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万見
- EMDB-9108: Structural basis of coreceptor recognition by HIV-1 envelope spike -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-9108
タイトルStructural basis of coreceptor recognition by HIV-1 envelope spike
マップデータHIV-1 envelope spike
試料
  • 複合体: C-C chemokine receptor type 5 (CCR5) in complex with T-cell surface glycoprotein CD4 and HIV1 envelope glycoprotein gp120
    • 複合体: Envelope glycoprotein gp160
      • タンパク質・ペプチド: Envelope glycoprotein gp160
    • 複合体: T-cell surface glycoprotein CD4
      • タンパク質・ペプチド: T-cell surface glycoprotein CD4
    • 複合体: C-C chemokine receptor type 5
      • タンパク質・ペプチド: C-C chemokine receptor type 5
  • リガンド: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
  • リガンド: beta-D-mannopyranose
  • リガンド: 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose
キーワードHIV coreceptor / MEMBRANE PROTEIN
機能・相同性
機能・相同性情報


chemokine (C-C motif) ligand 5 binding / negative regulation of macrophage apoptotic process / chemokine receptor activity / helper T cell enhancement of adaptive immune response / interleukin-16 binding / interleukin-16 receptor activity / maintenance of protein location in cell / signaling / T cell selection / MHC class II protein binding ...chemokine (C-C motif) ligand 5 binding / negative regulation of macrophage apoptotic process / chemokine receptor activity / helper T cell enhancement of adaptive immune response / interleukin-16 binding / interleukin-16 receptor activity / maintenance of protein location in cell / signaling / T cell selection / MHC class II protein binding / C-C chemokine receptor activity / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate phospholipase C activity / positive regulation of kinase activity / cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus / C-C chemokine binding / interleukin-15-mediated signaling pathway / positive regulation of monocyte differentiation / response to cholesterol / Nef Mediated CD4 Down-regulation / Alpha-defensins / regulation of T cell activation / Chemokine receptors bind chemokines / release of sequestered calcium ion into cytosol by sarcoplasmic reticulum / Other interleukin signaling / dendritic cell chemotaxis / extracellular matrix structural constituent / T cell receptor complex / enzyme-linked receptor protein signaling pathway / Interleukin-10 signaling / Translocation of ZAP-70 to Immunological synapse / Phosphorylation of CD3 and TCR zeta chains / macrophage differentiation / regulation of calcium ion transport / Generation of second messenger molecules / T cell differentiation / Co-inhibition by PD-1 / positive regulation of protein kinase activity / Binding and entry of HIV virion / cellular defense response / coreceptor activity / positive regulation of interleukin-2 production / positive regulation of calcium-mediated signaling / cell surface receptor protein tyrosine kinase signaling pathway / host cell endosome membrane / protein tyrosine kinase binding / cell chemotaxis / Vpu mediated degradation of CD4 / clathrin-coated endocytic vesicle membrane / calcium-mediated signaling / positive regulation of T cell activation / chemotaxis / calcium ion transport / MHC class II protein complex binding / transmembrane signaling receptor activity / MAPK cascade / Downstream TCR signaling / Cargo recognition for clathrin-mediated endocytosis / cell-cell signaling / signaling receptor activity / Clathrin-mediated endocytosis / positive regulation of protein phosphorylation / actin binding / virus receptor activity / cellular response to lipopolysaccharide / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / G alpha (i) signalling events / defense response to Gram-negative bacterium / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / adaptive immune response / positive regulation of canonical NF-kappaB signal transduction / positive regulation of viral entry into host cell / early endosome / cell surface receptor signaling pathway / positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade / positive regulation of MAPK cascade / endosome / cell adhesion / immune response / G protein-coupled receptor signaling pathway / inflammatory response / membrane raft / endoplasmic reticulum lumen / external side of plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / apoptotic process / lipid binding / viral envelope / endoplasmic reticulum membrane / protein kinase binding / positive regulation of DNA-templated transcription / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / structural molecule activity / enzyme binding / cell surface / signal transduction / protein homodimerization activity / zinc ion binding / identical protein binding
類似検索 - 分子機能
CC chemokine receptor 5 / CD4, extracellular / T cell CD4 receptor C-terminal region / CD4, extracellular / T cell CD4 receptor C terminal region / T-cell surface antigen CD4 / Immunoglobulin C2-set / Immunoglobulin C2-set domain / Chemokine receptor family / : ...CC chemokine receptor 5 / CD4, extracellular / T cell CD4 receptor C-terminal region / CD4, extracellular / T cell CD4 receptor C terminal region / T-cell surface antigen CD4 / Immunoglobulin C2-set / Immunoglobulin C2-set domain / Chemokine receptor family / : / Immunoglobulin / Immunoglobulin domain / Envelope glycoprotein Gp160 / Retroviral envelope protein / Retroviral envelope protein GP41-like / Gp120 core superfamily / Envelope glycoprotein GP120 / Human immunodeficiency virus 1, envelope glycoprotein Gp120 / Immunoglobulin subtype 2 / Immunoglobulin C-2 Type / Immunoglobulin V-Type / Immunoglobulin V-set domain / G-protein coupled receptors family 1 signature. / G protein-coupled receptor, rhodopsin-like / GPCR, rhodopsin-like, 7TM / G-protein coupled receptors family 1 profile. / 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) / Immunoglobulin subtype / Immunoglobulin / Ig-like domain profile. / Immunoglobulin-like domain / Immunoglobulin-like domain superfamily / Immunoglobulin-like fold
類似検索 - ドメイン・相同性
T-cell surface glycoprotein CD4 / C-C chemokine receptor type 5 / Envelope glycoprotein gp160
類似検索 - 構成要素
生物種Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス) / Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.9 Å
データ登録者Shaik MM / Chen B
資金援助 米国, 1件
OrganizationGrant number国
National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI)AI141002 米国
引用ジャーナル: Nature / 年: 2019
タイトル: Structural basis of coreceptor recognition by HIV-1 envelope spike.
著者: Md Munan Shaik / Hanqin Peng / Jianming Lu / Sophia Rits-Volloch / Chen Xu / Maofu Liao / Bing Chen /
要旨: HIV-1 envelope glycoprotein (Env), which consists of trimeric (gp160) cleaved to (gp120 and gp41), interacts with the primary receptor CD4 and a coreceptor (such as chemokine receptor CCR5) to fuse ...HIV-1 envelope glycoprotein (Env), which consists of trimeric (gp160) cleaved to (gp120 and gp41), interacts with the primary receptor CD4 and a coreceptor (such as chemokine receptor CCR5) to fuse viral and target-cell membranes. The gp120-coreceptor interaction has previously been proposed as the most crucial trigger for unleashing the fusogenic potential of gp41. Here we report a cryo-electron microscopy structure of a full-length gp120 in complex with soluble CD4 and unmodified human CCR5, at 3.9 Å resolution. The V3 loop of gp120 inserts into the chemokine-binding pocket formed by seven transmembrane helices of CCR5, and the N terminus of CCR5 contacts the CD4-induced bridging sheet of gp120. CCR5 induces no obvious allosteric changes in gp120 that can propagate to gp41; it does bring the Env trimer close to the target membrane. The N terminus of gp120, which is gripped by gp41 in the pre-fusion or CD4-bound Env, flips back in the CCR5-bound conformation and may irreversibly destabilize gp41 to initiate fusion. The coreceptor probably functions by stabilizing and anchoring the CD4-induced conformation of Env near the cell membrane. These results advance our understanding of HIV-1 entry into host cells and may guide the development of vaccines and therapeutic agents.
履歴
登録2018年9月6日-
ヘッダ(付随情報) 公開2018年10月10日-
マップ公開2018年12月12日-
更新2024年10月23日-
現状2024年10月23日処理サイト: RCSB / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.042
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（半径に従い着色）
  • 表面レベル: 0.042
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6meo
  • 表面レベル: 0.042
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_9108.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_9108.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 103 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈HIV-1 envelope spike
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.06 Å/pix.
x 300 pix.
= 317.7 Å		1.06 Å/pix.
x 300 pix.
= 317.7 Å		1.06 Å/pix.
x 300 pix.
= 317.7 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.059 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.042 / ムービー #1: 0.042
最小 - 最大-0.10970193 - 0.18590759
平均 (標準偏差)0.00033319413 (±0.005944809)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ300300300
Spacing300300300
セルA=B=C: 317.7 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.0591.0591.059
M x/y/z300300300
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z317.700317.700317.700
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ-153-266-98
NX/NY/NZ528514389
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS300300300
D min/max/mean-0.1100.1860.000

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_9108_msk_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
ハーフマップ: HIV-1 envelope spike

ファイルemd_9108_half_map_1.map
注釈HIV-1 envelope spike
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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ハーフマップ: HIV-1 envelope spike

ファイルemd_9108_half_map_2.map
注釈HIV-1 envelope spike
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

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試料の構成要素

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全体 : C-C chemokine receptor type 5 (CCR5) in complex with T-cell surfa...

全体名称: C-C chemokine receptor type 5 (CCR5) in complex with T-cell surface glycoprotein CD4 and HIV1 envelope glycoprotein gp120
要素
  • 複合体: C-C chemokine receptor type 5 (CCR5) in complex with T-cell surface glycoprotein CD4 and HIV1 envelope glycoprotein gp120
    • 複合体: Envelope glycoprotein gp160
      • タンパク質・ペプチド: Envelope glycoprotein gp160
    • 複合体: T-cell surface glycoprotein CD4
      • タンパク質・ペプチド: T-cell surface glycoprotein CD4
    • 複合体: C-C chemokine receptor type 5
      • タンパク質・ペプチド: C-C chemokine receptor type 5
  • リガンド: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
  • リガンド: beta-D-mannopyranose
  • リガンド: 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose

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超分子 #1: C-C chemokine receptor type 5 (CCR5) in complex with T-cell surfa...

超分子名称: C-C chemokine receptor type 5 (CCR5) in complex with T-cell surface glycoprotein CD4 and HIV1 envelope glycoprotein gp120
タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#3
分子量理論値: 200 MDa

+
超分子 #2: Envelope glycoprotein gp160

超分子名称: Envelope glycoprotein gp160 / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1
由来(天然)生物種: Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)

+
超分子 #3: T-cell surface glycoprotein CD4

超分子名称: T-cell surface glycoprotein CD4 / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #2
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
超分子 #4: C-C chemokine receptor type 5

超分子名称: C-C chemokine receptor type 5 / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #3
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: Envelope glycoprotein gp160

分子名称: Envelope glycoprotein gp160 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Human immunodeficiency virus 1 (ヒト免疫不全ウイルス)
分子量理論値: 51.465043 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: DNLWVTVYYG VPVWKEATTT LFCASDAKAY KAEVHNVWAT HACVPTDPNP QEIVLENVTE NFNMWKNNMV EQMHEDIISL WDQSLKPCV KLTPLCVTLN CIDLNNSTNN NNSSGVKTGI DKGEIKNCSF NTTTSVKDKE KKEYALFYNL DVVQIGNDNT S YRLTSCNT ...文字列:
DNLWVTVYYG VPVWKEATTT LFCASDAKAY KAEVHNVWAT HACVPTDPNP QEIVLENVTE NFNMWKNNMV EQMHEDIISL WDQSLKPCV KLTPLCVTLN CIDLNNSTNN NNSSGVKTGI DKGEIKNCSF NTTTSVKDKE KKEYALFYNL DVVQIGNDNT S YRLTSCNT SVITQACPKV TFEPIPIHYC TPAGYAILKC NGKKFNGTGP CTNVSTVQCT HGIKPVVSTQ LLLNGSLAEE DI VIRSENL TNNAKTIIVQ LKDPVDINCT RPNNNTRKSI HIGPGRAFYA TGDIIGDIRQ AHCNLSRAQW NDTLSKIVTK LRE QFENKT IKFQPPSGGD PEIVFHSFNC GGEFFYCNTT QLFNSTWTNN TEGTSNTTGN DTITLPCRIK QIVNMWQEVG KAMY APPIK GKIKCSSNIT GLLLTRDGGN NEMNTTEIFR PGGGDMRDNW RSELYKYKVV RIEPLG

UniProtKB: Envelope glycoprotein gp160

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分子 #2: T-cell surface glycoprotein CD4

分子名称: T-cell surface glycoprotein CD4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 19.541176 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
KKVVLGKKGD TVELTCTASQ KKSIQFHWKN SNQIKILGNQ GSFLTKGPSK LNDRADSRRS LWDQGNFPLI IKNLKIEDSD TYICEVEDQ KEEVQLLVFG LTANSDTHLL QGQSLTLTLE SPPGSSPSVQ CRSPRGKNIQ GGKTLSVSQL ELQDSGTWTC T VLQNQKKV EFKIDIVV

UniProtKB: T-cell surface glycoprotein CD4

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分子 #3: C-C chemokine receptor type 5

分子名称: C-C chemokine receptor type 5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 36.343008 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MDYQVSSPI(TYS) DIN(TYS)YTSEPC QKINVKQIAA RLLPPLYSLV FIFGFVGNML VILILINCKR LKSMTDIYLL NL AISDLFF LLTVPFWAHY AAAQWDFGNT MCQLLTGLYF IGFFSGIFFI ILLTIDRYLA VVHAVFALKA RTVTFGVVTS VIT WVVAVF ...文字列:
MDYQVSSPI(TYS) DIN(TYS)YTSEPC QKINVKQIAA RLLPPLYSLV FIFGFVGNML VILILINCKR LKSMTDIYLL NL AISDLFF LLTVPFWAHY AAAQWDFGNT MCQLLTGLYF IGFFSGIFFI ILLTIDRYLA VVHAVFALKA RTVTFGVVTS VIT WVVAVF ASLPGIIFTR SQKEGLHYTC SSHFPYSQYQ FWKNFQTLKI VILGLVLPLL VMVICYSGIL KTLLRCRNEK KRHR AVRLI FTIMIVYFLF WAPYNIVLLL NTFQEFFGLN NCSSSNRLDQ AMQVTETLGM THCCINPIIY AFVGEKFRNY LLVFF Q

UniProtKB: C-C chemokine receptor type 5

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分子 #7: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

分子名称: 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / タイプ: ligand / ID: 7 / コピー数: 7 / 式: NAG
分子量理論値: 221.208 Da
Chemical component information

ChemComp-NAG:
2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-アセチル-β-D-グルコサミン

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分子 #8: beta-D-mannopyranose

分子名称: beta-D-mannopyranose / タイプ: ligand / ID: 8 / コピー数: 1 / 式: BMA
分子量理論値: 180.156 Da
Chemical component information

ChemComp-BMA:
beta-D-mannopyranose / β-D-マンノピラノ-ス

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分子 #9: 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose

分子名称: 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose / タイプ: ligand / ID: 9 / コピー数: 1 / 式: A2G
分子量理論値: 221.208 Da
Chemical component information

ChemComp-A2G:
2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-galactopyranose / α-GalNAc

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実験情報

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構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

濃度1 mg/mL
緩衝液pH: 8
構成要素:
濃度名称
100.0 mMTris
150.0 mMSodium Chloride
1.0 mMEDTA
0.025 %DDM
0.001 %LMNG
0.04 %Cholesterol Hemisuccinate

詳細: 100 mM Tris-HCl, pH 8.0, 150 mM NaCl, 1 mM EDTA, 0.001% LMNG (w/v), 0.025% DDM (w/v), and 0.04 % CHS (w/v)
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 400 / 前処理 - タイプ: GLOW DISCHARGE / 前処理 - 時間: 90 sec. / 前処理 - 気圧: 0.0004 kPa
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 95 % / チャンバー内温度: 298 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 46.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: OTHER
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: OTHER
最終 再構成使用したクラス数: 1 / 想定した対称性 - 点群: C1 (非対称) / 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.9 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION (ver. 2.1) / 使用した粒子像数: 307346
初期 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 3次元分類クラス数: 16
FSC曲線 (解像度の算出)

-
原子モデル構築 1

初期モデル
PDB IDChain

5uiw

chain_id: A, source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

1wio

chain_id: A, source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

2qad

chain_id: G, source_name: PDB, initial_model_type: experimental model

5vn3

chain_id: G, source_name: PDB, initial_model_type: experimental model
精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT / 温度因子: 200
得られたモデル

PDB-6meo:
Structural basis of coreceptor recognition by HIV-1 envelope spike

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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