登録情報 データベース : PDB / ID : 3h5x 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal Structure of 2'-amino-2'-deoxy-cytidine-5'-triphosphate bound to Norovirus GII RNA polymerase 要素5'-R(*UP*GP*CP*CP*CP*GP*GP*G)-3'5'-R(P*UP*GP*CP*CP*CP*GP*GP*GP*C)-3'RNA dependent RNA polymerase 詳細キーワード Transferase/RNA / POLYMERASE-RNA COMPLEX / NON-NATURAL NUCLEOSIDE TRIPHOSPHATE ANALOG / CALICIVIRUS / Hydrolase / Nucleotide-binding / Nucleotidyltransferase / Protease / RNA replication / RNA-directed RNA polymerase / Thiol protease / Transferase / Transferase-RNA COMPLEX機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
ribonucleoside triphosphate phosphatase activity / viral RNA genome replication / cysteine-type endopeptidase activity / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / proteolysis / RNA binding / ATP binding / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3230 / Norovirus 3C-like protease (NV 3CLpro) domain profile. / Norovirus peptidase C37 / Southampton virus-type processing peptidase / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A - #20 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Helix non-globular / Special ... Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3230 / Norovirus 3C-like protease (NV 3CLpro) domain profile. / Norovirus peptidase C37 / Southampton virus-type processing peptidase / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A - #20 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Helix non-globular / Special / RNA-directed RNA polymerase, C-terminal domain / Viral RNA-dependent RNA polymerase / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Alpha-Beta Plaits / RNA-directed RNA polymerase, catalytic domain / RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile. / Peptidase S1, PA clan, chymotrypsin-like fold / Peptidase S1, PA clan / DNA/RNA polymerase superfamily / Up-down Bundle / 2-Layer Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 Norwalk virus (ノロウイルス)手法 X線回折 / シンクロトロン / フーリエ合成 / 解像度 : 1.77 Å 詳細データ登録者 Zamyatkin, D.F. / Parra, F. / Machin, A. / Grochulski, P. / Ng, K.K.S. 引用ジャーナル : J.Mol.Biol. / 年 : 2009タイトル : Binding of 2'-amino-2'-deoxycytidine-5'-triphosphate to norovirus polymerase induces rearrangement of the active site.著者 : Zamyatkin, D.F. / Parra, F. / Machin, A. / Grochulski, P. / Ng, K.K. 履歴 登録 2009年4月22日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2009年5月19日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年7月13日 Group : Non-polymer description / Version format compliance改定 1.2 2021年10月13日 Group : Database references / Derived calculationsカテゴリ : database_2 / struct_conn ... database_2 / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id 改定 1.3 2023年9月6日 Group : Data collection / Refinement descriptionカテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model
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