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検索結果

検索 (著者・登録者: okazaki & o)の結果69件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-39941:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in an interrogation state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-39942:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in an interrogation state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-39944:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in a translocation state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-39954:
Cryo-EM structure of eSaCas9_NNG-guide RNA-target DNA complex in a catalytically active state
手法: 単粒子 / : Omura SN, Nakagawa R, Yamashita K, Nishimasu H, Nureki O

EMDB-64064:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, in the absence of Na+, middle state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9ud8:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, in the absence of Na+, middle state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-63872:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrC-T225Y mutant from Vibrio cholerae
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J

EMDB-64059:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrC-T225Y mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J

EMDB-64060:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-T236Y mutant from Vibrio cholerae
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64061:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-T236Y mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64062:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound korormicin A
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64063:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, in the absence of Na+, upper state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64065:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, in the absence of Na+, down state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64066:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-G141A mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound korormicin A, stable state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64068:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-G141A mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound korormicin A, shifted state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64069:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound aurachin D-42
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-64518:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9u5g:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrC-T225Y mutant from Vibrio cholerae
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J

PDB-9ud2:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrC-T225Y mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J

PDB-9ud3:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-T236Y mutant from Vibrio cholerae
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9ud4:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-T236Y mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9ud5:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound korormicin A
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9ud6:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, in the absence of Na+, upper state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9ud9:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, in the absence of Na+, down state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9uda:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-G141A mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound korormicin A, stable state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9udf:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase NqrB-G141A mutant from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound korormicin A, shifted state
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9udg:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH, with bound aurachin D-42
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

PDB-9uuu:
Cryo-EM structure of Na+-translocating NADH-ubiquinone oxidoreductase from Vibrio cholerae reduced by NADH
手法: 単粒子 / : Ishikawa-Fukuda M, Kishikawa J, Kato T, Murai M

EMDB-37486:
Cryo-EM structure of the PspCas13b-crRNA complex
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

EMDB-37487:
Cryo-EM structure of the PspCas13b-crRNA-target RNA complex (State 1)
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

EMDB-37488:
Cryo-EM structure of the PspCas13b-crRNA-target RNA complex (State 2)
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

EMDB-37489:
Cryo-EM structure of the dPspCas13b-ADAR2-crRNA-target RNA complex
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

PDB-8wf8:
Cryo-EM structure of the PspCas13b-crRNA complex
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

PDB-8wf9:
Cryo-EM structure of the PspCas13b-crRNA-target RNA complex (State 1)
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

PDB-8wfa:
Cryo-EM structure of the PspCas13b-crRNA-target RNA complex (State 2)
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

PDB-8wfb:
Cryo-EM structure of the dPspCas13b-ADAR2-crRNA-target RNA complex
手法: 単粒子 / : Ishikawa J, Kato K, Yamashita K, Nishizawa T, Nishimasu H

EMDB-39644:
The isolated Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Nishida Y, Nakano A, Yokoyama K

EMDB-39661:
Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus state1
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Nishida Y, Nakano A, Yokoyama K

EMDB-39662:
Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus state2
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Nishida Y, Nakano A, Yokoyama K

EMDB-39663:
Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus state3
手法: 単粒子 / : Nishida Y, Kishikawa J, Nakano A, Yokoyama K

PDB-8ywt:
The isolated Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Nishida Y, Nakano A, Yokoyama K

PDB-8yxz:
Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus state1
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Nishida Y, Nakano A, Yokoyama K

PDB-8yy0:
Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus state2
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Nishida Y, Nakano A, Yokoyama K

PDB-8yy1:
Vo domain of V/A-ATPase from Thermus thermophilus state3
手法: 単粒子 / : Nishida Y, Kishikawa J, Nakano A, Yokoyama K

EMDB-60274:
SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein trimer in complex with antigen-binding fragments (Fabs)
手法: 単粒子 / : Sugita Y, Kimura K, Noda T, Hashiguchi T

EMDB-37827:
Cryo-EM structure of the IS621 recombinase in complex with bridge RNA, donor DNA, and target DNA in the pre-strand exchange state
手法: 単粒子 / : Hiraizumi M, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-37828:
Cryo-EM structure of the IS621 recombinase in complex with bridge RNA, donor DNA, and target DNA in the pre-strand exchange locked state
手法: 単粒子 / : Hiraizumi M, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-37829:
Cryo-EM structure of the IS621 recombinase in complex with bridge RNA, donor DNA, and target DNA in the post-strand exchange state (Holliday junction intermediate)
手法: 単粒子 / : Hiraizumi M, Yamashita K, Nishimasu H

EMDB-37830:
Cryo-EM structure of the IS621 recombinase in complex with bridge RNA, donor DNA, and target DNA in the post-strand exchange state (Holliday junction resolution)
手法: 単粒子 / : Hiraizumi M, Yamashita K, Nishimasu H

PDB-8wt6:
Cryo-EM structure of the IS621 recombinase in complex with bridge RNA, donor DNA, and target DNA in the pre-strand exchange state
手法: 単粒子 / : Hiraizumi M, Yamashita K, Nishimasu H

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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