タイプ: XUONG-HAMLIN MULTIWIRE / 検出器: AREA DETECTOR / 日付: 1992年5月15日
放射
モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5418 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 2.8→24 Å / Num. obs: 12923 / % possible obs: 91.9 % / 冗長度: 3.4 % / Biso Wilson estimate: 35.1 Å2 / Rsym value: 0.076 / Net I/σ(I): 7.5
反射 シェル
解像度: 2.8→3.02 Å / 冗長度: 1.99 % / Mean I/σ(I) obs: 1 / Rsym value: 0.288 / % possible all: 82.8
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
UCSD-system
データ収集
UCSD-system
データ削減
MERLOT
位相決定
X-PLOR
モデル構築
X-PLOR
3.851
精密化
UCSD-system
データスケーリング
X-PLOR
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: FAB 58.2 PORTION OF FAB 58.2/SER-LOOP PEPTIDE COMPLEX 解像度: 2.8→24 Å / Rfactor Rfree error: 0.012 / Data cutoff high absF: 10000000 / Data cutoff low absF: 0 / Isotropic thermal model: GROUP / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / 詳細: BULK SOLVENT MODEL USED
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.305
615
4.8 %
RANDOM
Rwork
0.185
-
-
-
obs
0.185
12923
91.9 %
-
原子変位パラメータ
Biso mean: 26.7 Å2
Refine analyze
Free
Obs
Luzzati coordinate error
0.46 Å
0.28 Å
Luzzati d res low
-
5 Å
Luzzati sigma a
0.58 Å
0.42 Å
精密化ステップ
サイクル: LAST / 解像度: 2.8→24 Å
タンパク質
核酸
リガンド
溶媒
全体
原子数
3485
0
0
1
3486
拘束条件
Refine-ID
タイプ
Dev ideal
X-RAY DIFFRACTION
x_bond_d
0.012
X-RAY DIFFRACTION
x_bond_d_na
X-RAY DIFFRACTION
x_bond_d_prot
X-RAY DIFFRACTION
x_angle_d
X-RAY DIFFRACTION
x_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTION
x_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTION
x_angle_deg
1.9
X-RAY DIFFRACTION
x_angle_deg_na
X-RAY DIFFRACTION
x_angle_deg_prot
X-RAY DIFFRACTION
x_dihedral_angle_d
28
X-RAY DIFFRACTION
x_dihedral_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTION
x_dihedral_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTION
x_improper_angle_d
1.6
X-RAY DIFFRACTION
x_improper_angle_d_na
X-RAY DIFFRACTION
x_improper_angle_d_prot
X-RAY DIFFRACTION
x_mcbond_it
X-RAY DIFFRACTION
x_mcangle_it
X-RAY DIFFRACTION
x_scbond_it
X-RAY DIFFRACTION
x_scangle_it
LS精密化 シェル
解像度: 2.8→3.02 Å / Rfactor Rfree error: 0.034 / Total num. of bins used: 5