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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 149l | ||||||
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タイトル | CONSERVATION OF SOLVENT-BINDING SITES IN 10 CRYSTAL FORMS OF T4 LYSOZYME | ||||||
![]() | T4 LYSOZYME | ||||||
![]() | HYDROLASE(O-GLYCOSYL) | ||||||
機能・相同性 | ![]() viral release from host cell by cytolysis / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / host cell cytoplasm / defense response to bacterium 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Wilson, K. / Matthews, B.W. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Conservation of solvent-binding sites in 10 crystal forms of T4 lysozyme. 著者: Zhang, X.J. / Matthews, B.W. #1: ![]() タイトル: Hydrophobic Stabilization in T4 Lysozyme Determined Directly by Multiple Substitutions of Ile 3 著者: Matsumura, M. / Becktel, W.J. / Matthews, B.W. #2: ![]() タイトル: Structural Studies of Mutants of T4 Lysozyme that Alter Hydrophobic Stabilization 著者: Matsumura, M. / Wozniak, J.A. / Sun, D. / Matthews, B.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 43.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 31.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 413.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 422.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 10 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 12.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 18662.467 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() 属: T4-like viruses / 生物種: Enterobacteria phage T4 sensu lato / プラスミド: M13 / 参照: UniProt: P00720, lysozyme |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.56 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.89 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS pH: 6.8 / 手法: unknown | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
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解析
ソフトウェア | 名称: TNT / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.6→10 Å / σ(F): 0 /
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.6→10 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: TNT / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.6 Å / 最低解像度: 10 Å / Num. reflection all: 5904 / σ(F): 0 / Rfactor all: 0.192 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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