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検索結果

検索 (著者・登録者: jia-bin & l)の結果全38件を表示しています

EMDB-60781:
cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Deng ZH, Liu L

PDB-9ipu:
cryo-EM structure of the RNF168(1-193)/UbcH5c-Ub ubiquitylation module bound to H1.0-K63-Ub3 modified chromatosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Deng ZH, Liu L

EMDB-39800:
cryo-EM map of RNF168(1-193) in complex with Ubc5c-Ub conjugated nucleosome at a resolution of 3.23 angstrom
手法: 単粒子 / : Ai HS, Tong ZB, Deng ZH, Tian CL, Liu L, Pan M

EMDB-60066:
Cryo-EM structures of RNF168/UbcH5c-Ub in complex with H2AK13Ub nucleosomes (two Ub conformation)
手法: 単粒子 / : Ai HS, Tong ZB, Deng ZH, Tian CL, Liu L, Pan M

EMDB-37249:
Cryo-EM structure of EBV gH/gL-gp42 in complex with fab 2C1
手法: 単粒子 / : Fang XY, Zhao GX, Zeng MS, Liu Z

PDB-8khr:
Cryo-EM structure of EBV gH/gL-gp42 in complex with fab 2C1
手法: 単粒子 / : Fang XY, Zhao GX, Zeng MS, Liu Z

EMDB-37503:
Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, He ZZ, Deng ZH, Liu L

PDB-8wg5:
Cryo-EM structure of USP16 bound to H2AK119Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, He ZZ, Deng ZH, Liu L

EMDB-34954:
Cryo-EM structure of SSX1 bound to the H2AK119Ub nucleosome at a resolution of 3.05 angstrom
手法: 単粒子 / : Zebin T, Ai HS, Ziyu X, GuoChao C, Man P, Liu L

EMDB-36747:
Cryo-EM structure of 2 SSX1 bound to H2AK119Ub nucleosome at a resolution of 3.6 angstroms (2:1 complex)
手法: 単粒子 / : Zebin T, Ai HS, Ziyu X, GuoChao C, Man P, Liu L

PDB-8hqy:
Cryo-EM structure of SSX1 bound to the H2AK119Ub nucleosome at a resolution of 3.05 angstrom
手法: 単粒子 / : Zebin T, Ai HS, Ziyu X, GuoChao C, Man P, Liu L

EMDB-34956:
Cryo-EM structure of SSX1 bound to the unmodified nucleosome at a resolution of 3.02 angstrom
手法: 単粒子 / : Zebin T, Ai HS, Ziyu X, Man P, Liu L

EMDB-34957:
Cryo-EM structure of H2AK119Ub nucleosome at a resolution of 6.11 angstrom
手法: 単粒子 / : Zebin T, Ai HS, Ziyu X, Man P, Liu L

PDB-8hr1:
Cryo-EM structure of SSX1 bound to the unmodified nucleosome at a resolution of 3.02 angstrom
手法: 単粒子 / : Zebin T, Ai HS, Ziyu X, Man P, Liu L

EMDB-35379:
Bre1(FL)-Rad6-nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Ai H, Deng Z, Pan M, Liu L

EMDB-35381:
Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Ai H, Deng Z, Pan M, Liu L

EMDB-35383:
RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Ai H, Deng Z, Sun M, Du Y, Pan M, Liu L

PDB-8ieg:
Bre1(mRBD-RING)/Rad6-Ub/nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Ai H, Deng Z, Pan M, Liu L

PDB-8iej:
RNF20-RNF40/hRad6A-Ub/nucleosome complex
手法: 単粒子 / : Ai H, Deng Z, Sun M, Du Y, Pan M, Liu L

EMDB-34206:
Cryo-EM structure of PRC1 bound to unmodified nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Zebin T, Zhiheng D, Jiakun T, Liying Z, Jia-Bin L, Man P, Liu L

EMDB-34207:
Cryo-EM structure of PRC1 bound to H2AK119-UbcH5b-Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Zebin T, Zhihend D, Jiakun T, Liying Z, Jia-Bin L, Man P, Liu L

EMDB-34208:
Cryo-EM structure of H2AK119-UbcH5b-Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Zebing T, Zhiheng D, Jiakun T, Liying Z, Jia-Bin L, Man P, Liu L

EMDB-34212:
Cryo-EM structure of BRCA1/BARD1 bound to H2AK127-UbcH5c-Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Zebin T, Zhiheng D, Jiakun T, Liying Z, Jia-Bin L, Man P, Liu L

PDB-8grm:
Cryo-EM structure of PRC1 bound to H2AK119-UbcH5b-Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Zebin T, Zhihend D, Jiakun T, Liying Z, Jia-Bin L, Man P, Liu L

PDB-8grq:
Cryo-EM structure of BRCA1/BARD1 bound to H2AK127-UbcH5c-Ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Zebin T, Zhiheng D, Jiakun T, Liying Z, Jia-Bin L, Man P, Liu L

EMDB-34028:
cryo-EM structure of gammaH2AXK15ub-H4K20me2 nucleosome bound to 53BP1
手法: 単粒子 / : Ai HS, GuoChao C, Qingyue G, Ze-Bin T, Zhiheng D, Xin L, Fan Y, Ziyu X, Jia-Bin L, Changlin T, Liu L

PDB-7yqk:
cryo-EM structure of gammaH2AXK15ub-H4K20me2 nucleosome bound to 53BP1
手法: 単粒子 / : Ai HS, GuoChao C, Qingyue G, Ze-Bin T, Zhiheng D, Xin L, Fan Y, Ziyu X, Jia-Bin L, Changlin T, Liu L

EMDB-33126:
Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 1:1 complex
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

EMDB-33127:
Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 2:1 complex
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

EMDB-33128:
cryo-EM map of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome complex containing addition map (1:1)
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

EMDB-33131:
cryo-EM structure of H2BK34ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

EMDB-33132:
cryo-EM structure of unmodified nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

EMDB-33139:
cryo-EM map of Dot1L and H3K79Nle nucleosome complex (active state)
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

EMDB-33141:
cryo-EM map of Dot1L and H3K79Nle nucleosome complex (inactive state)
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

PDB-7xcr:
Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 1:1 complex
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

PDB-7xct:
Cryo-EM structure of Dot1L and H2BK34ub-H3K79Nle nucleosome 2:1 complex
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

PDB-7xd0:
cryo-EM structure of H2BK34ub nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

PDB-7xd1:
cryo-EM structure of unmodified nucleosome
手法: 単粒子 / : Ai HS, Liu AJ, Lou ZY, Liu L

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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