IS THE APO-NEOCARZINOSTATIN. THE CURRENT MODEL HAS 226 RESIDUES OF MOLECULES A AND B, 1 NEOCARZINOSTATIN-CHROMOPHORE, 1 MPD AND 161 WATER MOLECULES (1773 NON-HYDROGEN ATOMS TOTAL ). |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11100.055 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 参照: UniProt: P0A3R9 #2: 化合物 | ChemComp-MRD / ( | #3: 化合物 | ChemComp-CHR / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.79 Å3/Da / 溶媒含有率: 55.89 % | |||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 温度: 4 ℃ / pH: 5 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | |||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.7 Å / Num. obs: 23556 / % possible obs: 87.8 % / Num. measured all: 146707 / Rmerge(I) obs: 0.071 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | Rfactor obs: 0.199 / 最高解像度: 1.8 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.8 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 1.8 Å / Rfactor obs: 0.199 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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