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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-10005 | |||||||||
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タイトル | Native bacterioferritin from Mycobacterium smegmatis | |||||||||
![]() | Native bacterioferritin from Mycobacterium smegmatis | |||||||||
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生物種 | ![]() | |||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / ネガティブ染色法 / 解像度: 20.0 Å | |||||||||
![]() | Kirykowicz AM / Woodward JD | |||||||||
資金援助 | ![]()
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![]() | ![]() タイトル: Structural pipeline for the investigation of Mycobacterial protein complexes involved in the stationary phase stress response 著者: Kirykowicz AM / Woodward JD | |||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 215 KB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 9.8 KB 9.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 24.4 KB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 196.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 196.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 5.1 KB | 表示 | |
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-関連構造データ
関連構造データ | C: 同じ文献を引用 ( |
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類似構造データ |
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リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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注釈 | Native bacterioferritin from Mycobacterium smegmatis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 4.22 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
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試料の構成要素
-全体 : Bacterioferritin; ferritin family protein
全体 | 名称: Bacterioferritin; ferritin family protein |
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要素 |
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-超分子 #1: Bacterioferritin; ferritin family protein
超分子 | 名称: Bacterioferritin; ferritin family protein / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1 / 詳細: Octahedral symmetry imposed |
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由来(天然) | 生物種: ![]() 細胞中の位置: Cytoplasm |
分子量 | 実験値: 480 KDa |
-実験情報
-構造解析
手法 | ネガティブ染色法 |
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![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
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試料調製
濃度 | 0.3 mg/mL |
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緩衝液 | pH: 8 / 詳細: 200 mM NaCl, 50 mM Tris-HCl |
染色 | タイプ: NEGATIVE / 材質: Uranyl acetate / 詳細: Sample washed/blotted with 2% UA and air-dried |
詳細 | Negative stain |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TECNAI F20 |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN ULTRASCAN 4000 (4k x 4k) デジタル化 - サイズ - 横: 4000 pixel / デジタル化 - サイズ - 縦: 4000 pixel / 平均露光時間: 0.5 sec. / 平均電子線量: 20.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 200 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: OTHER / 撮影モード: OTHER / Cs: 1.2 mm / 倍率(公称値): 50000 |
実験機器 | ![]() モデル: Tecnai F20 / 画像提供: FEI Company |