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検索結果

検索 (生物種: severe acute respiratory syndrome coronavirus 2) & (データベース: EMDB)の結果1,882件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-38372:
SARS-CoV-2 Omicron BQ.1.1 Variant Spike Protein Complexed with MO11 Fab
: Ishimaru H, Nishimura M, Shigematsu H, Marini MI, Hasegawa N, Takamiya R, Iwata S, Mori Y / 手法: 単粒子

EMDB-42144:
SARS-CoV-2 Nsp15, apo-form
: Ito F, Yang H, Zhou ZH, Chen XS / 手法: 単粒子

EMDB-42145:
SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, consensus form
: Ito F, Yang H, Zhou ZH, Chen XS / 手法: 単粒子

EMDB-42146:
SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, state 1
: Ito F, Yang H, Zhou ZH, Chen XS / 手法: 単粒子

EMDB-42147:
SARS-CoV-2 Nsp15 bound to poly(A/U) RNA, state 2
: Ito F, Yang H, Zhou ZH, Chen XS / 手法: 単粒子

EMDB-38284:
XBB.1.5 spike protein in complex with BD55-1205
: Feng LL / 手法: 単粒子

EMDB-37648:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (1-up state)
: Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K / 手法: 単粒子

EMDB-37650:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-2 state)
: Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K / 手法: 単粒子

EMDB-37651:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-1 state)
: Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K / 手法: 単粒子

EMDB-37240:
SARS-CoV-2 Omicron spike in complex with 5817 Fab
: Cao L, Wang X / 手法: 単粒子

EMDB-37241:
The interface structure of Omicron RBD binding to 5817 Fab
: Cao L, Wang X / 手法: 単粒子

EMDB-35732:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 spike protein in complex with 1C4
: Sun H, Jiang Y, Zheng Q, Li S, Xia N / 手法: 単粒子

EMDB-43658:
SARS-CoV-2 S (C.37 Lambda variant) plus S309, S2L20, and S2X303 Fabs
: McCallum M, Veesler D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) / 手法: 単粒子

EMDB-43659:
SARS-CoV-2 S NTD (C.37 Lambda variant) plus S2L20 and S2X303 Fabs, local refinement
: McCallum M, Veesler D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) / 手法: 単粒子

EMDB-43660:
SARS-CoV-2 S RBD (C.37 Lambda variant) plus S309 Fab, local refinement
: McCallum M, Veesler D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID) / 手法: 単粒子

EMDB-40190:
Local map of B3SB3L in complex with two-RBD-up state I of soluble SARS-CoV-2 Spike trimer
: Liu WP, Shokr A, Mabrouk M, Aly N, Zhang J, Aschauer P, Gao HL, Selvaraj G, Elzoghby A, Chen B, Kawano T, Nasr ML / 手法: 単粒子

EMDB-37626:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein in complex with hippopotamus ACE2
: Han P, Yang RR, Li SH / 手法: 単粒子

EMDB-37629:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 prototype spike protein receptor-binding domain in complex with hippopotamus ACE2
: Han P, Yang RR, Li SH / 手法: 単粒子

EMDB-18807:
SD1-2 fab in complex with SARS-COV-2 BA.12.1 Spike Glycoprotein.
: Duyvesteyn HME, Ren J, Stuart DI / 手法: 単粒子

EMDB-18808:
SD1-3 Fab in complex with SARS-CoV-2 BA.2.12.1 Spike Glycoprotein
: Duyvesteyn HME, Ren J, Stuart DI / 手法: 単粒子

EMDB-42820:
SARS-CoV-2 5' proximal stem-loop 5 and 6 with SL5b extended
: Kretsch RC, Xu L, Zheludev IN, Zhou X, Huang R, Nye G, Li S, Zhang K, Chiu W, Das R / 手法: 単粒子

EMDB-29950:
SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-S21B10
: Patel A, Ortlund EA / 手法: 単粒子

EMDB-29975:
Overall map of SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-S21B10
: Patel A, Ortlund EA / 手法: 単粒子

EMDB-40007:
Local map of SARS-Cov2 S protein structure in complex with neutralizing monoclonal antibody 002-S21B10
: Patel A, Ortlund EA / 手法: 単粒子

EMDB-18523:
Conserved Structures and Dynamics in 5-Proximal Regions of Betacoronavirus RNA Genomes
: Moura TR, Purta E, Bernat A, Baulin E, Mukherjee S, Bujnicki JM / 手法: 単粒子

EMDB-38283:
XBB.1.5 RBD in complex with BD55-1205
: Feng LL / 手法: 単粒子

EMDB-37516:
BA.2(S375) Spike (S6P)/hACE2 complex
: Wei X, Zhang Z / 手法: 単粒子

EMDB-37517:
Local refinement of RBD-ACE2
: Wei X, Zhang Z / 手法: 単粒子

EMDB-34314:
SARS-CoV-2 RNA E-RTC complex with RMP-nsp9 and GMPPNP
: Yan LM, Huang YC, Ge J, Liu ZY, Gao Y, Rao ZH, Lou ZY / 手法: 単粒子

EMDB-34316:
SARS-CoV-2 E-RTC bound with MMP-nsp9 and GMPPNP
: Yan LM, Rao ZH, Lou ZY / 手法: 単粒子

EMDB-16680:
BA.4/5-5 FAB IN COMPLEX WITH SARS-COV-2 BA.4 SPIKE GLYCOPROTEIN
: Duyvesteyn HME, Ren J, Stuart DI, Fry EE / 手法: 単粒子

EMDB-29805:
SARS-CoV-2 spike/Nb3 complex with 1 RBD up and 2 Nb3 (local refinement)
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29803:
Local refinement of SARS-CoV-2 spike/nanobody mixture complex around RBD
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-16676:
Delta-RBD complex with BA.2-07 fab, SARS1-34 fab and C1 nanobody
: Duyvesteyn HME, Ren J, Stuart DI, Fry EE / 手法: 単粒子

EMDB-38650:
Additional map for SARS-CoV-2 Spike D614G variant, one RBD-up conformation 1 (PDB ID: 7EAZ; EMD-31047). Map was generated from heterogeneous refinement with downsampling in CryoSPARC
: Yang TJ, Yu PY, Hsu STD / 手法: 単粒子

EMDB-29793:
Spike/Nb2 complex with 1 RBD up
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29792:
SARS-CoV-2 spike/nanobody mixture complex
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29802:
Local refinement of SARS-CoV-2 spike/nanobody mixture complex around NTD
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29799:
SARS-CoV-2 spike/Nb6 complex
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29804:
SARS-CoV-2 spike/Nb3 complex with 2 RBDs up and 3 Nb3 (local refinement)
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29798:
SARS-CoV-2 spike/Nb5 complex
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-29806:
local refinement of SARS-CoV-2 spike/Nb4 complex with 2 RBDs up and 3 Nb4 bound
: Ye G, Bu F, Liu B, Li F / 手法: 単粒子

EMDB-43320:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein
: Zhu X, Mannar D, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Tuttle K, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

EMDB-43321:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with mouse ACE2 (conformation 2)
: Zhu X, Mannar D, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Tuttle K, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

EMDB-43322:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with mouse ACE2 (conformation 1)
: Zhu X, Mannar D, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Tuttle K, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

EMDB-43323:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with mouse ACE2 (focused refinement of RBD and mouse ACE2)
: Zhu X, Mannar D, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Tuttle K, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

EMDB-43324:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with human ACE2
: Zhu X, Mannar D, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Tuttle K, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

EMDB-43325:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike protein in complex with human ACE2 (focused refinement of RBD and ACE2)
: Zhu X, Mannar D, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Tuttle K, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

EMDB-43326:
Negative Stain EM Reconstructions of SARS-CoV-2 spike proteins mixed with polyclonal antibodies from donor 4.
: Mannar D, Zhu X, Saville J, Poloni C, Bezeruk A, Tidey K, Ahmed S, Vahdatihassani F, Cholak S, Cook L, Steiner TS, Subramaniam S / 手法: 単粒子

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は? / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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