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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1fcm | ||||||
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タイトル | CRYSTAL STRUCTURE OF THE E.COLI AMPC BETA-LACTAMASE MUTANT Q120L/Y150E COVALENTLY ACYLATED WITH THE INHIBITORY BETA-LACTAM, CLOXACILLIN | ||||||
![]() | BETA-LACTAMASE | ||||||
![]() | hydrolase/antibiotic / beta-lactamase beta-lactam complex / enzyme inhibitor complex / hydrolase-antibiotic complex | ||||||
機能・相同性 | ![]() antibiotic catabolic process / beta-lactamase activity / beta-lactamase / outer membrane-bounded periplasmic space / response to antibiotic 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Patera, A. / Blaszczak, L.C. / Shoichet, B.K. | ||||||
![]() | ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 2000 タイトル: Crystal Structures of Substrate and Inhibitor Complexes with AmpC -Lactamase: Possible Implications for Substrate-Assisted Catalysis 著者: Patera, A. / Blaszczak, L.C. / Shoichet, B.K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 145 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 120.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 535.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 560.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 18.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 28 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | |
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類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 39538.891 Da / 分子数: 2 / 変異: Q120L/Y150E / 由来タイプ: 組換発現 詳細: INHIBITOR CLOXACILLIN, RESIDUE CXU, BINDS TO SER 61 BY BREAKING ITS C1-N1 LACTAM BOND 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.51 Å3/Da / 溶媒含有率: 50.9 % | |||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.7 詳細: 1.7 M potassium phosphate, pH 8.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 106K | |||||||||||||||
結晶化 | *PLUS 温度: 23 ℃ / 詳細: microseeding | |||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 106 K |
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放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.46→20 Å / Net I/σ(I): 12.4 |
反射 | *PLUS Num. obs: 26662 / % possible obs: 92.8 % / Rmerge(I) obs: 0.121 |
反射 シェル | *PLUS % possible obs: 88.1 % / Rmerge(I) obs: 0.284 |
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解析
ソフトウェア | 名称: ![]() | |||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.46→20 Å / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0
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原子変位パラメータ |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.46→20 Å
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拘束条件 | *PLUS
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