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- EMDB-3844: 80S from Trypanosoma cruzi -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-3844
タイトル80S from Trypanosoma cruzi
マップデータ
試料
  • 複合体: 80S ribosome from Trypanosoma cruziEukaryotic ribosome
    • タンパク質・ペプチド: x 34種
    • RNA: x 1種
機能・相同性
機能・相同性情報


translation regulator activity / ribosomal small subunit assembly / ribosome binding / kinase activity / small ribosomal subunit / cytosolic small ribosomal subunit / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex ...translation regulator activity / ribosomal small subunit assembly / ribosome binding / kinase activity / small ribosomal subunit / cytosolic small ribosomal subunit / rRNA binding / リボソーム / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / 翻訳 (生物学) / リン酸化 / RNA binding / zinc ion binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S12e ...Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S26e superfamily / Ribosomal protein S26e / Ribosomal protein S2, eukaryotic / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S21e superfamily / Ribosomal protein S21e / Ribosomal protein S12e signature. / Ribosomal protein S2, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S12e / Ribosomal protein S19e / Ribosomal_S19e / Ribosomal protein S5, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e, conserved site / 40S ribosomal protein S4, C-terminal domain / Small (40S) ribosomal subunit Asc1/RACK1 / Ribosomal protein S19e / 40S ribosomal protein S4 C-terminus / Ribosomal protein S4e, N-terminal / Ribosomal protein S23, eukaryotic/archaeal / 40S Ribosomal protein S10 / S27a-like superfamily / Ribosomal protein S10, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e / Ribosomal protein S4, KOW domain / Ribosomal protein S4e / Ribosomal protein S4e, central region / Ribosomal protein S4e, central domain superfamily / Plectin/S10, N-terminal / Plectin/S10 domain / Ribosomal protein S25 / S25 ribosomal protein / RS4NT (NUC023) domain / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S27a / Ribosomal protein S30 / Ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S29/30S ribosomal protein S14 type Z / Ribosomal family S4e / Ribosomal protein S3, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S19A/S15e / Ribosomal protein S8e signature. / Ribosomal protein S17e / Ribosomal protein S17e-like superfamily / Ribosomal S17 / Ribosomal protein S6, eukaryotic / 40S ribosomal protein S1/3, eukaryotes / Ribosomal S24e conserved site / Ribosomal protein S24e signature. / 40S ribosomal protein S11, N-terminal / Ribosomal_S17 N-terminal / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein S7e / Ribosomal protein S27, zinc-binding domain superfamily / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S24e / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S27 / Ribosomal protein S3Ae / Ribosomal protein S28e conserved site / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein S28e signature. / Ribosomal S3Ae family / Ribosomal protein S28e / Ribosomal protein S28e / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein S5/S7, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein S6e / Ribosomal protein S13/S15, N-terminal / Ribosomal protein S15P / Ribosomal S13/S15 N-terminal domain / Ribosomal S13/S15 N-terminal domain / Ribosomal protein S4/S9, eukaryotic/archaeal / Ribosomal protein S8e/ribosomal biogenesis NSA2 / Ribosomal protein S8e / Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 / Ribosomal protein L7Ae/L30e/S12e/Gadd45 family / Ribosomal protein S14/S29 / RNA認識モチーフ / 50S ribosomal protein L30e-like / RNA認識モチーフ / Eukaryotic RNA Recognition Motif (RRM) profile. / RNA recognition motif domain / RNA-binding domain superfamily / Ribosomal protein S2 signature 2. / Ribosomal protein S2, conserved site / Ribosomal protein S2 / Ribosomal protein S2, flavodoxin-like domain superfamily / KHドメイン / Ribosomal protein S2 / Type-2 KH domain profile. / K Homology domain, type 2 / Ribosomal protein S3, C-terminal / Ribosomal protein S3, C-terminal domain / Ribosomal protein S3, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein S15/S19, conserved site / Ribosomal protein S19 signature. / Ribosomal protein S10
類似検索 - ドメイン・相同性
40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein S12 / 40S ribosomal protein S7 / Ribosomal protein S29, putative / 40S ribosomal protein S26 / 40S ribosomal protein S11, putative / Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 / 40S ribosomal protein S9, putative / 40S ribosomal protein S4 / Ribosomal protein S20, putative ...40S ribosomal protein SA / 40S ribosomal protein S12 / 40S ribosomal protein S7 / Ribosomal protein S29, putative / 40S ribosomal protein S26 / 40S ribosomal protein S11, putative / Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 / 40S ribosomal protein S9, putative / 40S ribosomal protein S4 / Ribosomal protein S20, putative / 40S ribosomal protein S14, putative / 40S ribosomal protein S33, putative / 40S ribosomal protein S30 / 40S ribosomal protein S13, putative / 40S ribosomal protein S16, putative / 40S ribosomal protein S15, putative / 40S ribosomal protein S2, putative / Ribosomal protein S19, putative / 40S ribosomal protein S17, putative / 40S ribosomal protein S3, putative / 40S ribosomal protein S27, putative / 40S ribosomal protein S6 / Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-like protein / 40S ribosomal protein S23, putative / 40S ribosomal protein S25 / 40S ribosomal protein S8 / 40S ribosomal protein S24 / RNA-binding protein, putative / 40S ribosomal protein S3a-2 / 40S ribosomal protein S10, putative / 40S ribosomal protein S18, putative / 40S ribosomal protein S15a, putative / 40S ribosomal protein S5, putative / 40S ribosomal protein S21, putative
類似検索 - 構成要素
生物種Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ) / Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.0 Å
データ登録者Brito Querido J / Mancera-Martinez E / Vicens Q / Bochler A / Chicher J / Simonetti A / Hashem Y
引用ジャーナル: Structure / 年: 2017
タイトル: The cryo-EM Structure of a Novel 40S Kinetoplastid-Specific Ribosomal Protein.
著者: Jailson Brito Querido / Eder Mancera-Martínez / Quentin Vicens / Anthony Bochler / Johana Chicher / Angelita Simonetti / Yaser Hashem /
要旨: Kinetoplastids are potentially lethal protozoan pathogens affecting more than 20 million people worldwide. There is a critical need for more specific targets for the development of safer anti- ...Kinetoplastids are potentially lethal protozoan pathogens affecting more than 20 million people worldwide. There is a critical need for more specific targets for the development of safer anti-kinetoplastid therapeutic molecules that can replace the scarce and highly cytotoxic current drugs. The kinetoplastid ribosome represents a potential therapeutic target due to its relative structural divergence when compared with its human counterpart. However, several kinetoplastid-specific ribosomal features remain uncharacterized. Here, we present the near-atomic cryoelectron microscopy structure of a novel bona fide kinetoplastid-specific ribosomal (r-) protein (KSRP) bound to the ribosome. KSRP is an essential protein located at the solvent face of the 40S subunit, where it binds and stabilizes kinetoplastid-specific domains of rRNA, suggesting its role in ribosome integrity. KSRP also interacts with the r-protein eS6 at a region that is only conserved in kinetoplastids. The kinetoplastid-specific ribosomal environment of KSRP provides a promising target for the design of safer anti-kinetoplastidian drugs.
履歴
登録2017年8月10日-
ヘッダ(付随情報) 公開2017年11月15日-
マップ公開2017年11月15日-
更新2017年12月13日-
現状2017年12月13日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
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  • 原子モデル: PDB-5opt
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_3844.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_3844.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 125 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.56 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.0549 / ムービー #1: 0.0549
最小 - 最大-0.13201863 - 0.25684065
平均 (標準偏差)-0.00023250228 (±0.016643882)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ320320320
Spacing320320320
セルA=B=C: 499.19998 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.561.561.56
M x/y/z320320320
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z499.200499.200499.200
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS320320320
D min/max/mean-0.1320.257-0.000

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : 80S ribosome from Trypanosoma cruzi

全体名称: 80S ribosome from Trypanosoma cruziEukaryotic ribosome
要素
  • 複合体: 80S ribosome from Trypanosoma cruziEukaryotic ribosome
    • タンパク質・ペプチド: Activated protein kinase C receptor, putative
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S29, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S16, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S18, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S23, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S5, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S7, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S13, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S27, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S26
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S33, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S14, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3a-2リボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S11, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S24
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S9, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein SAリボソームタンパク質SA
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S2, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S15a, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S21, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S25, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: Ubiquitin/ribosomal protein S27a, putative
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S17, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S20, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S3, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S10, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein S19, putativeリボソーム
    • タンパク質・ペプチド: 40S ribosomal protein S30
    • タンパク質・ペプチド: RNA-binding protein, putative
    • RNA: 18S rRNA18S ribosomal RNA

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超分子 #1: 80S ribosome from Trypanosoma cruzi

超分子名称: 80S ribosome from Trypanosoma cruzi / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)

+
分子 #1: Activated protein kinase C receptor, putative

分子名称: Activated protein kinase C receptor, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 35.070312 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MAVVYEGQLK GHRGWVTALA CPQITETYIK AVSTSRDNTL IAWGSNMDRN SEECEYGFPE RRLEGHSAFV SDVALSNNGD FAVSASWDH SLRLWNLQTG VCQHKFLGHT KDVLSVTFSP DNRQIVSGGR DNALRVWNVK GECLHTLGRG AHTDWVSCVR F SPSLETPL ...文字列:
MAVVYEGQLK GHRGWVTALA CPQITETYIK AVSTSRDNTL IAWGSNMDRN SEECEYGFPE RRLEGHSAFV SDVALSNNGD FAVSASWDH SLRLWNLQTG VCQHKFLGHT KDVLSVTFSP DNRQIVSGGR DNALRVWNVK GECLHTLGRG AHTDWVSCVR F SPSLETPL IVSGGWDNLV KVWDIASGRL LTDLKGHTNY ITSVTVSPDG SLCASSDKDG VARLWDLTKG EALSEMAAGA PI NQICFSP NRYWMCAATE KGIRIFDLEN KDVIVELAPE AQQKSKKTPE CMSIAWSADG NTLYSGYTDN VIRVWSVSEH A

+
分子 #2: Ribosomal protein S29, putative

分子名称: Ribosomal protein S29, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 6.651826 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MGHLEQWRSR QKIGMGKGSR HCVICSNQKA VIRKYELNVC RQCFRENAAN IGFSKLR

+
分子 #3: 40S ribosomal protein S16, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S16, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 16.841643 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MTAEKSHTHK QVQTFGKKKT AIAVATVTKA AQCNIRVNGV PVSQILPETL RAKIMEAVNV VGSRHFARLR IDVTVRGAGQ VAQAYATRQ AIAKGLVAYY QKYKNEVEKA ALKDKYLAYD KYLLIADPRR CEPKKWGRHS ARTRFTKSYR

+
分子 #4: 40S ribosomal protein S15, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S15, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 17.554453 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MTSNITQERY EQLKKERTFH KFTYRGLEID PLLALSEEEF KTLVHARARR HMNRHANRRA PVLLKRLREA KKDVKAGEKP RAVKTHLRD VVITPEMVGS VVGIYNGRQF NAVEIKGEMI GHYLGEFSMT YKPVIHGRPG VGATHSSRFI PLK

+
分子 #5: 40S ribosomal protein S18, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S18, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 17.585469 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MSLTLQSEQF QHIVRLLNTN VEGKRKVPFA LRMVKGVGIR FAYMVCKKAG IDVERRAGTL TAEELERISE VIADPAKFKI PDWFLNRQR DPKTGKTEHL TSAMVDTRLR EDLERLRKNR VHRGVRHAYG LRVRGQHTCT SGRHGKTVGV SRTK

+
分子 #6: 40S ribosomal protein S4

分子名称: 40S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 30.936521 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MTKKHLKRLY APKDWMLSKL TGVFAPRPRA GPHKLRECMT LMIIIRNRLK YALNAAEAQM ILRQGLVCVD GKPRKDTKYP VGFMDVVEI PRTGDRFRIL YDVKGRFALV KVGEAEGNIK LLKVENVYTS TGRIPVAMTH DGHRIRYPDP RTHRGDTLVY N LKEKKVVD ...文字列:
MTKKHLKRLY APKDWMLSKL TGVFAPRPRA GPHKLRECMT LMIIIRNRLK YALNAAEAQM ILRQGLVCVD GKPRKDTKYP VGFMDVVEI PRTGDRFRIL YDVKGRFALV KVGEAEGNIK LLKVENVYTS TGRIPVAMTH DGHRIRYPDP RTHRGDTLVY N LKEKKVVD LIKSSNGKVV MVTGGANRGR IGEIMSIERH PGAFDIARLK DAAGHEFATR ASNIFVIGKD MQSVPVTLPK QQ GLRINVI QEREEKLIAA EARKNMQTRG VRKARK

+
分子 #7: 40S ribosomal protein S23, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S23, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 15.960672 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MTKANGQHAA RKLVRLRRKN RWADKGWKKS HTFVAQKANP FGGSSHAKGI VLEKIGVGAK QPNSAIRKCV RVQLIKNDKK IIAFVPNDG CLHFIEENDE VLVSGFGRSG HAVGDIPGVR FKIVKVSNVG LYALYRQKKE KPRN

+
分子 #8: 40S ribosomal protein S5, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S5, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 21.292715 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MSAKAPKLFN KWSYENLQTT EIALSDHISK TATYVPHSAG RWQKKRFRKA RIPIVERLTN GLMFKGRGNG KKLQAVRLVK HTLEIIHLL TDQNPLQVVI DAVSKGAPRE DSTRVGSGGV VRRQAVDVSP MRRVNEAIYL MCKGAREAAF RNLKTLPECL A DEIVNASK ...文字列:
MSAKAPKLFN KWSYENLQTT EIALSDHISK TATYVPHSAG RWQKKRFRKA RIPIVERLTN GLMFKGRGNG KKLQAVRLVK HTLEIIHLL TDQNPLQVVI DAVSKGAPRE DSTRVGSGGV VRRQAVDVSP MRRVNEAIYL MCKGAREAAF RNLKTLPECL A DEIVNASK GSSNSYAIKK KDEVERVAKA NR

+
分子 #9: Ribosomal protein S7, putative

分子名称: Ribosomal protein S7, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 24.896504 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MAATRKGGRM SVKPHLRKLR KLKRPNPSED EDSVAKALFE LEATHKTLRT QLPRFHINTV RTLSSPRFRR TATVVFYPLR FLMLVRKIQ RTLTAELEKR FPGSIVVLVA QRKITKRPKD VYKLQKVQRS RTSVAVFENI LNDLIYPCDV MGRRWRCRTD G TKVMKVFL ...文字列:
MAATRKGGRM SVKPHLRKLR KLKRPNPSED EDSVAKALFE LEATHKTLRT QLPRFHINTV RTLSSPRFRR TATVVFYPLR FLMLVRKIQ RTLTAELEKR FPGSIVVLVA QRKITKRPKD VYKLQKVQRS RTSVAVFENI LNDLIYPCDV MGRRWRCRTD G TKVMKVFL DSRDRKRVES RLPIIAHVYK QLTHRTVSFG FMWNPKLQQV SSR

+
分子 #10: 40S ribosomal protein S13, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S13, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 17.295621 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MVRMQGVGHG KSASSLPFCR TPPSWLKIAS RDVIDAVCKL AKKGLTPSRI GMQLRDSMGI AQVKNVTGRK ILRILKHKGM APEIPEDLY CLIKRATEMR KHLERNTKDR DTKFRLILVE SRIHRLARYY KRVKQLPPTW KYESSTASAM VA

+
分子 #11: 40S ribosomal protein S27, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S27, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 9.581131 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MGFFDSDLSY PTVRSERMKH KRRRLVQGPN SYFMDVKCPG CNAITIVYSH ATSEVQCNGC ATKLCRPTGG KAMLTTGCGF RKKADH

+
分子 #12: 40S ribosomal protein S26

分子名称: 40S ribosomal protein S26 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 12.793177 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MTTKRRNHGR AKPPCSRGRT RPVHCFNCGR LAPKDKAVGR FVVRRMLDQA SARDVAEASN VYGAGFPMPK LYMKQRFCIA CAIHSRTVR ARPTDMRKRR FTTKVPFRPT GAK

+
分子 #13: 40S ribosomal protein S33, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S33, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 12.427547 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MLASFSPLLF LCYCCVISSL VMTEVAATKK EKKAPQEEVV VQQTDQAQVG LIIKVLGRTG SRGNVTQVRV RLMAEEGSPD ANRTIVRNV KGPCKEGDML SLMETEREAR RLR

+
分子 #14: 40S ribosomal protein S14, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S14, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 15.596004 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MSKKQEVKFY GSSAAKDELV YGVVHIYASF NDTFVHVTDM SGRETFCKIT GGMKVKADRD ESSPYAAMMA AQDVVARCKE CGINALHVK MRATGGVGTR SPGPGAQAAL RALARAGMKI GRIEDVTPIP TDSTRRKGSR RGRRL

+
分子 #15: 40S ribosomal protein S3a-2

分子名称: 40S ribosomal protein S3a-2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 29.909693 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MTLGKNKRIS KGGKRGKKKA QETMSRKEWY DVVAPKNFEV RQFGKTICNK TQGTKIAADY LRGRVYESNL ADLNKTQGDD DAYRKVKFV VQEVQGRNLL TQFHSMEMTS DRVYFLLRKW CTTIEAAVEA KTADGYTLRL FVIAFTKKQS NQLSKNCYAK T RLVKWVRH ...文字列:
MTLGKNKRIS KGGKRGKKKA QETMSRKEWY DVVAPKNFEV RQFGKTICNK TQGTKIAADY LRGRVYESNL ADLNKTQGDD DAYRKVKFV VQEVQGRNLL TQFHSMEMTS DRVYFLLRKW CTTIEAAVEA KTADGYTLRL FVIAFTKKQS NQLSKNCYAK T RLVKWVRH RITNLIRQRL SKVNINEAVT LLTRNILRDR LAKRCNPIVP LRDLRIRKVK VVRTPRFDAQ ALLNAHGEIP AS AEGEARV VEEAQEAPAA EATA

+
分子 #16: 40S ribosomal protein S11, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S11, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 20.018307 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MTAPEQYARV HSVDLTLQHE KAYQRQTAVN ENSHNPNKKH VNMSGHIRYS KKIGLGFKTP KSAINGKYID RKCPFTSDVS IRGRILRGV VHSTKMKRSI VIRRDYLHFI RKYQRYQKRH RSLTVHCSPC FDPKPGDEVI VGQCRPLSKT IRYNVLEVVS K SAPGKLGR KFSKN

+
分子 #17: 40S ribosomal protein S24

分子名称: 40S ribosomal protein S24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 15.706745 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MVFQKKKAEV TVRTSQFKVN KLLNRKQFIV EVNHPGWCGT VPAKLIRSRL ASLYKVADEN QISVFGFKTK FGGGKTTGFG LIYDDLAAL KRIEPNYRKA RLGMGKKKQP ARKSVKERRN RNKKIRGKAK GKMQTKKK

+
分子 #18: 40S ribosomal protein S8

分子名称: 40S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 25.246783 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MGIVRSRLHK RKITGGKTKI HRKRMKAELG RLPAHTKLGA RRVSPVRARG GNFKLRGLRL DTGNFAWSTE AIAQRARILD VVYNATSNE LVRTKTLVKN CIVVVDAAPF KLWYAKHYGI DLDAAKSKKT LQSTTEKKKS KKTSHAMTEK YDVKKASDEL K RKWMLRRE ...文字列:
MGIVRSRLHK RKITGGKTKI HRKRMKAELG RLPAHTKLGA RRVSPVRARG GNFKLRGLRL DTGNFAWSTE AIAQRARILD VVYNATSNE LVRTKTLVKN CIVVVDAAPF KLWYAKHYGI DLDAAKSKKT LQSTTEKKKS KKTSHAMTEK YDVKKASDEL K RKWMLRRE NHKIEKAVAD QLKEGRLLAR ITSRPGQTAR ADGALLEGAE LQFYLKKLEK KKR

+
分子 #19: 40S ribosomal protein S9, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S9, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 22.181932 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MRNYNNFNRV WKAPRRPFEK ERLDREMKLC GQYGLRCKRE IWRVNMTLSK MRRTARLLLT LPENHPRRQL EGSAIMRRCH DYGFLEEEK DKLDYVLSLT VPDILERRLQ TVVFKHGLAK SVHHARVLIL QRHIAVAKQI VTIPSFIVRV SSEHHIAFAD A SPFGNGRP ...文字列:
MRNYNNFNRV WKAPRRPFEK ERLDREMKLC GQYGLRCKRE IWRVNMTLSK MRRTARLLLT LPENHPRRQL EGSAIMRRCH DYGFLEEEK DKLDYVLSLT VPDILERRLQ TVVFKHGLAK SVHHARVLIL QRHIAVAKQI VTIPSFIVRV SSEHHIAFAD A SPFGNGRP GRVKRVKRKA AKKGAAGGDD DE

+
分子 #20: 40S ribosomal protein SA

分子名称: 40S ribosomal protein SA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 27.885129 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MTSVESGAKV LRMKEGDVQK LVAMHCHLGT KNRSNAMKKY IHSRTKEGTN IIDLHMTWEK LILAARVIAA VENPQDVTVC STRLFGQRA IFKFSQLVGT SFLAGRFIPG TFTNQIQKKF MQPRVLLVTD PRTDHQALRE ASLVNIPVIA FCDTDAPLEF V DIAIPCNN ...文字列:
MTSVESGAKV LRMKEGDVQK LVAMHCHLGT KNRSNAMKKY IHSRTKEGTN IIDLHMTWEK LILAARVIAA VENPQDVTVC STRLFGQRA IFKFSQLVGT SFLAGRFIPG TFTNQIQKKF MQPRVLLVTD PRTDHQALRE ASLVNIPVIA FCDTDAPLEF V DIAIPCNN RGRYSISMMY WLLAREVLRL RGTIPRSVPW DVKVDLFFYR DPEEALKHEE VNQAAAPVAE ADEGFGWVER DN NAWEQ

+
分子 #21: 40S ribosomal protein S2, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S2, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 28.574951 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MADAQRAPSG EQRGFGRGRG GRGGRGGRGG RGGSNEKEEW VPCTKLGRLV KEQKITSLEE IFLFSMPIKE HQIVDQLIKE SDMRDELML IVPVQKATSA GQRTRFKAFN IVGDGNGHIG VGARVGKEVS LAIRASMIAA KLNVVPIRRG YWGNKIGEPH T IPMKVTGK ...文字列:
MADAQRAPSG EQRGFGRGRG GRGGRGGRGG RGGSNEKEEW VPCTKLGRLV KEQKITSLEE IFLFSMPIKE HQIVDQLIKE SDMRDELML IVPVQKATSA GQRTRFKAFN IVGDGNGHIG VGARVGKEVS LAIRASMIAA KLNVVPIRRG YWGNKIGEPH T IPMKVTGK CGSVSVRLIP APRGAGIVAA PVPKKILEFA GVEDVYTSSC GNTRTRGNFI MATFYALRKT YGFLTPDLWA ET EVSRDPT DEHSDFLTMG SKMIAA

+
分子 #22: 40S ribosomal protein S15a, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S15a, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 14.68327 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MTMMSVLANA LRCIASAERR GKRQVLIRPS SKVVVKFLQV MQKHGYIGEF EIIDDHRAGK IVVNLNGRLN KCGAICPRFD CTTPDFEKW VKNILPSRQF GFVVLTTSLG IMDHEEARAR NTGGKVLGFF Y

+
分子 #23: 40S ribosomal protein S21, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S21, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 26.09457 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MTTIGTYNEE GVNVDLYIPR KCHATNNLIT SYDHSAVQIA IANVDANGVL NGTTTTFCIA GYLRRQAESD HAINHLAISK GIIRIKTGK KPRAKKLKNV KGLGVRGLPR GALQQRGARV LPTQRGVAQR GGAQKGNVRK LQPQPQKQRS QLNQRSQQQH G ARPTRKEE ...文字列:
MTTIGTYNEE GVNVDLYIPR KCHATNNLIT SYDHSAVQIA IANVDANGVL NGTTTTFCIA GYLRRQAESD HAINHLAISK GIIRIKTGK KPRAKKLKNV KGLGVRGLPR GALQQRGARV LPTQRGVAQR GGAQKGNVRK LQPQPQKQRS QLNQRSQQQH G ARPTRKEE GGRTQRGGRD APQARKQQGR NEPQARKQQG RDAPQARKQQ GRDAPQARKQ QGRDAPQARN KKSGPNRK

+
分子 #24: Ribosomal protein S25, putative

分子名称: Ribosomal protein S25, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 12.379955 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MPPKKNAKPT KPAPKKGKME NMNKGAKKAA KKWSKGRTRE ALQNAVVFDK ETMDKLLSEV PKYKVITPSI ISDRLKISVA LAAKGLQHL CRQKLIKLVS CSSKFRLYSR V

+
分子 #25: 40S ribosomal protein S12

分子名称: 40S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 15.79211 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MAEETPVLEV SPAVVDAVMD ATPENLEDAL RIVLQKSREV NGLIRGLSEV ARALDRRTAH LCVLAEDCED EEYKKLITAL AKQGEVDLI NVEEREKLAQ WAGLTKMDST GELKKTFKCS CVAVRDFGER TRALEFLLSH LR

+
分子 #26: Ubiquitin/ribosomal protein S27a, putative

分子名称: Ubiquitin/ribosomal protein S27a, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 16.608434 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MQIFVKSAAG KTSAIQASAQ ETVASLKSKA GVCDGTLFYG GHCLCDEATL ADYGLQREST IQVMLPVEGG KGKKKKKKVF TKPKKPIHR HKLEKMRALK YFKVTENDDG SFKVERTRDE CPNPVCGAGV FMAQHKDRKY CGKCHLTYAA K

+
分子 #27: 40S ribosomal protein S6

分子名称: 40S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 28.344391 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MKLNIAYPRN GTVKQFEITE EVLRRVSLTD YRLGNEVDGA IFGDAFRGYT FKLQGGSDKQ GFPMVQGVMA PSRVSLLVKR GAVGFNTFR GYQGERRRKS LRGCILASDI AVLNVVIVKT GEQPIEGVTD VSVPRRLGPK RANKIRKLFN LSRGDDVRKY V IRRKVVKE ...文字列:
MKLNIAYPRN GTVKQFEITE EVLRRVSLTD YRLGNEVDGA IFGDAFRGYT FKLQGGSDKQ GFPMVQGVMA PSRVSLLVKR GAVGFNTFR GYQGERRRKS LRGCILASDI AVLNVVIVKT GEQPIEGVTD VSVPRRLGPK RANKIRKLFN LSRGDDVRKY V IRRKVVKE GKKDRFKAPK IQRLITTAVK ARRAKKAKVA IEKVRKSAEE RRAYLHLIGT RRRAARQRNS ARRHAHKVAA QK QALALFK GKK

+
分子 #28: 40S ribosomal protein S17, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S17, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 22.680713 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MCMQHHTCAL FFASCTAFIC FHWLGCTFGC RSFLFFFTFG FFSKREERVQ SNTASMGKIR TKTVKRASKQ LVEKYFSKLN KDFYQNKRV VMDVTIARSK KLKNKIAGYT THIMKRLARG PVRGISLKLQ EEERERRMDY VPEVSHVDQA IQDGVHVDKQ T FSMLKRME ...文字列:
MCMQHHTCAL FFASCTAFIC FHWLGCTFGC RSFLFFFTFG FFSKREERVQ SNTASMGKIR TKTVKRASKQ LVEKYFSKLN KDFYQNKRV VMDVTIARSK KLKNKIAGYT THIMKRLARG PVRGISLKLQ EEERERRMDY VPEVSHVDQA IQDGVHVDKQ T FSMLKRME TGVPRHVALT TVVAPVTKKG GRRAPARK

+
分子 #29: Ribosomal protein S20, putative

分子名称: Ribosomal protein S20, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 13.248478 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MAYVKKDQAP AQETQRVLVK MTSRNAKAVE NVMTELLLHA RNEKVVLRGP VRLPTRTLKV TTRKTPCGNG TNTWDTYELK IYKRLVELR APTELVKKIT SFPIDAGVDV AITIPHDQ

+
分子 #30: 40S ribosomal protein S3, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S3, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 24.188436 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MGPLSKKRMI IRDGVFYAEL FEFLKRELAD DGFAGVEHRV TSTRTEIVIR ATKTREVLGE KGRRIRELTA CLQQRFHYKE GKLQLFAER VEVRGLSAMA QAESLRFKLL SNLQVRRAAM GIIRHVMESG AKGCEVTVGG KIKGQRAKSM TFRDGYMIKS G TAHKNFVD ...文字列:
MGPLSKKRMI IRDGVFYAEL FEFLKRELAD DGFAGVEHRV TSTRTEIVIR ATKTREVLGE KGRRIRELTA CLQQRFHYKE GKLQLFAER VEVRGLSAMA QAESLRFKLL SNLQVRRAAM GIIRHVMESG AKGCEVTVGG KIKGQRAKSM TFRDGYMIKS G TAHKNFVD VATRHCHLRA GTLGVKVKIM LPKSMQNEEE ILPDVITVLE PKEITA

+
分子 #31: 40S ribosomal protein S10, putative

分子名称: 40S ribosomal protein S10, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 18.284725 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MATYVPKRSR DDVYRFFFTE GVISCKKDPL GTWTGSLGGK TFTVPSIQVM QLMRSMKSRG LIKEQFAWRH FYWFLNDEGV EYLRKYLFL PHDAVPNTHK AEYKVLEREG GRGRGRGEGR GRGRGEGRGR GRGEGRGRGR GFHSERDAYR TGAAAAPAVE A Q

+
分子 #32: Ribosomal protein S19, putative

分子名称: Ribosomal protein S19, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 18.861287 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MVAARTKANS KIRRIGKKKG ATMKDVHPWR WVKLCSQHFK QEGKLMVPNC TEIVKSSHGR ERAPQNPDWY YIRCAAILRA VYMRPGVGY GGLSKRFSNK KNRGSRPEIT VRASKGLLHW GCKSLTKLGL IEKCESSGHR ITKNGRKLAD AIAFKVAIRK L NTATSKN

+
分子 #33: 40S ribosomal protein S30

分子名称: 40S ribosomal protein S30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 7.445938 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列:
MGKVHGSLAR AGKVKNQTPK VAKQEKKKQP RGRAFKRLKY TQRYLAKTLK PGEKLHMNKQ PPGKAG

+
分子 #34: RNA-binding protein, putative

分子名称: RNA-binding protein, putative / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (strain CL Brener) (クルーズトリパノソーマ)
株: CL Brener
分子量理論値: 27.676303 KDa
組換発現生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
配列文字列: MPAKSANKPA SKPASKPAAK PAAKPAAKAP APKAEKKGAA KAPAPKAAAP APKAAAAAPK PAVRDAKQRS DAANHNGLYV KNWGQGSVD DARALFGTAG KVVGVRVRRR RYAIIFFENA AAVKKAIDLF NGKEFMGNVL SVVPAKTTPK PDPHANSSVV F VSPIFRAS ...文字列:
MPAKSANKPA SKPASKPAAK PAAKPAAKAP APKAEKKGAA KAPAPKAAAP APKAAAAAPK PAVRDAKQRS DAANHNGLYV KNWGQGSVD DARALFGTAG KVVGVRVRRR RYAIIFFENA AAVKKAIDLF NGKEFMGNVL SVVPAKTTPK PDPHANSSVV F VSPIFRAS TTKKQILELF SGMKVLRLRT YRNNYAYVYL DTPAAAQRAV KEKNGAEFRG KQLRVALSTR SLAKDRARAE RA RLLMAAQ KFNKRKNHTK

+
分子 #35: 18S rRNA

分子名称: 18S rRNA / タイプ: rna / ID: 35 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Trypanosoma cruzi (クルーズトリパノソーマ)
分子量理論値: 746.696125 KDa
配列文字列: UGAUCUGGUU GAUUCUGCCA GUAGUCAUAU GCUUGUUUCA AGGACUUAGC CAUGCAUGCC UCAGAAUCAC UGCAUUGCAG GAAUCUGCG CAUGGCUCAU UACAUCAGAC GUAAUCUGCC GCAAAAAUCU UGCGGUCUCC GCAACAUUGG AUAACUUGGC G AAACGCCA ...文字列:
UGAUCUGGUU GAUUCUGCCA GUAGUCAUAU GCUUGUUUCA AGGACUUAGC CAUGCAUGCC UCAGAAUCAC UGCAUUGCAG GAAUCUGCG CAUGGCUCAU UACAUCAGAC GUAAUCUGCC GCAAAAAUCU UGCGGUCUCC GCAACAUUGG AUAACUUGGC G AAACGCCA AGCUAAUACA UGAACCAACC GGAUGUUCUC UGUUCCGGCG GCAGGGCAAC CUGCUGCCAU GGGACGUCCA GC GAAUGAA UGAAAGUAAA ACCAAUGCCU UCACCGGCAG UAACACUCAG AAGUGUUGAU UCAAUUCAUU CCGUGCGAAA GCC GGGUUU UUUUAUCCGG CGUCUUUUGA CGAACAACUG CCCUAUCAGC CAGCGAUGGC CGUGUAGUGG ACUGCCAUGG CGUU GACGG GAGCGGGGGA UUAGGGUUCG AUUCCGGAGA GGGAGCCUGA GAAAUAGCUA CCACUUCUAC GGAGGGCAGC AGGCG CGCA AAUUGCCCAA UGUCAAAAAA AAAAGAUGAG GCAGCGAAAA GAAAUAGAGC CGACAGUGCU UUUGCAUUGU CGUUUU CAA UGGGGGAUAU UUAAACCCAU CCAAAAUCGA GUAACAAUUG GAGGACAAGU CUGGUGCCAG CACCCGCGGU AAUUCCA GC UCCAAAAGCG UAUAUUAAUG CUGUUGCUGU UAAAGGGUUC GUAGUUGAAU UGAGGGCCUC UAAGGCGCAA UGGUUUAG U CCCAUCCACU UCGGAUUGGU GACCCAUGCC CUUGUGGUCC GUGAACAGAC AUUCAGAAAC AAAAAACACG GGAGUGGUA CCUUUCCUGA UUAUCGCAUG UCAUGCAUGC CAGAGGGCGC CCGUGAUUUU UUACUGUGAC UAAAAAAGUG UGACCAAAGC AGUCAUUCG ACUUGAAUUA GAAAGCAUGG GAUAACAAAG GAGCAGCCUC UGGGCCACCG UUUCGGCUUU UGUUGGUUUU A AAAGUCCA UUGGAGAUUA UGGGGCAGUG UGACAAGCGG CUGGGUGGUU AUUCCACACA CACACACACA CGCUCCUUUU UU UUGGACG UGUUUUGUGU GUGUAUGUGG CACUCGUCGC CUUUGUGGGA AAUCCGUGUG GCACUGUGUU UGAUGUUGUU GGC AGAGAC UUCGGUCUUU UGCCUUCGCA UAUUUCACAC AUGUGUCAUG CCUUCCCUCA ACUCACGGCA UCCAGGAAUG AAGG AGGGU AGUUCGGGGG AGAACGUACU GGUGCGUCAG AGGUGAAAUU CUUAGACCGC ACCAAGACGA ACUACAGCGA AGGCA UUCU UCAAGGAUAC CUUCCUCAAU CAAGAACCAA AGUGUGGGGA UCGAAGAUGA UUAGAGACCA UUGUAGUCCA CACUGC AAA CGAUGACACC CAUGAAUUGG GGAGUUUUUG GUCGUAGGCG UGGUCGGGCU UGAUUAUUAU UUUUCAUCCC GUUCCUC GU CUCGCCAAUG AAUAUUAAAU UUACGUGCAU AUUCUUUUUG GUCUUCGUUU UUUUACGGCG AGGGCCUUUA ACGGGAAU A UCCUCAGCAC GUUAUCUGAC UUCUUCACGC GAAAGCUUUG AGGUUACAGU CUCAGGGGGG AGUACGUUCG CAAGAGUGA AACUUAAAGA AAUUGACGGA AUGGCACCAC AAGACGUGGA GCGUGCGGUU UAAUUUGACU CAACACGGGG AACUUUACCA GAUCCGGAC AGGGUGAGGA UUGACAGAUU GAGUGUUCUU UCUCGAUCCC CUGAAUGGUG GUGCAUGGCC GCUUUUGGUC G GUGGAGUG AUUUGUUUGG UUGAUUCCGU CAACGGACGA GAUCCAAGCU GCCCAGUAGG AUUCAGAAUU GCCCAUAGGA UA GCAAUCC CUUCCGCGGG UUUUACCCAA GGGGGGGCGG UAUUCGCUUG UAUCCUUCUC UGCGGGAUUC CUUGUUUUGC GCA AGGUGA GAUUUUGGGC AACAGCAGGU CUGUGAUGCU CCUCAAUGUU CUGGGCGACA CGCGCACUAC AAUGUCAGUG AGAA CAAGA AAAACGACUC UUGUCGGACC UACUUGAUCA AAAGAGUGGG AAAACCCCGG AAUCACGUAG ACCCACUUGG GACCG AGUA UUGCAAUUAU UGGUCGCGCA ACGAGGAAUG UCUCGUAGGC GCAGCUCAUC AAACUGUGCC GAUUACGUCC CUGCCA UUU GUACACACCG CCCGUCGUUG UUUCCGAUGA UGGUGCAAUA CAGGUGAUCG GACAGUCGAG UGCUUCACUU GACCGAA AG UUCACCGAUA UUUCUUCAAU AGAGGAAGCA AAAGUCGUAA CAAGGUAGCU GUAGGUGAAC CUGCAGCUGG AUCAUUU

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.2
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELDBright-field microscopy
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
平均電子線量: 2.2 e/Å2
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.0 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 86000

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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